Protein–RNA interactions for Protein: E9PQ18

Putative short transient receptor potential channel 2-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PQ18 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
E9PQ18 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
E9PQ18 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
E9PQ18 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
E9PQ18 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
E9PQ18 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
E9PQ18 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
E9PQ18 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
E9PQ18 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
E9PQ18 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
E9PQ18 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
E9PQ18 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
E9PQ18 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
E9PQ18 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
E9PQ18 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
E9PQ18 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
E9PQ18 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
E9PQ18 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
E9PQ18 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
E9PQ18 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
E9PQ18 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
E9PQ18 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
E9PQ18 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
E9PQ18 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
E9PQ18 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
E9PQ18 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
E9PQ18 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
E9PQ18 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
E9PQ18 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
E9PQ18 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
E9PQ18 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
E9PQ18 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
E9PQ18 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
E9PQ18 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
E9PQ18 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
E9PQ18 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
E9PQ18 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
E9PQ18 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
E9PQ18 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
E9PQ18 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
E9PQ18 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
E9PQ18 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
E9PQ18 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
E9PQ18 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
E9PQ18 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
E9PQ18 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
E9PQ18 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
E9PQ18 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
E9PQ18 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
E9PQ18 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
E9PQ18 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
E9PQ18 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
E9PQ18 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
E9PQ18 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
E9PQ18 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
E9PQ18 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
E9PQ18 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
E9PQ18 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
E9PQ18 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
E9PQ18 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
E9PQ18 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
E9PQ18 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
E9PQ18 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
E9PQ18 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
E9PQ18 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
E9PQ18 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
E9PQ18 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
E9PQ18 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
E9PQ18 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
E9PQ18 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
E9PQ18 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
E9PQ18 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
E9PQ18 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
E9PQ18 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
E9PQ18 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
E9PQ18 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
E9PQ18 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
E9PQ18 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
E9PQ18 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
E9PQ18 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
E9PQ18 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
E9PQ18 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
E9PQ18 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
E9PQ18 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
E9PQ18 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
E9PQ18 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
E9PQ18 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
E9PQ18 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
E9PQ18 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
E9PQ18 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
E9PQ18 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
E9PQ18 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
E9PQ18 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
E9PQ18 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
E9PQ18 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
E9PQ18 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
E9PQ18 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
E9PQ18 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
E9PQ18 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
E9PQ18 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms