Protein–RNA interactions for Protein: B3EWG3

FAM25A, Protein FAM25A, humanhuman

Predictions only

Length 89 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM25AB3EWG3 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FAM25AB3EWG3 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FAM25AB3EWG3 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FAM25AB3EWG3 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FAM25AB3EWG3 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FAM25AB3EWG3 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FAM25AB3EWG3 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
FAM25AB3EWG3 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
FAM25AB3EWG3 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
FAM25AB3EWG3 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FAM25AB3EWG3 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FAM25AB3EWG3 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FAM25AB3EWG3 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FAM25AB3EWG3 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FAM25AB3EWG3 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FAM25AB3EWG3 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FAM25AB3EWG3 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FAM25AB3EWG3 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FAM25AB3EWG3 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
FAM25AB3EWG3 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FAM25AB3EWG3 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FAM25AB3EWG3 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
FAM25AB3EWG3 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FAM25AB3EWG3 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FAM25AB3EWG3 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FAM25AB3EWG3 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FAM25AB3EWG3 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FAM25AB3EWG3 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FAM25AB3EWG3 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FAM25AB3EWG3 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FAM25AB3EWG3 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FAM25AB3EWG3 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FAM25AB3EWG3 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FAM25AB3EWG3 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FAM25AB3EWG3 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FAM25AB3EWG3 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FAM25AB3EWG3 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FAM25AB3EWG3 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FAM25AB3EWG3 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FAM25AB3EWG3 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
FAM25AB3EWG3 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FAM25AB3EWG3 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FAM25AB3EWG3 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FAM25AB3EWG3 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FAM25AB3EWG3 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FAM25AB3EWG3 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FAM25AB3EWG3 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FAM25AB3EWG3 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FAM25AB3EWG3 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FAM25AB3EWG3 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FAM25AB3EWG3 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FAM25AB3EWG3 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FAM25AB3EWG3 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FAM25AB3EWG3 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FAM25AB3EWG3 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FAM25AB3EWG3 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FAM25AB3EWG3 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FAM25AB3EWG3 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FAM25AB3EWG3 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FAM25AB3EWG3 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FAM25AB3EWG3 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FAM25AB3EWG3 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FAM25AB3EWG3 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FAM25AB3EWG3 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FAM25AB3EWG3 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FAM25AB3EWG3 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FAM25AB3EWG3 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FAM25AB3EWG3 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FAM25AB3EWG3 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FAM25AB3EWG3 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FAM25AB3EWG3 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FAM25AB3EWG3 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FAM25AB3EWG3 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FAM25AB3EWG3 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FAM25AB3EWG3 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FAM25AB3EWG3 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FAM25AB3EWG3 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FAM25AB3EWG3 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FAM25AB3EWG3 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FAM25AB3EWG3 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FAM25AB3EWG3 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FAM25AB3EWG3 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FAM25AB3EWG3 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FAM25AB3EWG3 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FAM25AB3EWG3 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FAM25AB3EWG3 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FAM25AB3EWG3 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FAM25AB3EWG3 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
FAM25AB3EWG3 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
FAM25AB3EWG3 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FAM25AB3EWG3 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FAM25AB3EWG3 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FAM25AB3EWG3 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FAM25AB3EWG3 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FAM25AB3EWG3 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FAM25AB3EWG3 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FAM25AB3EWG3 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FAM25AB3EWG3 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FAM25AB3EWG3 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FAM25AB3EWG3 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms