Protein–RNA interactions for Protein: A4D0T7

SMIM30, Small integral membrane protein 30, humanhuman

Predictions only

Length 59 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM30A4D0T7 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SMIM30A4D0T7 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SMIM30A4D0T7 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SMIM30A4D0T7 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SMIM30A4D0T7 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMIM30A4D0T7 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMIM30A4D0T7 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMIM30A4D0T7 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMIM30A4D0T7 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMIM30A4D0T7 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMIM30A4D0T7 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMIM30A4D0T7 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMIM30A4D0T7 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMIM30A4D0T7 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMIM30A4D0T7 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMIM30A4D0T7 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMIM30A4D0T7 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMIM30A4D0T7 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMIM30A4D0T7 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMIM30A4D0T7 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMIM30A4D0T7 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMIM30A4D0T7 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMIM30A4D0T7 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMIM30A4D0T7 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMIM30A4D0T7 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMIM30A4D0T7 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMIM30A4D0T7 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMIM30A4D0T7 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMIM30A4D0T7 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMIM30A4D0T7 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMIM30A4D0T7 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SMIM30A4D0T7 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMIM30A4D0T7 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SMIM30A4D0T7 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMIM30A4D0T7 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMIM30A4D0T7 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMIM30A4D0T7 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMIM30A4D0T7 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMIM30A4D0T7 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMIM30A4D0T7 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMIM30A4D0T7 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMIM30A4D0T7 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMIM30A4D0T7 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMIM30A4D0T7 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMIM30A4D0T7 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMIM30A4D0T7 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMIM30A4D0T7 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SMIM30A4D0T7 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SMIM30A4D0T7 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SMIM30A4D0T7 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMIM30A4D0T7 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMIM30A4D0T7 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMIM30A4D0T7 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMIM30A4D0T7 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMIM30A4D0T7 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMIM30A4D0T7 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMIM30A4D0T7 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMIM30A4D0T7 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMIM30A4D0T7 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMIM30A4D0T7 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMIM30A4D0T7 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMIM30A4D0T7 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMIM30A4D0T7 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMIM30A4D0T7 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMIM30A4D0T7 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMIM30A4D0T7 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMIM30A4D0T7 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMIM30A4D0T7 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SMIM30A4D0T7 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMIM30A4D0T7 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMIM30A4D0T7 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMIM30A4D0T7 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMIM30A4D0T7 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMIM30A4D0T7 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMIM30A4D0T7 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMIM30A4D0T7 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMIM30A4D0T7 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMIM30A4D0T7 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMIM30A4D0T7 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMIM30A4D0T7 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMIM30A4D0T7 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMIM30A4D0T7 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMIM30A4D0T7 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMIM30A4D0T7 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMIM30A4D0T7 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMIM30A4D0T7 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMIM30A4D0T7 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMIM30A4D0T7 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMIM30A4D0T7 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMIM30A4D0T7 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SMIM30A4D0T7 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SMIM30A4D0T7 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMIM30A4D0T7 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMIM30A4D0T7 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMIM30A4D0T7 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMIM30A4D0T7 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SMIM30A4D0T7 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMIM30A4D0T7 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMIM30A4D0T7 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMIM30A4D0T7 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms