Protein–RNA interactions for Protein: A6NFE3

EFCAB10, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 10, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFCAB10A6NFE3 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EFCAB10A6NFE3 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EFCAB10A6NFE3 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EFCAB10A6NFE3 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EFCAB10A6NFE3 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EFCAB10A6NFE3 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
EFCAB10A6NFE3 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
EFCAB10A6NFE3 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EFCAB10A6NFE3 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
EFCAB10A6NFE3 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
EFCAB10A6NFE3 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EFCAB10A6NFE3 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
EFCAB10A6NFE3 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
EFCAB10A6NFE3 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
EFCAB10A6NFE3 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EFCAB10A6NFE3 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EFCAB10A6NFE3 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
EFCAB10A6NFE3 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
EFCAB10A6NFE3 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
EFCAB10A6NFE3 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
EFCAB10A6NFE3 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
EFCAB10A6NFE3 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
EFCAB10A6NFE3 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
EFCAB10A6NFE3 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
EFCAB10A6NFE3 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
EFCAB10A6NFE3 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EFCAB10A6NFE3 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EFCAB10A6NFE3 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
EFCAB10A6NFE3 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EFCAB10A6NFE3 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EFCAB10A6NFE3 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EFCAB10A6NFE3 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
EFCAB10A6NFE3 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EFCAB10A6NFE3 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
EFCAB10A6NFE3 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EFCAB10A6NFE3 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EFCAB10A6NFE3 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EFCAB10A6NFE3 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
EFCAB10A6NFE3 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EFCAB10A6NFE3 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
EFCAB10A6NFE3 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
EFCAB10A6NFE3 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
EFCAB10A6NFE3 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
EFCAB10A6NFE3 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
EFCAB10A6NFE3 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
EFCAB10A6NFE3 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
EFCAB10A6NFE3 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
EFCAB10A6NFE3 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
EFCAB10A6NFE3 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
EFCAB10A6NFE3 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EFCAB10A6NFE3 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
EFCAB10A6NFE3 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
EFCAB10A6NFE3 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
EFCAB10A6NFE3 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
EFCAB10A6NFE3 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
EFCAB10A6NFE3 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
EFCAB10A6NFE3 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
EFCAB10A6NFE3 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EFCAB10A6NFE3 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EFCAB10A6NFE3 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EFCAB10A6NFE3 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EFCAB10A6NFE3 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EFCAB10A6NFE3 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EFCAB10A6NFE3 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EFCAB10A6NFE3 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EFCAB10A6NFE3 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
EFCAB10A6NFE3 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EFCAB10A6NFE3 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
EFCAB10A6NFE3 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
EFCAB10A6NFE3 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EFCAB10A6NFE3 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
EFCAB10A6NFE3 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EFCAB10A6NFE3 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EFCAB10A6NFE3 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
EFCAB10A6NFE3 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
EFCAB10A6NFE3 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
EFCAB10A6NFE3 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
EFCAB10A6NFE3 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
EFCAB10A6NFE3 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
EFCAB10A6NFE3 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
EFCAB10A6NFE3 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
EFCAB10A6NFE3 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
EFCAB10A6NFE3 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
EFCAB10A6NFE3 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
EFCAB10A6NFE3 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
EFCAB10A6NFE3 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
EFCAB10A6NFE3 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
EFCAB10A6NFE3 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
EFCAB10A6NFE3 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
EFCAB10A6NFE3 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
EFCAB10A6NFE3 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
EFCAB10A6NFE3 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
EFCAB10A6NFE3 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
EFCAB10A6NFE3 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
EFCAB10A6NFE3 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
EFCAB10A6NFE3 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
EFCAB10A6NFE3 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
EFCAB10A6NFE3 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
EFCAB10A6NFE3 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
EFCAB10A6NFE3 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.7 ms