Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4S0

CCDC82, Coiled-coil domain-containing protein 82, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC82Q8N4S0 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC82Q8N4S0 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC82Q8N4S0 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC82Q8N4S0 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC82Q8N4S0 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC82Q8N4S0 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC82Q8N4S0 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC82Q8N4S0 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC82Q8N4S0 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC82Q8N4S0 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC82Q8N4S0 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC82Q8N4S0 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC82Q8N4S0 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC82Q8N4S0 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC82Q8N4S0 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC82Q8N4S0 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC82Q8N4S0 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC82Q8N4S0 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC82Q8N4S0 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC82Q8N4S0 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC82Q8N4S0 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC82Q8N4S0 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC82Q8N4S0 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC82Q8N4S0 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC82Q8N4S0 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC82Q8N4S0 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC82Q8N4S0 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC82Q8N4S0 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC82Q8N4S0 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC82Q8N4S0 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC82Q8N4S0 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC82Q8N4S0 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC82Q8N4S0 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC82Q8N4S0 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC82Q8N4S0 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC82Q8N4S0 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC82Q8N4S0 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC82Q8N4S0 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC82Q8N4S0 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC82Q8N4S0 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC82Q8N4S0 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC82Q8N4S0 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC82Q8N4S0 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC82Q8N4S0 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC82Q8N4S0 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC82Q8N4S0 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC82Q8N4S0 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC82Q8N4S0 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC82Q8N4S0 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC82Q8N4S0 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC82Q8N4S0 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC82Q8N4S0 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC82Q8N4S0 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC82Q8N4S0 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC82Q8N4S0 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC82Q8N4S0 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC82Q8N4S0 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC82Q8N4S0 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC82Q8N4S0 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC82Q8N4S0 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC82Q8N4S0 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC82Q8N4S0 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC82Q8N4S0 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC82Q8N4S0 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC82Q8N4S0 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC82Q8N4S0 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC82Q8N4S0 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC82Q8N4S0 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC82Q8N4S0 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CCDC82Q8N4S0 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CCDC82Q8N4S0 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC82Q8N4S0 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC82Q8N4S0 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC82Q8N4S0 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC82Q8N4S0 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC82Q8N4S0 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC82Q8N4S0 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC82Q8N4S0 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC82Q8N4S0 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC82Q8N4S0 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC82Q8N4S0 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC82Q8N4S0 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC82Q8N4S0 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC82Q8N4S0 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC82Q8N4S0 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC82Q8N4S0 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC82Q8N4S0 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC82Q8N4S0 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC82Q8N4S0 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC82Q8N4S0 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC82Q8N4S0 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC82Q8N4S0 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC82Q8N4S0 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC82Q8N4S0 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC82Q8N4S0 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC82Q8N4S0 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC82Q8N4S0 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC82Q8N4S0 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC82Q8N4S0 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC82Q8N4S0 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114 ms