Protein–RNA interactions for Protein: A6NFX1

MFSD2B, Major facilitator superfamily domain-containing protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 497 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFSD2BA6NFX1 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MFSD2BA6NFX1 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MFSD2BA6NFX1 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MFSD2BA6NFX1 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MFSD2BA6NFX1 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MFSD2BA6NFX1 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MFSD2BA6NFX1 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MFSD2BA6NFX1 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MFSD2BA6NFX1 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MFSD2BA6NFX1 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MFSD2BA6NFX1 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MFSD2BA6NFX1 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MFSD2BA6NFX1 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MFSD2BA6NFX1 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MFSD2BA6NFX1 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MFSD2BA6NFX1 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MFSD2BA6NFX1 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MFSD2BA6NFX1 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MFSD2BA6NFX1 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MFSD2BA6NFX1 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MFSD2BA6NFX1 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MFSD2BA6NFX1 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MFSD2BA6NFX1 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MFSD2BA6NFX1 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MFSD2BA6NFX1 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MFSD2BA6NFX1 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
MFSD2BA6NFX1 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MFSD2BA6NFX1 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MFSD2BA6NFX1 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MFSD2BA6NFX1 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MFSD2BA6NFX1 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MFSD2BA6NFX1 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MFSD2BA6NFX1 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MFSD2BA6NFX1 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MFSD2BA6NFX1 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
MFSD2BA6NFX1 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MFSD2BA6NFX1 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MFSD2BA6NFX1 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MFSD2BA6NFX1 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
MFSD2BA6NFX1 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MFSD2BA6NFX1 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MFSD2BA6NFX1 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MFSD2BA6NFX1 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MFSD2BA6NFX1 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MFSD2BA6NFX1 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MFSD2BA6NFX1 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MFSD2BA6NFX1 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MFSD2BA6NFX1 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MFSD2BA6NFX1 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MFSD2BA6NFX1 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MFSD2BA6NFX1 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MFSD2BA6NFX1 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MFSD2BA6NFX1 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MFSD2BA6NFX1 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MFSD2BA6NFX1 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MFSD2BA6NFX1 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MFSD2BA6NFX1 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MFSD2BA6NFX1 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MFSD2BA6NFX1 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MFSD2BA6NFX1 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MFSD2BA6NFX1 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MFSD2BA6NFX1 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MFSD2BA6NFX1 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MFSD2BA6NFX1 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MFSD2BA6NFX1 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MFSD2BA6NFX1 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MFSD2BA6NFX1 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MFSD2BA6NFX1 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MFSD2BA6NFX1 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MFSD2BA6NFX1 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
MFSD2BA6NFX1 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MFSD2BA6NFX1 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MFSD2BA6NFX1 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MFSD2BA6NFX1 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MFSD2BA6NFX1 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MFSD2BA6NFX1 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MFSD2BA6NFX1 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MFSD2BA6NFX1 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MFSD2BA6NFX1 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MFSD2BA6NFX1 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MFSD2BA6NFX1 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MFSD2BA6NFX1 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MFSD2BA6NFX1 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MFSD2BA6NFX1 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
MFSD2BA6NFX1 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MFSD2BA6NFX1 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MFSD2BA6NFX1 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MFSD2BA6NFX1 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MFSD2BA6NFX1 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MFSD2BA6NFX1 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MFSD2BA6NFX1 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
MFSD2BA6NFX1 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MFSD2BA6NFX1 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MFSD2BA6NFX1 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MFSD2BA6NFX1 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MFSD2BA6NFX1 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MFSD2BA6NFX1 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MFSD2BA6NFX1 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MFSD2BA6NFX1 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MFSD2BA6NFX1 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms