Protein–RNA interactions for Protein: B3EWG5

FAM25C, Protein FAM25C, humanhuman

Predictions only

Length 89 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM25CB3EWG5 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FAM25CB3EWG5 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FAM25CB3EWG5 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FAM25CB3EWG5 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FAM25CB3EWG5 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FAM25CB3EWG5 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FAM25CB3EWG5 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
FAM25CB3EWG5 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
FAM25CB3EWG5 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
FAM25CB3EWG5 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FAM25CB3EWG5 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FAM25CB3EWG5 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FAM25CB3EWG5 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FAM25CB3EWG5 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FAM25CB3EWG5 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FAM25CB3EWG5 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FAM25CB3EWG5 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FAM25CB3EWG5 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FAM25CB3EWG5 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
FAM25CB3EWG5 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FAM25CB3EWG5 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FAM25CB3EWG5 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
FAM25CB3EWG5 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FAM25CB3EWG5 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FAM25CB3EWG5 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FAM25CB3EWG5 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FAM25CB3EWG5 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FAM25CB3EWG5 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FAM25CB3EWG5 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FAM25CB3EWG5 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FAM25CB3EWG5 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FAM25CB3EWG5 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FAM25CB3EWG5 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FAM25CB3EWG5 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FAM25CB3EWG5 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FAM25CB3EWG5 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FAM25CB3EWG5 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FAM25CB3EWG5 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FAM25CB3EWG5 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FAM25CB3EWG5 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
FAM25CB3EWG5 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FAM25CB3EWG5 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FAM25CB3EWG5 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FAM25CB3EWG5 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FAM25CB3EWG5 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FAM25CB3EWG5 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FAM25CB3EWG5 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FAM25CB3EWG5 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FAM25CB3EWG5 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FAM25CB3EWG5 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FAM25CB3EWG5 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FAM25CB3EWG5 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FAM25CB3EWG5 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FAM25CB3EWG5 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FAM25CB3EWG5 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FAM25CB3EWG5 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FAM25CB3EWG5 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FAM25CB3EWG5 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FAM25CB3EWG5 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FAM25CB3EWG5 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FAM25CB3EWG5 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FAM25CB3EWG5 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FAM25CB3EWG5 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FAM25CB3EWG5 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FAM25CB3EWG5 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FAM25CB3EWG5 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FAM25CB3EWG5 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FAM25CB3EWG5 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FAM25CB3EWG5 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FAM25CB3EWG5 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FAM25CB3EWG5 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FAM25CB3EWG5 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FAM25CB3EWG5 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FAM25CB3EWG5 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FAM25CB3EWG5 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FAM25CB3EWG5 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FAM25CB3EWG5 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FAM25CB3EWG5 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FAM25CB3EWG5 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FAM25CB3EWG5 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FAM25CB3EWG5 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FAM25CB3EWG5 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FAM25CB3EWG5 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FAM25CB3EWG5 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FAM25CB3EWG5 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FAM25CB3EWG5 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FAM25CB3EWG5 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FAM25CB3EWG5 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
FAM25CB3EWG5 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
FAM25CB3EWG5 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FAM25CB3EWG5 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FAM25CB3EWG5 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FAM25CB3EWG5 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FAM25CB3EWG5 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FAM25CB3EWG5 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FAM25CB3EWG5 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FAM25CB3EWG5 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FAM25CB3EWG5 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FAM25CB3EWG5 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FAM25CB3EWG5 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.2 ms