Protein–RNA interactions for Protein: A6NM36

LRRC30, Leucine-rich repeat-containing protein 30, humanhuman

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Length 301 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC30A6NM36 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRC30A6NM36 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRC30A6NM36 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRC30A6NM36 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRC30A6NM36 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRC30A6NM36 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LRRC30A6NM36 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
LRRC30A6NM36 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRRC30A6NM36 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRRC30A6NM36 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRRC30A6NM36 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRRC30A6NM36 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRRC30A6NM36 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRRC30A6NM36 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
LRRC30A6NM36 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
LRRC30A6NM36 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LRRC30A6NM36 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LRRC30A6NM36 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LRRC30A6NM36 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LRRC30A6NM36 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LRRC30A6NM36 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LRRC30A6NM36 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRRC30A6NM36 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
LRRC30A6NM36 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRRC30A6NM36 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRRC30A6NM36 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRRC30A6NM36 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRRC30A6NM36 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRRC30A6NM36 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRRC30A6NM36 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRRC30A6NM36 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRC30A6NM36 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRC30A6NM36 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRC30A6NM36 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRC30A6NM36 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRC30A6NM36 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRRC30A6NM36 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRRC30A6NM36 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRC30A6NM36 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRC30A6NM36 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRC30A6NM36 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRC30A6NM36 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRC30A6NM36 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
LRRC30A6NM36 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRRC30A6NM36 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRRC30A6NM36 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRRC30A6NM36 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRRC30A6NM36 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRRC30A6NM36 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRC30A6NM36 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRC30A6NM36 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRC30A6NM36 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRC30A6NM36 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRC30A6NM36 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRC30A6NM36 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRC30A6NM36 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRC30A6NM36 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRC30A6NM36 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRC30A6NM36 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRC30A6NM36 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRC30A6NM36 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRC30A6NM36 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRC30A6NM36 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRC30A6NM36 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRC30A6NM36 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRC30A6NM36 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRC30A6NM36 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRRC30A6NM36 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRC30A6NM36 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRC30A6NM36 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRC30A6NM36 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRC30A6NM36 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRC30A6NM36 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRC30A6NM36 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRC30A6NM36 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRC30A6NM36 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRC30A6NM36 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRC30A6NM36 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRC30A6NM36 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRC30A6NM36 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRC30A6NM36 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRC30A6NM36 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRC30A6NM36 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRC30A6NM36 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRC30A6NM36 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRC30A6NM36 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRC30A6NM36 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRC30A6NM36 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRC30A6NM36 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRC30A6NM36 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRC30A6NM36 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
LRRC30A6NM36 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRC30A6NM36 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRC30A6NM36 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRC30A6NM36 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRC30A6NM36 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRC30A6NM36 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRC30A6NM36 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRC30A6NM36 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRC30A6NM36 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
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