RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000612675.4

ILKAP-211, Transcript of ILK associated serine/threonine phosphatase, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene ILKAP, Length 1,335 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ILKAP-211ENST00000612675 NISCHQ9Y2I1 1504 aa52.02■■■■■ 5.92
ILKAP-211ENST00000612675 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa46.21■■■■■ 4.99
ILKAP-211ENST00000612675 ABCC9O60706 1549 aa45.1■■■■■ 4.81
ILKAP-211ENST00000612675 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa43.44■■■■■ 4.54
ILKAP-211ENST00000612675 NACADO15069 1562 aa43.41■■■■■ 4.54
ILKAP-211ENST00000612675 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP43.39■■■■■ 4.54
ILKAP-211ENST00000612675 DCAF8L2P0C7V8 631 aa43.32■■■■■ 4.53
ILKAP-211ENST00000612675 MYO15BQ96JP2 1530 aa43.21■■■■■ 4.51
ILKAP-211ENST00000612675 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa43.07■■■■■ 4.48
ILKAP-211ENST00000612675 UNC13AQ9UPW8 1703 aa42.41■■■■■ 4.38
ILKAP-211ENST00000612675 SCRIBQ14160 1630 aa42.17■■■■■ 4.34
ILKAP-211ENST00000612675 BICRAQ9NZM4 1560 aa42.14■■■■■ 4.34
ILKAP-211ENST00000612675 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP42.13■■■■■ 4.33
ILKAP-211ENST00000612675 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa41.73■■■■■ 4.27
ILKAP-211ENST00000612675 DNAJC5BQ9UF47 199 aa41.28■■■■■ 4.2
ILKAP-211ENST00000612675 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP41.01■■■■■ 4.16
ILKAP-211ENST00000612675 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa40.81■■■■■ 4.12
ILKAP-211ENST00000612675 CECR2Q9BXF3 1484 aa40.52■■■■■ 4.08
ILKAP-211ENST00000612675 SMARCA4P51532 1647 aa40.35■■■■■ 4.05
ILKAP-211ENST00000612675 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP40.31■■■■■ 4.04
ILKAP-211ENST00000612675 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa40.1■■■■■ 4.01
ILKAP-211ENST00000612675 MROH2BQ7Z745 1585 aa40.09■■■■■ 4.01
ILKAP-211ENST00000612675 NCAPD3P42695 1498 aa40.06■■■■■ 4
ILKAP-211ENST00000612675 SMARCA2P51531 1590 aa40.05■■■■■ 4
ILKAP-211ENST00000612675 PEG3Q9GZU2 1588 aa39.97■■■■□ 3.99
ILKAP-211ENST00000612675 HMGXB3Q12766 1538 aa39.9■■■■□ 3.98
ILKAP-211ENST00000612675 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP39.78■■■■□ 3.96
ILKAP-211ENST00000612675 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP39.67■■■■□ 3.94
ILKAP-211ENST00000612675 WIZO95785 1651 aa39.64■■■■□ 3.94
ILKAP-211ENST00000612675 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP39.27■■■■□ 3.88
ILKAP-211ENST00000612675 NESP48681 1621 aa39.06■■■■□ 3.84
ILKAP-211ENST00000612675 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa38.99■■■■□ 3.83
ILKAP-211ENST00000612675 CADPSQ9ULU8 1353 aa38.89■■■■□ 3.82
ILKAP-211ENST00000612675 ERCC6Q03468 1493 aa38.86■■■■□ 3.81
ILKAP-211ENST00000612675 CCDC88BA6NC98 1476 aa38.78■■■■□ 3.8
ILKAP-211ENST00000612675 PDS5BQ9NTI5 1447 aa38.71■■■■□ 3.79
ILKAP-211ENST00000612675 CFTRP13569 1480 aa38.69■■■■□ 3.78
ILKAP-211ENST00000612675 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP38.66■■■■□ 3.78
ILKAP-211ENST00000612675 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa38.59■■■■□ 3.77
ILKAP-211ENST00000612675 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP38.48■■■■□ 3.75
ILKAP-211ENST00000612675 FANCD2Q9BXW9 1451 aa38.45■■■■□ 3.75
ILKAP-211ENST00000612675 CUX2O14529 1486 aa38.45■■■■□ 3.74
ILKAP-211ENST00000612675 CEP164Q9UPV0 1460 aa38.41■■■■□ 3.74
ILKAP-211ENST00000612675 PRDM2Q13029 1718 aa38.37■■■■□ 3.73
ILKAP-211ENST00000612675 MRC2Q9UBG0 1479 aa38.33■■■■□ 3.73
ILKAP-211ENST00000612675 WDR62O43379 1518 aa38.21■■■■□ 3.71
ILKAP-211ENST00000612675 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP38.08■■■■□ 3.69
ILKAP-211ENST00000612675 TOPBP1Q92547 1522 aa37.85■■■■□ 3.65
ILKAP-211ENST00000612675 ABCC8Q09428 1581 aa37.83■■■■□ 3.65
ILKAP-211ENST00000612675 DNMBPQ6XZF7 1577 aa37.82■■■■□ 3.64
ILKAP-211ENST00000612675 CUX1P39880 1505 aa37.62■■■■□ 3.61
ILKAP-211ENST00000612675 IFT140Q96RY7 1462 aa37.59■■■■□ 3.61
ILKAP-211ENST00000612675 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP37.55■■■■□ 3.6
ILKAP-211ENST00000612675 FGD5Q6ZNL6 1462 aa37.46■■■■□ 3.59
ILKAP-211ENST00000612675 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP37.44■■■■□ 3.58
ILKAP-211ENST00000612675 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP37.41■■■■□ 3.58
ILKAP-211ENST00000612675 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP37.39■■■■□ 3.58
ILKAP-211ENST00000612675 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa37.36■■■■□ 3.57
ILKAP-211ENST00000612675 SOGA1O94964 1423 aa37.36■■■■□ 3.57
ILKAP-211ENST00000612675 SYNJ1O43426 1573 aa37.31■■■■□ 3.56
ILKAP-211ENST00000612675 TOP2BQ02880 1626 aa37.31■■■■□ 3.56
ILKAP-211ENST00000612675 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa37.3■■■■□ 3.56
ILKAP-211ENST00000612675 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP37.29■■■■□ 3.56
ILKAP-211ENST00000612675 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP37.2■■■■□ 3.554e-7■■■■□ 24.6
ILKAP-211ENST00000612675 WDR97A6NE52 1622 aa37.16■■■■□ 3.54
ILKAP-211ENST00000612675 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP37.13■■■■□ 3.53
ILKAP-211ENST00000612675 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa37.11■■■■□ 3.53
ILKAP-211ENST00000612675 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa37.09■■■■□ 3.53
ILKAP-211ENST00000612675 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa36.97■■■■□ 3.51
ILKAP-211ENST00000612675 GAPVD1Q14C86 1478 aa36.95■■■■□ 3.51
ILKAP-211ENST00000612675 GRIN2BQ13224 1484 aa36.94■■■■□ 3.5
ILKAP-211ENST00000612675 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa36.89■■■■□ 3.5
ILKAP-211ENST00000612675 PBRM1Q86U86 1689 aa36.86■■■■□ 3.49
ILKAP-211ENST00000612675 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP36.84■■■■□ 3.49
ILKAP-211ENST00000612675 OSCARQ8IYS5 282 aa36.8■■■■□ 3.48
ILKAP-211ENST00000612675 CHD1O14646 1710 aa36.75■■■■□ 3.47
ILKAP-211ENST00000612675 SYNJ2O15056 1496 aa36.69■■■■□ 3.46
ILKAP-211ENST00000612675 FBLN2P98095 1184 aa36.68■■■■□ 3.46
ILKAP-211ENST00000612675 ERICH3Q5RHP9 1530 aa36.67■■■■□ 3.46
ILKAP-211ENST00000612675 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP36.61■■■■□ 3.45
ILKAP-211ENST00000612675 ADAMTS12P58397 1594 aa36.61■■■■□ 3.45
ILKAP-211ENST00000612675 KIF27Q86VH2 1401 aa36.6■■■■□ 3.45
ILKAP-211ENST00000612675 FHAD1B1AJZ9 1412 aa36.53■■■■□ 3.44
ILKAP-211ENST00000612675 TRIM41Q8WV44 630 aa36.52■■■■□ 3.44
ILKAP-211ENST00000612675 GRIN2AQ12879 1464 aa36.47■■■■□ 3.43
ILKAP-211ENST00000612675 IGF1RP08069 1367 aa36.42■■■■□ 3.42
ILKAP-211ENST00000612675 CLASP1Q7Z460 1538 aa36.41■■■■□ 3.42
ILKAP-211ENST00000612675 CUL7Q14999 1698 aa36.35■■■■□ 3.41
ILKAP-211ENST00000612675 NUP160Q12769 1436 aa36.32■■■■□ 3.4
ILKAP-211ENST00000612675 CEP170Q5SW79 1584 aa36.29■■■■□ 3.4
ILKAP-211ENST00000612675 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa36.29■■■■□ 3.4
ILKAP-211ENST00000612675 ARHGEF11O15085 1522 aa36.27■■■■□ 3.4
ILKAP-211ENST00000612675 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa36.25■■■■□ 3.39
ILKAP-211ENST00000612675 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa36.25■■■■□ 3.39
ILKAP-211ENST00000612675 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa36.25■■■■□ 3.39
ILKAP-211ENST00000612675 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa36.22■■■■□ 3.39
ILKAP-211ENST00000612675 CHIC1Q5VXU3 224 aa36.15■■■■□ 3.38
ILKAP-211ENST00000612675 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa36.02■■■■□ 3.36
ILKAP-211ENST00000612675 SHROOM2Q13796 1616 aa36.02■■■■□ 3.36
ILKAP-211ENST00000612675 ARAP1Q96P48 1450 aa36■■■■□ 3.35
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