RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000441740.6

MEIS3-202, Transcript of Meis homeobox 3, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene MEIS3, Length 1,758 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3-202ENST00000441740 NISCHQ9Y2I1 1504 aa49.29■■■■■ 5.48
MEIS3-202ENST00000441740 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa43.26■■■■■ 4.52
MEIS3-202ENST00000441740 ABCC9O60706 1549 aa41.32■■■■■ 4.21
MEIS3-202ENST00000441740 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP41.32■■■■■ 4.2
MEIS3-202ENST00000441740 DCAF8L2P0C7V8 631 aa40.94■■■■■ 4.14
MEIS3-202ENST00000441740 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa40.72■■■■■ 4.11
MEIS3-202ENST00000441740 MYO15BQ96JP2 1530 aa40.39■■■■■ 4.06
MEIS3-202ENST00000441740 NACADO15069 1562 aa40.36■■■■■ 4.05
MEIS3-202ENST00000441740 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa40.16■■■■■ 4.02
MEIS3-202ENST00000441740 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa39.96■■■■□ 3.99
MEIS3-202ENST00000441740 SCRIBQ14160 1630 aa39.76■■■■□ 3.95
MEIS3-202ENST00000441740 UNC13AQ9UPW8 1703 aa39.4■■■■□ 3.9
MEIS3-202ENST00000441740 BICRAQ9NZM4 1560 aa38.92■■■■□ 3.82
MEIS3-202ENST00000441740 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP38.85■■■■□ 3.81
MEIS3-202ENST00000441740 CECR2Q9BXF3 1484 aa38.35■■■■□ 3.73
MEIS3-202ENST00000441740 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP38.2■■■■□ 3.71
MEIS3-202ENST00000441740 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP38.13■■■■□ 3.69
MEIS3-202ENST00000441740 MROH2BQ7Z745 1585 aa38.08■■■■□ 3.69
MEIS3-202ENST00000441740 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP38.04■■■■□ 3.68
MEIS3-202ENST00000441740 SMARCA4P51532 1647 aa38.04■■■■□ 3.68
MEIS3-202ENST00000441740 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP37.81■■■■□ 3.64
MEIS3-202ENST00000441740 WIZO95785 1651 aa37.8■■■■□ 3.64
MEIS3-202ENST00000441740 PEG3Q9GZU2 1588 aa37.54■■■■□ 3.6
MEIS3-202ENST00000441740 SMARCA2P51531 1590 aa37.48■■■■□ 3.59
MEIS3-202ENST00000441740 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa37.47■■■■□ 3.59
MEIS3-202ENST00000441740 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa37.39■■■■□ 3.58
MEIS3-202ENST00000441740 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP37.35■■■■□ 3.57
MEIS3-202ENST00000441740 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP37.29■■■■□ 3.56
MEIS3-202ENST00000441740 NCAPD3P42695 1498 aa37.2■■■■□ 3.55
MEIS3-202ENST00000441740 HMGXB3Q12766 1538 aa37.17■■■■□ 3.54
MEIS3-202ENST00000441740 CCDC88BA6NC98 1476 aa36.94■■■■□ 3.5
MEIS3-202ENST00000441740 DNAJC5BQ9UF47 199 aa36.78■■■■□ 3.48
MEIS3-202ENST00000441740 CFTRP13569 1480 aa36.27■■■■□ 3.4
MEIS3-202ENST00000441740 CHIC1Q5VXU3 224 aa36.26■■■■□ 3.4
MEIS3-202ENST00000441740 CADPSQ9ULU8 1353 aa36.23■■■■□ 3.39
MEIS3-202ENST00000441740 PRDM2Q13029 1718 aa36.19■■■■□ 3.38
MEIS3-202ENST00000441740 NESP48681 1621 aa36.13■■■■□ 3.37
MEIS3-202ENST00000441740 ABCC8Q09428 1581 aa36.08■■■■□ 3.37
MEIS3-202ENST00000441740 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa36.08■■■■□ 3.37
MEIS3-202ENST00000441740 TRIM41Q8WV44 630 aa35.92■■■■□ 3.34
MEIS3-202ENST00000441740 FANCD2Q9BXW9 1451 aa35.88■■■■□ 3.33
MEIS3-202ENST00000441740 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP35.86■■■■□ 3.33
MEIS3-202ENST00000441740 PDS5BQ9NTI5 1447 aa35.79■■■■□ 3.32
MEIS3-202ENST00000441740 SYNJ1O43426 1573 aa35.76■■■■□ 3.32
MEIS3-202ENST00000441740 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa35.75■■■■□ 3.31
MEIS3-202ENST00000441740 CEP164Q9UPV0 1460 aa35.72■■■■□ 3.31
MEIS3-202ENST00000441740 CUX1P39880 1505 aa35.65■■■■□ 3.3
MEIS3-202ENST00000441740 TOP2BQ02880 1626 aa35.64■■■■□ 3.3
MEIS3-202ENST00000441740 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa35.63■■■■□ 3.29
MEIS3-202ENST00000441740 ERCC6Q03468 1493 aa35.5■■■■□ 3.27
MEIS3-202ENST00000441740 DNMBPQ6XZF7 1577 aa35.49■■■■□ 3.27
MEIS3-202ENST00000441740 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP35.45■■■■□ 3.27
MEIS3-202ENST00000441740 TOPBP1Q92547 1522 aa35.43■■■■□ 3.26
MEIS3-202ENST00000441740 MRC2Q9UBG0 1479 aa35.38■■■■□ 3.25
MEIS3-202ENST00000441740 FGD5Q6ZNL6 1462 aa35.34■■■■□ 3.25
MEIS3-202ENST00000441740 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP35.3■■■■□ 3.24
MEIS3-202ENST00000441740 SOGA1O94964 1423 aa35.25■■■■□ 3.23
MEIS3-202ENST00000441740 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP35.23■■■■□ 3.23
MEIS3-202ENST00000441740 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP35.22■■■■□ 3.23
MEIS3-202ENST00000441740 WDR62O43379 1518 aa35.2■■■■□ 3.23
MEIS3-202ENST00000441740 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa35.16■■■■□ 3.22
MEIS3-202ENST00000441740 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa35.11■■■■□ 3.21
MEIS3-202ENST00000441740 EEA1Q15075 1411 aa35.07■■■■□ 3.2
MEIS3-202ENST00000441740 CUX2O14529 1486 aa35.03■■■■□ 3.2
MEIS3-202ENST00000441740 KIF27Q86VH2 1401 aa34.99■■■■□ 3.19
MEIS3-202ENST00000441740 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa34.98■■■■□ 3.19
MEIS3-202ENST00000441740 WDR97A6NE52 1622 aa34.98■■■■□ 3.19
MEIS3-202ENST00000441740 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP34.95■■■■□ 3.19
MEIS3-202ENST00000441740 CSRNP3Q8WYN3 585 aa34.92■■■■□ 3.18
MEIS3-202ENST00000441740 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa34.88■■■■□ 3.17
MEIS3-202ENST00000441740 EHMT2Q96KQ7 1210 aa34.87■■■■□ 3.17
MEIS3-202ENST00000441740 IFT140Q96RY7 1462 aa34.86■■■■□ 3.17
MEIS3-202ENST00000441740 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP34.8■■■■□ 3.16
MEIS3-202ENST00000441740 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa34.78■■■■□ 3.16
MEIS3-202ENST00000441740 GAPVD1Q14C86 1478 aa34.72■■■■□ 3.15
MEIS3-202ENST00000441740 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP34.7■■■■□ 3.15
MEIS3-202ENST00000441740 KIF21BO75037 1637 aa34.69■■■■□ 3.14
MEIS3-202ENST00000441740 IGF1RP08069 1367 aa34.68■■■■□ 3.14
MEIS3-202ENST00000441740 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP34.67■■■■□ 3.14
MEIS3-202ENST00000441740 PBRM1Q86U86 1689 aa34.64■■■■□ 3.14
MEIS3-202ENST00000441740 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP34.62■■■■□ 3.13
MEIS3-202ENST00000441740 GOLGA3Q08378 1498 aa34.61■■■■□ 3.13
MEIS3-202ENST00000441740 PRXQ9BXM0 1461 aa34.6■■■■□ 3.13
MEIS3-202ENST00000441740 ERICH3Q5RHP9 1530 aa34.59■■■■□ 3.13
MEIS3-202ENST00000441740 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa34.57■■■■□ 3.13
MEIS3-202ENST00000441740 CUL7Q14999 1698 aa34.56■■■■□ 3.12
MEIS3-202ENST00000441740 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa34.54■■■■□ 3.12
MEIS3-202ENST00000441740 GRIN2BQ13224 1484 aa34.51■■■■□ 3.12
MEIS3-202ENST00000441740 UBTFP17480 764 aaKnown RBP34.5■■■■□ 3.11
MEIS3-202ENST00000441740 ADAMTS12P58397 1594 aa34.37■■■■□ 3.09
MEIS3-202ENST00000441740 TNIKQ9UKE5 1360 aa34.36■■■■□ 3.09
MEIS3-202ENST00000441740 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa34.36■■■■□ 3.09
MEIS3-202ENST00000441740 FHAD1B1AJZ9 1412 aa34.31■■■■□ 3.08
MEIS3-202ENST00000441740 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP34.27■■■■□ 3.08
MEIS3-202ENST00000441740 CEP162Q5TB80 1403 aa34.19■■■■□ 3.06
MEIS3-202ENST00000441740 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa34.16■■■■□ 3.06
MEIS3-202ENST00000441740 SYNJ2O15056 1496 aa34.14■■■■□ 3.06
MEIS3-202ENST00000441740 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP34.13■■■■□ 3.05
MEIS3-202ENST00000441740 FBLN2P98095 1184 aa34.11■■■■□ 3.05
MEIS3-202ENST00000441740 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP34.1■■■■□ 3.05
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