Protein–RNA interactions for Protein: F8VRH5

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 84 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F8VRH5 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
F8VRH5 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
F8VRH5 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
F8VRH5 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
F8VRH5 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
F8VRH5 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
F8VRH5 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
F8VRH5 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
F8VRH5 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
F8VRH5 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
F8VRH5 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
F8VRH5 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
F8VRH5 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
F8VRH5 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
F8VRH5 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
F8VRH5 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
F8VRH5 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
F8VRH5 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
F8VRH5 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
F8VRH5 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
F8VRH5 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
F8VRH5 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
F8VRH5 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
F8VRH5 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
F8VRH5 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
F8VRH5 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
F8VRH5 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
F8VRH5 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
F8VRH5 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
F8VRH5 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
F8VRH5 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
F8VRH5 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
F8VRH5 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
F8VRH5 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
F8VRH5 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
F8VRH5 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
F8VRH5 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
F8VRH5 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
F8VRH5 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
F8VRH5 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
F8VRH5 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
F8VRH5 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
F8VRH5 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
F8VRH5 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
F8VRH5 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
F8VRH5 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
F8VRH5 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
F8VRH5 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
F8VRH5 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
F8VRH5 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
F8VRH5 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
F8VRH5 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
F8VRH5 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
F8VRH5 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
F8VRH5 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
F8VRH5 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
F8VRH5 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
F8VRH5 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
F8VRH5 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
F8VRH5 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
F8VRH5 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
F8VRH5 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
F8VRH5 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
F8VRH5 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
F8VRH5 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
F8VRH5 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
F8VRH5 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
F8VRH5 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
F8VRH5 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
F8VRH5 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
F8VRH5 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
F8VRH5 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
F8VRH5 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
F8VRH5 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
F8VRH5 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
F8VRH5 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
F8VRH5 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
F8VRH5 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
F8VRH5 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
F8VRH5 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
F8VRH5 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
F8VRH5 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
F8VRH5 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
F8VRH5 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
F8VRH5 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
F8VRH5 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
F8VRH5 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
F8VRH5 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
F8VRH5 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
F8VRH5 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
F8VRH5 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
F8VRH5 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
F8VRH5 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
F8VRH5 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
F8VRH5 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
F8VRH5 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
F8VRH5 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
F8VRH5 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
F8VRH5 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
F8VRH5 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms