Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
HMGB1P1B2RPK0 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
HMGB1P1B2RPK0 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
HMGB1P1B2RPK0 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
HMGB1P1B2RPK0 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
HMGB1P1B2RPK0 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
HMGB1P1B2RPK0 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
HMGB1P1B2RPK0 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
HMGB1P1B2RPK0 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
HMGB1P1B2RPK0 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
HMGB1P1B2RPK0 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
HMGB1P1B2RPK0 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
HMGB1P1B2RPK0 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
HMGB1P1B2RPK0 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
HMGB1P1B2RPK0 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
HMGB1P1B2RPK0 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
HMGB1P1B2RPK0 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
HMGB1P1B2RPK0 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
HMGB1P1B2RPK0 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
HMGB1P1B2RPK0 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
HMGB1P1B2RPK0 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
HMGB1P1B2RPK0 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
HMGB1P1B2RPK0 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
HMGB1P1B2RPK0 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
HMGB1P1B2RPK0 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
HMGB1P1B2RPK0 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
HMGB1P1B2RPK0 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
HMGB1P1B2RPK0 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
HMGB1P1B2RPK0 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
HMGB1P1B2RPK0 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
HMGB1P1B2RPK0 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
HMGB1P1B2RPK0 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
HMGB1P1B2RPK0 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
HMGB1P1B2RPK0 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
HMGB1P1B2RPK0 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
HMGB1P1B2RPK0 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
HMGB1P1B2RPK0 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
HMGB1P1B2RPK0 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
HMGB1P1B2RPK0 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
HMGB1P1B2RPK0 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
HMGB1P1B2RPK0 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
HMGB1P1B2RPK0 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
HMGB1P1B2RPK0 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
HMGB1P1B2RPK0 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
HMGB1P1B2RPK0 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
HMGB1P1B2RPK0 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
HMGB1P1B2RPK0 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
HMGB1P1B2RPK0 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
HMGB1P1B2RPK0 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
HMGB1P1B2RPK0 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
HMGB1P1B2RPK0 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
HMGB1P1B2RPK0 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
HMGB1P1B2RPK0 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
HMGB1P1B2RPK0 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
HMGB1P1B2RPK0 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
HMGB1P1B2RPK0 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
HMGB1P1B2RPK0 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
HMGB1P1B2RPK0 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
HMGB1P1B2RPK0 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
HMGB1P1B2RPK0 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
HMGB1P1B2RPK0 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
HMGB1P1B2RPK0 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
HMGB1P1B2RPK0 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
HMGB1P1B2RPK0 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
HMGB1P1B2RPK0 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
HMGB1P1B2RPK0 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
HMGB1P1B2RPK0 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
HMGB1P1B2RPK0 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
HMGB1P1B2RPK0 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
HMGB1P1B2RPK0 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
HMGB1P1B2RPK0 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
HMGB1P1B2RPK0 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
HMGB1P1B2RPK0 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
HMGB1P1B2RPK0 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
HMGB1P1B2RPK0 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
HMGB1P1B2RPK0 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
HMGB1P1B2RPK0 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
HMGB1P1B2RPK0 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
HMGB1P1B2RPK0 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
HMGB1P1B2RPK0 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
HMGB1P1B2RPK0 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
HMGB1P1B2RPK0 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
HMGB1P1B2RPK0 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
HMGB1P1B2RPK0 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
HMGB1P1B2RPK0 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
HMGB1P1B2RPK0 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
HMGB1P1B2RPK0 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
HMGB1P1B2RPK0 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
HMGB1P1B2RPK0 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
HMGB1P1B2RPK0 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
HMGB1P1B2RPK0 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
HMGB1P1B2RPK0 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
HMGB1P1B2RPK0 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
HMGB1P1B2RPK0 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
HMGB1P1B2RPK0 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
HMGB1P1B2RPK0 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
HMGB1P1B2RPK0 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
HMGB1P1B2RPK0 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
HMGB1P1B2RPK0 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
HMGB1P1B2RPK0 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.5 ms