RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000611323.1

ELOA3B-201, Transcript of elongin A3 family member B, humanhuman

APPRIS P1 BASIC

Gene ELOA3B, Length 1,641 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELOA3B-201ENST00000611323 NISCHQ9Y2I1 1504 aa51.04■■■■■ 5.76
ELOA3B-201ENST00000611323 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa45.06■■■■■ 4.8
ELOA3B-201ENST00000611323 ABCC9O60706 1549 aa43.73■■■■■ 4.59
ELOA3B-201ENST00000611323 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP42.61■■■■■ 4.41
ELOA3B-201ENST00000611323 DCAF8L2P0C7V8 631 aa42.53■■■■■ 4.4
ELOA3B-201ENST00000611323 NACADO15069 1562 aa42.32■■■■■ 4.37
ELOA3B-201ENST00000611323 MYO15BQ96JP2 1530 aa42.24■■■■■ 4.35
ELOA3B-201ENST00000611323 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa42.24■■■■■ 4.35
ELOA3B-201ENST00000611323 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa42.23■■■■■ 4.35
ELOA3B-201ENST00000611323 SCRIBQ14160 1630 aa41.2■■■■■ 4.19
ELOA3B-201ENST00000611323 UNC13AQ9UPW8 1703 aa41.2■■■■■ 4.19
ELOA3B-201ENST00000611323 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP41.01■■■■■ 4.16
ELOA3B-201ENST00000611323 BICRAQ9NZM4 1560 aa40.96■■■■■ 4.15
ELOA3B-201ENST00000611323 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa40.65■■■■■ 4.1
ELOA3B-201ENST00000611323 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP39.84■■■■□ 3.97
ELOA3B-201ENST00000611323 DNAJC5BQ9UF47 199 aa39.79■■■■□ 3.96
ELOA3B-201ENST00000611323 CECR2Q9BXF3 1484 aa39.73■■■■□ 3.95
ELOA3B-201ENST00000611323 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa39.54■■■■□ 3.92
ELOA3B-201ENST00000611323 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP39.5■■■■□ 3.91
ELOA3B-201ENST00000611323 SMARCA4P51532 1647 aa39.46■■■■□ 3.91
ELOA3B-201ENST00000611323 MROH2BQ7Z745 1585 aa39.35■■■■□ 3.89
ELOA3B-201ENST00000611323 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa39.18■■■■□ 3.86
ELOA3B-201ENST00000611323 SMARCA2P51531 1590 aa39.11■■■■□ 3.85
ELOA3B-201ENST00000611323 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP39.11■■■■□ 3.85
ELOA3B-201ENST00000611323 NCAPD3P42695 1498 aa39.09■■■■□ 3.85
ELOA3B-201ENST00000611323 PEG3Q9GZU2 1588 aa39.08■■■■□ 3.85
ELOA3B-201ENST00000611323 WIZO95785 1651 aa38.91■■■■□ 3.82
ELOA3B-201ENST00000611323 HMGXB3Q12766 1538 aa38.89■■■■□ 3.82
ELOA3B-201ENST00000611323 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP38.86■■■■□ 3.81
ELOA3B-201ENST00000611323 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP38.53■■■■□ 3.76
ELOA3B-201ENST00000611323 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP38.52■■■■□ 3.76
ELOA3B-201ENST00000611323 CCDC88BA6NC98 1476 aa38.13■■■■□ 3.69
ELOA3B-201ENST00000611323 CADPSQ9ULU8 1353 aa37.99■■■■□ 3.67
ELOA3B-201ENST00000611323 NESP48681 1621 aa37.99■■■■□ 3.67
ELOA3B-201ENST00000611323 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa37.93■■■■□ 3.66
ELOA3B-201ENST00000611323 CFTRP13569 1480 aa37.85■■■■□ 3.65
ELOA3B-201ENST00000611323 PDS5BQ9NTI5 1447 aa37.71■■■■□ 3.63
ELOA3B-201ENST00000611323 ERCC6Q03468 1493 aa37.64■■■■□ 3.62
ELOA3B-201ENST00000611323 FANCD2Q9BXW9 1451 aa37.53■■■■□ 3.6
ELOA3B-201ENST00000611323 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa37.47■■■■□ 3.59
ELOA3B-201ENST00000611323 PRDM2Q13029 1718 aa37.43■■■■□ 3.58
ELOA3B-201ENST00000611323 CEP164Q9UPV0 1460 aa37.42■■■■□ 3.58
ELOA3B-201ENST00000611323 MRC2Q9UBG0 1479 aa37.26■■■■□ 3.56
ELOA3B-201ENST00000611323 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP37.25■■■■□ 3.55
ELOA3B-201ENST00000611323 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP37.12■■■■□ 3.53
ELOA3B-201ENST00000611323 WDR62O43379 1518 aa37.11■■■■□ 3.53
ELOA3B-201ENST00000611323 CUX2O14529 1486 aa37.05■■■■□ 3.52
ELOA3B-201ENST00000611323 ABCC8Q09428 1581 aa37■■■■□ 3.51
ELOA3B-201ENST00000611323 TOPBP1Q92547 1522 aa36.97■■■■□ 3.51
ELOA3B-201ENST00000611323 DNMBPQ6XZF7 1577 aa36.94■■■■□ 3.5
ELOA3B-201ENST00000611323 CUX1P39880 1505 aa36.88■■■■□ 3.49
ELOA3B-201ENST00000611323 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP36.84■■■■□ 3.49
ELOA3B-201ENST00000611323 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP36.7■■■■□ 3.47
ELOA3B-201ENST00000611323 SYNJ1O43426 1573 aa36.68■■■■□ 3.46
ELOA3B-201ENST00000611323 FGD5Q6ZNL6 1462 aa36.68■■■■□ 3.46
ELOA3B-201ENST00000611323 TOP2BQ02880 1626 aa36.66■■■■□ 3.46
ELOA3B-201ENST00000611323 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa36.62■■■■□ 3.45
ELOA3B-201ENST00000611323 IFT140Q96RY7 1462 aa36.62■■■■□ 3.45
ELOA3B-201ENST00000611323 SOGA1O94964 1423 aa36.59■■■■□ 3.45
ELOA3B-201ENST00000611323 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa36.56■■■■□ 3.44
ELOA3B-201ENST00000611323 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP36.51■■■■□ 3.43
ELOA3B-201ENST00000611323 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP36.43■■■■□ 3.42
ELOA3B-201ENST00000611323 TRIM41Q8WV44 630 aa36.37■■■■□ 3.41
ELOA3B-201ENST00000611323 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa36.35■■■■□ 3.41
ELOA3B-201ENST00000611323 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP36.34■■■■□ 3.41
ELOA3B-201ENST00000611323 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP36.31■■■■□ 3.4
ELOA3B-201ENST00000611323 WDR97A6NE52 1622 aa36.27■■■■□ 3.4
ELOA3B-201ENST00000611323 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP36.24■■■■□ 3.39
ELOA3B-201ENST00000611323 CHIC1Q5VXU3 224 aa36.24■■■■□ 3.39
ELOA3B-201ENST00000611323 GAPVD1Q14C86 1478 aa36.16■■■■□ 3.38
ELOA3B-201ENST00000611323 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa36.11■■■■□ 3.37
ELOA3B-201ENST00000611323 GRIN2BQ13224 1484 aa36.07■■■■□ 3.37
ELOA3B-201ENST00000611323 KIF27Q86VH2 1401 aa36.04■■■■□ 3.36
ELOA3B-201ENST00000611323 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa35.95■■■■□ 3.34
ELOA3B-201ENST00000611323 PBRM1Q86U86 1689 aa35.94■■■■□ 3.34
ELOA3B-201ENST00000611323 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP35.91■■■■□ 3.34
ELOA3B-201ENST00000611323 ERICH3Q5RHP9 1530 aa35.91■■■■□ 3.34
ELOA3B-201ENST00000611323 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa35.88■■■■□ 3.33
ELOA3B-201ENST00000611323 IGF1RP08069 1367 aa35.88■■■■□ 3.33
ELOA3B-201ENST00000611323 FBLN2P98095 1184 aa35.8■■■■□ 3.32
ELOA3B-201ENST00000611323 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP35.78■■■■□ 3.32
ELOA3B-201ENST00000611323 SYNJ2O15056 1496 aa35.78■■■■□ 3.32
ELOA3B-201ENST00000611323 FHAD1B1AJZ9 1412 aa35.75■■■■□ 3.31
ELOA3B-201ENST00000611323 ADAMTS12P58397 1594 aa35.73■■■■□ 3.31
ELOA3B-201ENST00000611323 OSCARQ8IYS5 282 aa35.69■■■■□ 3.3
ELOA3B-201ENST00000611323 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa35.66■■■■□ 3.3
ELOA3B-201ENST00000611323 EEA1Q15075 1411 aa35.66■■■■□ 3.3
ELOA3B-201ENST00000611323 CHD1O14646 1710 aa35.65■■■■□ 3.3
ELOA3B-201ENST00000611323 CUL7Q14999 1698 aa35.63■■■■□ 3.29
ELOA3B-201ENST00000611323 GRIN2AQ12879 1464 aa35.61■■■■□ 3.29
ELOA3B-201ENST00000611323 CSRNP3Q8WYN3 585 aa35.61■■■■□ 3.29
ELOA3B-201ENST00000611323 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP35.59■■■■□ 3.29
ELOA3B-201ENST00000611323 PRXQ9BXM0 1461 aa35.48■■■■□ 3.27
ELOA3B-201ENST00000611323 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa35.46■■■■□ 3.27
ELOA3B-201ENST00000611323 NUP160Q12769 1436 aa35.44■■■■□ 3.26
ELOA3B-201ENST00000611323 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa35.43■■■■□ 3.26
ELOA3B-201ENST00000611323 CEP170Q5SW79 1584 aa35.39■■■■□ 3.26
ELOA3B-201ENST00000611323 CLASP1Q7Z460 1538 aa35.34■■■■□ 3.25
ELOA3B-201ENST00000611323 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa35.23■■■■□ 3.23
ELOA3B-201ENST00000611323 KIF21BO75037 1637 aa35.2■■■■□ 3.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.7 ms