RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000377924.4

LRRC3C-201, Transcript of leucine rich repeat containing 3C, humanhuman

APPRIS P1 TSL 3 BASIC

Gene LRRC3C, Length 891 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC3C-201ENST00000377924 NISCHQ9Y2I1 1504 aa51.7■■■■■ 5.87
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LRRC3C-201ENST00000377924 DCAF8L2P0C7V8 631 aa43.29■■■■■ 4.52
LRRC3C-201ENST00000377924 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa43.22■■■■■ 4.51
LRRC3C-201ENST00000377924 NACADO15069 1562 aa43.17■■■■■ 4.5
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LRRC3C-201ENST00000377924 MYO15BQ96JP2 1530 aa42.89■■■■■ 4.46
LRRC3C-201ENST00000377924 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa42.76■■■■■ 4.44
LRRC3C-201ENST00000377924 UNC13AQ9UPW8 1703 aa42.26■■■■■ 4.36
LRRC3C-201ENST00000377924 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP41.99■■■■■ 4.31
LRRC3C-201ENST00000377924 SCRIBQ14160 1630 aa41.96■■■■■ 4.31
LRRC3C-201ENST00000377924 BICRAQ9NZM4 1560 aa41.86■■■■■ 4.29
LRRC3C-201ENST00000377924 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa41.41■■■■■ 4.22
LRRC3C-201ENST00000377924 DNAJC5BQ9UF47 199 aa41.09■■■■■ 4.17
LRRC3C-201ENST00000377924 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP40.78■■■■■ 4.12
LRRC3C-201ENST00000377924 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa40.61■■■■■ 4.09
LRRC3C-201ENST00000377924 CECR2Q9BXF3 1484 aa40.32■■■■■ 4.04
LRRC3C-201ENST00000377924 SMARCA4P51532 1647 aa40.12■■■■■ 4.01
LRRC3C-201ENST00000377924 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP40.09■■■■■ 4.01
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LRRC3C-201ENST00000377924 MROH2BQ7Z745 1585 aa39.85■■■■□ 3.97
LRRC3C-201ENST00000377924 SMARCA2P51531 1590 aa39.84■■■■□ 3.97
LRRC3C-201ENST00000377924 NCAPD3P42695 1498 aa39.81■■■■□ 3.96
LRRC3C-201ENST00000377924 PEG3Q9GZU2 1588 aa39.68■■■■□ 3.94
LRRC3C-201ENST00000377924 HMGXB3Q12766 1538 aa39.63■■■■□ 3.93
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LRRC3C-201ENST00000377924 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa38.78■■■■□ 3.8
LRRC3C-201ENST00000377924 ERCC6Q03468 1493 aa38.72■■■■□ 3.79
LRRC3C-201ENST00000377924 CADPSQ9ULU8 1353 aa38.68■■■■□ 3.78
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LRRC3C-201ENST00000377924 CCDC88BA6NC98 1476 aa38.57■■■■□ 3.76
LRRC3C-201ENST00000377924 PDS5BQ9NTI5 1447 aa38.53■■■■□ 3.76
LRRC3C-201ENST00000377924 CFTRP13569 1480 aa38.45■■■■□ 3.75
LRRC3C-201ENST00000377924 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa38.43■■■■□ 3.74
LRRC3C-201ENST00000377924 FANCD2Q9BXW9 1451 aa38.25■■■■□ 3.71
LRRC3C-201ENST00000377924 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP38.24■■■■□ 3.71
LRRC3C-201ENST00000377924 PRDM2Q13029 1718 aa38.23■■■■□ 3.71
LRRC3C-201ENST00000377924 CUX2O14529 1486 aa38.22■■■■□ 3.71
LRRC3C-201ENST00000377924 CEP164Q9UPV0 1460 aa38.21■■■■□ 3.71
LRRC3C-201ENST00000377924 MRC2Q9UBG0 1479 aa38.12■■■■□ 3.69
LRRC3C-201ENST00000377924 WDR62O43379 1518 aa37.97■■■■□ 3.67
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LRRC3C-201ENST00000377924 ABCC8Q09428 1581 aa37.66■■■■□ 3.62
LRRC3C-201ENST00000377924 TOPBP1Q92547 1522 aa37.64■■■■□ 3.62
LRRC3C-201ENST00000377924 DNMBPQ6XZF7 1577 aa37.61■■■■□ 3.61
LRRC3C-201ENST00000377924 IFT140Q96RY7 1462 aa37.39■■■■□ 3.58
LRRC3C-201ENST00000377924 CUX1P39880 1505 aa37.38■■■■□ 3.57
LRRC3C-201ENST00000377924 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP37.33■■■■□ 3.57
LRRC3C-201ENST00000377924 FGD5Q6ZNL6 1462 aa37.26■■■■□ 3.56
LRRC3C-201ENST00000377924 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP37.21■■■■□ 3.55
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LRRC3C-201ENST00000377924 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP37.2■■■■□ 3.55
LRRC3C-201ENST00000377924 SOGA1O94964 1423 aa37.19■■■■□ 3.54
LRRC3C-201ENST00000377924 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa37.18■■■■□ 3.54
LRRC3C-201ENST00000377924 TOP2BQ02880 1626 aa37.1■■■■□ 3.53
LRRC3C-201ENST00000377924 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa37.1■■■■□ 3.53
LRRC3C-201ENST00000377924 SYNJ1O43426 1573 aa37.09■■■■□ 3.53
LRRC3C-201ENST00000377924 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP37.08■■■■□ 3.53
LRRC3C-201ENST00000377924 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP37.02■■■■□ 3.52
LRRC3C-201ENST00000377924 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP36.98■■■■□ 3.51
LRRC3C-201ENST00000377924 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa36.95■■■■□ 3.51
LRRC3C-201ENST00000377924 WDR97A6NE52 1622 aa36.93■■■■□ 3.5
LRRC3C-201ENST00000377924 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa36.89■■■■□ 3.5
LRRC3C-201ENST00000377924 GAPVD1Q14C86 1478 aa36.76■■■■□ 3.48
LRRC3C-201ENST00000377924 GRIN2BQ13224 1484 aa36.74■■■■□ 3.47
LRRC3C-201ENST00000377924 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa36.74■■■■□ 3.47
LRRC3C-201ENST00000377924 PBRM1Q86U86 1689 aa36.7■■■■□ 3.47
LRRC3C-201ENST00000377924 OSCARQ8IYS5 282 aa36.7■■■■□ 3.47
LRRC3C-201ENST00000377924 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa36.69■■■■□ 3.46
LRRC3C-201ENST00000377924 FBLN2P98095 1184 aa36.63■■■■□ 3.45
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LRRC3C-201ENST00000377924 CHD1O14646 1710 aa36.62■■■■□ 3.45
LRRC3C-201ENST00000377924 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP36.52■■■■□ 3.44
LRRC3C-201ENST00000377924 SYNJ2O15056 1496 aa36.49■■■■□ 3.43
LRRC3C-201ENST00000377924 ERICH3Q5RHP9 1530 aa36.45■■■■□ 3.43
LRRC3C-201ENST00000377924 TRIM41Q8WV44 630 aa36.44■■■■□ 3.42
LRRC3C-201ENST00000377924 KIF27Q86VH2 1401 aa36.42■■■■□ 3.42
LRRC3C-201ENST00000377924 ADAMTS12P58397 1594 aa36.38■■■■□ 3.41
LRRC3C-201ENST00000377924 FHAD1B1AJZ9 1412 aa36.34■■■■□ 3.41
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LRRC3C-201ENST00000377924 CLASP1Q7Z460 1538 aa36.17■■■■□ 3.38
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LRRC3C-201ENST00000377924 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa36.11■■■■□ 3.37
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LRRC3C-201ENST00000377924 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa36.08■■■■□ 3.37
LRRC3C-201ENST00000377924 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa36.08■■■■□ 3.37
LRRC3C-201ENST00000377924 CEP170Q5SW79 1584 aa36.08■■■■□ 3.37
LRRC3C-201ENST00000377924 NUP160Q12769 1436 aa36.08■■■■□ 3.37
LRRC3C-201ENST00000377924 ARHGEF11O15085 1522 aa36.07■■■■□ 3.36
LRRC3C-201ENST00000377924 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa36.05■■■■□ 3.36
LRRC3C-201ENST00000377924 CHIC1Q5VXU3 224 aa36.01■■■■□ 3.36
LRRC3C-201ENST00000377924 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa35.85■■■■□ 3.33
LRRC3C-201ENST00000377924 SHROOM2Q13796 1616 aa35.79■■■■□ 3.32
LRRC3C-201ENST00000377924 CYB5RLQ6IPT4 315 aa35.78■■■■□ 3.32
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