Protein–RNA interactions for Protein: A0PJX4

SHISA3, Protein shisa-3 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHISA3A0PJX4 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SHISA3A0PJX4 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SHISA3A0PJX4 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SHISA3A0PJX4 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SHISA3A0PJX4 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SHISA3A0PJX4 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SHISA3A0PJX4 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SHISA3A0PJX4 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SHISA3A0PJX4 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SHISA3A0PJX4 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SHISA3A0PJX4 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SHISA3A0PJX4 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SHISA3A0PJX4 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SHISA3A0PJX4 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SHISA3A0PJX4 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SHISA3A0PJX4 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SHISA3A0PJX4 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SHISA3A0PJX4 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SHISA3A0PJX4 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SHISA3A0PJX4 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SHISA3A0PJX4 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SHISA3A0PJX4 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SHISA3A0PJX4 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SHISA3A0PJX4 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SHISA3A0PJX4 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SHISA3A0PJX4 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SHISA3A0PJX4 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SHISA3A0PJX4 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SHISA3A0PJX4 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SHISA3A0PJX4 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SHISA3A0PJX4 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SHISA3A0PJX4 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SHISA3A0PJX4 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SHISA3A0PJX4 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SHISA3A0PJX4 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SHISA3A0PJX4 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SHISA3A0PJX4 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SHISA3A0PJX4 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SHISA3A0PJX4 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SHISA3A0PJX4 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SHISA3A0PJX4 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SHISA3A0PJX4 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SHISA3A0PJX4 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SHISA3A0PJX4 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SHISA3A0PJX4 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SHISA3A0PJX4 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SHISA3A0PJX4 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SHISA3A0PJX4 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SHISA3A0PJX4 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SHISA3A0PJX4 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SHISA3A0PJX4 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SHISA3A0PJX4 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SHISA3A0PJX4 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SHISA3A0PJX4 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SHISA3A0PJX4 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SHISA3A0PJX4 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SHISA3A0PJX4 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SHISA3A0PJX4 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SHISA3A0PJX4 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SHISA3A0PJX4 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SHISA3A0PJX4 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SHISA3A0PJX4 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SHISA3A0PJX4 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SHISA3A0PJX4 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SHISA3A0PJX4 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SHISA3A0PJX4 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SHISA3A0PJX4 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SHISA3A0PJX4 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SHISA3A0PJX4 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SHISA3A0PJX4 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SHISA3A0PJX4 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SHISA3A0PJX4 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SHISA3A0PJX4 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SHISA3A0PJX4 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SHISA3A0PJX4 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SHISA3A0PJX4 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SHISA3A0PJX4 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SHISA3A0PJX4 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SHISA3A0PJX4 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SHISA3A0PJX4 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SHISA3A0PJX4 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SHISA3A0PJX4 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SHISA3A0PJX4 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SHISA3A0PJX4 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SHISA3A0PJX4 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SHISA3A0PJX4 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SHISA3A0PJX4 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SHISA3A0PJX4 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SHISA3A0PJX4 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SHISA3A0PJX4 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SHISA3A0PJX4 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SHISA3A0PJX4 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SHISA3A0PJX4 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SHISA3A0PJX4 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SHISA3A0PJX4 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SHISA3A0PJX4 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SHISA3A0PJX4 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SHISA3A0PJX4 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SHISA3A0PJX4 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SHISA3A0PJX4 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.2 ms