RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000453996.6

CTU2-202, Transcript of cytosolic thiouridylase subunit 2, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTU2, Length 1,751 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU2-202ENST00000453996 NISCHQ9Y2I1 1504 aa48.39■■■■■ 5.34
CTU2-202ENST00000453996 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa42.28■■■■■ 4.36
CTU2-202ENST00000453996 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP40.68■■■■■ 4.1
CTU2-202ENST00000453996 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa40.04■■■■■ 4
CTU2-202ENST00000453996 DCAF8L2P0C7V8 631 aa39.86■■■■□ 3.97
CTU2-202ENST00000453996 ABCC9O60706 1549 aa39.84■■■■□ 3.97
CTU2-202ENST00000453996 MYO15BQ96JP2 1530 aa39.55■■■■□ 3.92
CTU2-202ENST00000453996 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa39.45■■■■□ 3.91
CTU2-202ENST00000453996 NACADO15069 1562 aa39.31■■■■□ 3.88
CTU2-202ENST00000453996 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa38.98■■■■□ 3.83
CTU2-202ENST00000453996 SCRIBQ14160 1630 aa38.84■■■■□ 3.81
CTU2-202ENST00000453996 UNC13AQ9UPW8 1703 aa38.25■■■■□ 3.71
CTU2-202ENST00000453996 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP37.95■■■■□ 3.67
CTU2-202ENST00000453996 BICRAQ9NZM4 1560 aa37.79■■■■□ 3.64
CTU2-202ENST00000453996 CECR2Q9BXF3 1484 aa37.57■■■■□ 3.6
CTU2-202ENST00000453996 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP37.53■■■■□ 3.6
CTU2-202ENST00000453996 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP37.52■■■■□ 3.6
CTU2-202ENST00000453996 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP37.4■■■■□ 3.58
CTU2-202ENST00000453996 MROH2BQ7Z745 1585 aa37.38■■■■□ 3.58
CTU2-202ENST00000453996 SMARCA4P51532 1647 aa37.24■■■■□ 3.55
CTU2-202ENST00000453996 WIZO95785 1651 aa37.12■■■■□ 3.53
CTU2-202ENST00000453996 PEG3Q9GZU2 1588 aa36.78■■■■□ 3.48
CTU2-202ENST00000453996 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP36.74■■■■□ 3.47
CTU2-202ENST00000453996 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP36.65■■■■□ 3.46
CTU2-202ENST00000453996 SMARCA2P51531 1590 aa36.59■■■■□ 3.45
CTU2-202ENST00000453996 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa36.56■■■■□ 3.44
CTU2-202ENST00000453996 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP36.39■■■■□ 3.42
CTU2-202ENST00000453996 CHIC1Q5VXU3 224 aa36.35■■■■□ 3.41
CTU2-202ENST00000453996 CCDC88BA6NC98 1476 aa36.31■■■■□ 3.4
CTU2-202ENST00000453996 HMGXB3Q12766 1538 aa36.25■■■■□ 3.39
CTU2-202ENST00000453996 NCAPD3P42695 1498 aa36.24■■■■□ 3.39
CTU2-202ENST00000453996 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa36.1■■■■□ 3.37
CTU2-202ENST00000453996 TRIM41Q8WV44 630 aa35.7■■■■□ 3.31
CTU2-202ENST00000453996 ABCC8Q09428 1581 aa35.59■■■■□ 3.29
CTU2-202ENST00000453996 CFTRP13569 1480 aa35.45■■■■□ 3.27
CTU2-202ENST00000453996 PRDM2Q13029 1718 aa35.41■■■■□ 3.26
CTU2-202ENST00000453996 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP35.34■■■■□ 3.255e-6■■■■■ 29.2
CTU2-202ENST00000453996 CADPSQ9ULU8 1353 aa35.3■■■■□ 3.24
CTU2-202ENST00000453996 SYNJ1O43426 1573 aa35.23■■■■□ 3.23
CTU2-202ENST00000453996 TOP2BQ02880 1626 aa35.1■■■■□ 3.21
CTU2-202ENST00000453996 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa35.08■■■■□ 3.21
CTU2-202ENST00000453996 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa35.06■■■■□ 3.2
CTU2-202ENST00000453996 DNAJC5BQ9UF47 199 aa35.04■■■■□ 3.2
CTU2-202ENST00000453996 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP35.02■■■■□ 3.2
CTU2-202ENST00000453996 NESP48681 1621 aa34.99■■■■□ 3.19
CTU2-202ENST00000453996 CUX1P39880 1505 aa34.96■■■■□ 3.19
CTU2-202ENST00000453996 FANCD2Q9BXW9 1451 aa34.94■■■■□ 3.18
CTU2-202ENST00000453996 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa34.93■■■■□ 3.18
CTU2-202ENST00000453996 SOGA1O94964 1423 aa34.88■■■■□ 3.17
CTU2-202ENST00000453996 EEA1Q15075 1411 aa34.87■■■■□ 3.17
CTU2-202ENST00000453996 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa34.75■■■■□ 3.15
CTU2-202ENST00000453996 PDS5BQ9NTI5 1447 aa34.74■■■■□ 3.15
CTU2-202ENST00000453996 CEP164Q9UPV0 1460 aa34.73■■■■□ 3.15
CTU2-202ENST00000453996 DNMBPQ6XZF7 1577 aa34.67■■■■□ 3.14
CTU2-202ENST00000453996 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa34.66■■■■□ 3.14
CTU2-202ENST00000453996 CSRNP3Q8WYN3 585 aa34.61■■■■□ 3.13
CTU2-202ENST00000453996 FGD5Q6ZNL6 1462 aa34.58■■■■□ 3.13
CTU2-202ENST00000453996 TOPBP1Q92547 1522 aa34.57■■■■□ 3.13
CTU2-202ENST00000453996 EHMT2Q96KQ7 1210 aa34.52■■■■□ 3.12
CTU2-202ENST00000453996 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP34.51■■■■□ 3.11
CTU2-202ENST00000453996 KIF21BO75037 1637 aa34.46■■■■□ 3.11
CTU2-202ENST00000453996 KIF27Q86VH2 1401 aa34.45■■■■□ 3.11
CTU2-202ENST00000453996 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP34.4■■■■□ 3.1
CTU2-202ENST00000453996 GOLGA3Q08378 1498 aa34.4■■■■□ 3.1
CTU2-202ENST00000453996 CUX2O14529 1486 aa34.35■■■■□ 3.09
CTU2-202ENST00000453996 MRC2Q9UBG0 1479 aa34.31■■■■□ 3.08
CTU2-202ENST00000453996 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa34.27■■■■□ 3.08
CTU2-202ENST00000453996 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa34.27■■■■□ 3.08
CTU2-202ENST00000453996 TNIKQ9UKE5 1360 aa34.26■■■■□ 3.07
CTU2-202ENST00000453996 WDR97A6NE52 1622 aa34.23■■■■□ 3.07
CTU2-202ENST00000453996 PRXQ9BXM0 1461 aa34.22■■■■□ 3.07
CTU2-202ENST00000453996 ERICH3Q5RHP9 1530 aa34.21■■■■□ 3.07
CTU2-202ENST00000453996 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa34.19■■■■□ 3.06
CTU2-202ENST00000453996 ERCC6Q03468 1493 aa34.19■■■■□ 3.06
CTU2-202ENST00000453996 UBTFP17480 764 aaKnown RBP34.17■■■■□ 3.06
CTU2-202ENST00000453996 WDR62O43379 1518 aa34.15■■■■□ 3.06
CTU2-202ENST00000453996 CEP162Q5TB80 1403 aa34.1■■■■□ 3.05
CTU2-202ENST00000453996 IGF1RP08069 1367 aa34.09■■■■□ 3.05
CTU2-202ENST00000453996 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP34.08■■■■□ 3.05
CTU2-202ENST00000453996 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP34.06■■■■□ 3.04
CTU2-202ENST00000453996 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa34.04■■■■□ 3.04
CTU2-202ENST00000453996 CUL7Q14999 1698 aa33.95■■■■□ 3.03
CTU2-202ENST00000453996 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa33.94■■■■□ 3.02
CTU2-202ENST00000453996 GAPVD1Q14C86 1478 aa33.91■■■■□ 3.02
CTU2-202ENST00000453996 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP33.91■■■■□ 3.02
CTU2-202ENST00000453996 IFT140Q96RY7 1462 aa33.9■■■■□ 3.02
CTU2-202ENST00000453996 CLIP1P30622 1438 aa33.83■■■■□ 3.01
CTU2-202ENST00000453996 PBRM1Q86U86 1689 aa33.81■■■■□ 3
CTU2-202ENST00000453996 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP33.7■■■□□ 2.981e-7■■■■■ 27.3
CTU2-202ENST00000453996 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP33.68■■■□□ 2.98
CTU2-202ENST00000453996 GRIN2BQ13224 1484 aa33.65■■■□□ 2.98
CTU2-202ENST00000453996 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP33.65■■■□□ 2.98
CTU2-202ENST00000453996 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa33.6■■■□□ 2.97
CTU2-202ENST00000453996 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP33.6■■■□□ 2.97
CTU2-202ENST00000453996 ADAMTS12P58397 1594 aa33.59■■■□□ 2.97
CTU2-202ENST00000453996 FHAD1B1AJZ9 1412 aa33.55■■■□□ 2.96
CTU2-202ENST00000453996 VPS8Q8N3P4 1428 aa33.54■■■□□ 2.96
CTU2-202ENST00000453996 ARAP1Q96P48 1450 aa33.5■■■□□ 2.95
CTU2-202ENST00000453996 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa33.48■■■□□ 2.95
CTU2-202ENST00000453996 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa33.43■■■□□ 2.94
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