Protein–RNA interactions for Protein: Q96PE3

INPP4A, Type I inositol 3,4-bisphosphate 4-phosphatase, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 977 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INPP4AQ96PE3 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
INPP4AQ96PE3 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
INPP4AQ96PE3 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
INPP4AQ96PE3 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
INPP4AQ96PE3 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
INPP4AQ96PE3 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
INPP4AQ96PE3 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
INPP4AQ96PE3 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
INPP4AQ96PE3 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
INPP4AQ96PE3 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
INPP4AQ96PE3 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
INPP4AQ96PE3 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
INPP4AQ96PE3 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
INPP4AQ96PE3 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
INPP4AQ96PE3 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
INPP4AQ96PE3 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
INPP4AQ96PE3 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
INPP4AQ96PE3 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
INPP4AQ96PE3 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
INPP4AQ96PE3 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
INPP4AQ96PE3 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
INPP4AQ96PE3 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
INPP4AQ96PE3 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
INPP4AQ96PE3 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
INPP4AQ96PE3 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
INPP4AQ96PE3 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
INPP4AQ96PE3 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
INPP4AQ96PE3 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
INPP4AQ96PE3 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
INPP4AQ96PE3 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
INPP4AQ96PE3 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
INPP4AQ96PE3 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
INPP4AQ96PE3 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
INPP4AQ96PE3 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
INPP4AQ96PE3 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
INPP4AQ96PE3 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
INPP4AQ96PE3 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
INPP4AQ96PE3 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
INPP4AQ96PE3 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
INPP4AQ96PE3 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
INPP4AQ96PE3 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
INPP4AQ96PE3 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
INPP4AQ96PE3 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
INPP4AQ96PE3 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
INPP4AQ96PE3 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
INPP4AQ96PE3 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
INPP4AQ96PE3 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
INPP4AQ96PE3 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
INPP4AQ96PE3 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
INPP4AQ96PE3 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
INPP4AQ96PE3 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
INPP4AQ96PE3 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
INPP4AQ96PE3 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
INPP4AQ96PE3 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
INPP4AQ96PE3 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
INPP4AQ96PE3 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
INPP4AQ96PE3 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
INPP4AQ96PE3 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
INPP4AQ96PE3 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
INPP4AQ96PE3 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
INPP4AQ96PE3 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
INPP4AQ96PE3 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
INPP4AQ96PE3 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
INPP4AQ96PE3 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
INPP4AQ96PE3 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
INPP4AQ96PE3 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
INPP4AQ96PE3 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
INPP4AQ96PE3 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
INPP4AQ96PE3 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
INPP4AQ96PE3 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
INPP4AQ96PE3 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
INPP4AQ96PE3 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
INPP4AQ96PE3 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
INPP4AQ96PE3 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
INPP4AQ96PE3 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
INPP4AQ96PE3 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
INPP4AQ96PE3 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
INPP4AQ96PE3 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
INPP4AQ96PE3 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
INPP4AQ96PE3 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
INPP4AQ96PE3 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
INPP4AQ96PE3 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
INPP4AQ96PE3 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
INPP4AQ96PE3 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
INPP4AQ96PE3 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
INPP4AQ96PE3 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
INPP4AQ96PE3 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
INPP4AQ96PE3 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
INPP4AQ96PE3 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
INPP4AQ96PE3 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
INPP4AQ96PE3 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
INPP4AQ96PE3 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
INPP4AQ96PE3 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
INPP4AQ96PE3 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
INPP4AQ96PE3 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
INPP4AQ96PE3 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
INPP4AQ96PE3 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
INPP4AQ96PE3 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
INPP4AQ96PE3 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
INPP4AQ96PE3 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 134.1 ms