Protein–RNA interactions for Protein: P19793

RXRA, Retinoic acid receptor RXR-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RXRAP19793 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RXRAP19793 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RXRAP19793 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RXRAP19793 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RXRAP19793 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RXRAP19793 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RXRAP19793 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RXRAP19793 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RXRAP19793 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RXRAP19793 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RXRAP19793 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RXRAP19793 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RXRAP19793 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RXRAP19793 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RXRAP19793 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RXRAP19793 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RXRAP19793 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
RXRAP19793 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RXRAP19793 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
RXRAP19793 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RXRAP19793 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RXRAP19793 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RXRAP19793 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
RXRAP19793 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RXRAP19793 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
RXRAP19793 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RXRAP19793 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RXRAP19793 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RXRAP19793 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RXRAP19793 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RXRAP19793 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RXRAP19793 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
RXRAP19793 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
RXRAP19793 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
RXRAP19793 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
RXRAP19793 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RXRAP19793 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RXRAP19793 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RXRAP19793 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RXRAP19793 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RXRAP19793 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RXRAP19793 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RXRAP19793 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RXRAP19793 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RXRAP19793 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RXRAP19793 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RXRAP19793 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RXRAP19793 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RXRAP19793 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RXRAP19793 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RXRAP19793 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RXRAP19793 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RXRAP19793 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RXRAP19793 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RXRAP19793 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RXRAP19793 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RXRAP19793 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RXRAP19793 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RXRAP19793 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RXRAP19793 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RXRAP19793 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RXRAP19793 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
RXRAP19793 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RXRAP19793 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RXRAP19793 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
RXRAP19793 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
RXRAP19793 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
RXRAP19793 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RXRAP19793 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RXRAP19793 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RXRAP19793 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RXRAP19793 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RXRAP19793 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RXRAP19793 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RXRAP19793 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RXRAP19793 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RXRAP19793 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RXRAP19793 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RXRAP19793 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RXRAP19793 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RXRAP19793 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RXRAP19793 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RXRAP19793 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RXRAP19793 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RXRAP19793 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RXRAP19793 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RXRAP19793 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
RXRAP19793 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RXRAP19793 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RXRAP19793 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RXRAP19793 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RXRAP19793 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RXRAP19793 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
RXRAP19793 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RXRAP19793 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RXRAP19793 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RXRAP19793 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RXRAP19793 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RXRAP19793 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RXRAP19793 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms