RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561540.1

KCTD13-202, Transcript of potassium channel tetramerization domain containing 13, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene KCTD13, Length 1,773 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCTD13-202ENST00000561540 NISCHQ9Y2I1 1504 aa50.1■■■■■ 5.61
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KCTD13-202ENST00000561540 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP41.99■■■■■ 4.31
KCTD13-202ENST00000561540 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa41.49■■■■■ 4.23
KCTD13-202ENST00000561540 DCAF8L2P0C7V8 631 aa41.35■■■■■ 4.21
KCTD13-202ENST00000561540 MYO15BQ96JP2 1530 aa41.23■■■■■ 4.19
KCTD13-202ENST00000561540 NACADO15069 1562 aa41.1■■■■■ 4.17
KCTD13-202ENST00000561540 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa40.87■■■■■ 4.13
KCTD13-202ENST00000561540 SCRIBQ14160 1630 aa40.3■■■■■ 4.04
KCTD13-202ENST00000561540 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa40.29■■■■■ 4.04
KCTD13-202ENST00000561540 UNC13AQ9UPW8 1703 aa40.1■■■■■ 4.01
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KCTD13-202ENST00000561540 MROH2BQ7Z745 1585 aa38.66■■■■□ 3.78
KCTD13-202ENST00000561540 SMARCA4P51532 1647 aa38.65■■■■□ 3.78
KCTD13-202ENST00000561540 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP38.61■■■■□ 3.77
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KCTD13-202ENST00000561540 WIZO95785 1651 aa38.32■■■■□ 3.73
KCTD13-202ENST00000561540 PEG3Q9GZU2 1588 aa38.25■■■■□ 3.71
KCTD13-202ENST00000561540 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa38.12■■■■□ 3.69
KCTD13-202ENST00000561540 SMARCA2P51531 1590 aa38.12■■■■□ 3.69
KCTD13-202ENST00000561540 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa38.06■■■■□ 3.68
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KCTD13-202ENST00000561540 CCDC88BA6NC98 1476 aa37.5■■■■□ 3.59
KCTD13-202ENST00000561540 CFTRP13569 1480 aa36.91■■■■□ 3.5
KCTD13-202ENST00000561540 CADPSQ9ULU8 1353 aa36.87■■■■□ 3.49
KCTD13-202ENST00000561540 PRDM2Q13029 1718 aa36.79■■■■□ 3.48
KCTD13-202ENST00000561540 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa36.74■■■■□ 3.47
KCTD13-202ENST00000561540 NESP48681 1621 aa36.71■■■■□ 3.47
KCTD13-202ENST00000561540 CHIC1Q5VXU3 224 aa36.6■■■■□ 3.45
KCTD13-202ENST00000561540 ABCC8Q09428 1581 aa36.51■■■■□ 3.43
KCTD13-202ENST00000561540 FANCD2Q9BXW9 1451 aa36.45■■■■□ 3.43
KCTD13-202ENST00000561540 PDS5BQ9NTI5 1447 aa36.42■■■■□ 3.42
KCTD13-202ENST00000561540 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP36.34■■■■□ 3.41
KCTD13-202ENST00000561540 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa36.34■■■■□ 3.41
KCTD13-202ENST00000561540 CEP164Q9UPV0 1460 aa36.29■■■■□ 3.4
KCTD13-202ENST00000561540 SYNJ1O43426 1573 aa36.26■■■■□ 3.39
KCTD13-202ENST00000561540 TRIM41Q8WV44 630 aa36.25■■■■□ 3.39
KCTD13-202ENST00000561540 CUX1P39880 1505 aa36.2■■■■□ 3.39
KCTD13-202ENST00000561540 TOP2BQ02880 1626 aa36.18■■■■□ 3.38
KCTD13-202ENST00000561540 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa36.18■■■■□ 3.38
KCTD13-202ENST00000561540 DNMBPQ6XZF7 1577 aa36.07■■■■□ 3.36
KCTD13-202ENST00000561540 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP36.06■■■■□ 3.36
KCTD13-202ENST00000561540 ERCC6Q03468 1493 aa36.06■■■■□ 3.36
KCTD13-202ENST00000561540 TOPBP1Q92547 1522 aa36.02■■■■□ 3.36
KCTD13-202ENST00000561540 MRC2Q9UBG0 1479 aa35.99■■■■□ 3.35
KCTD13-202ENST00000561540 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP35.91■■■■□ 3.34
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KCTD13-202ENST00000561540 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa35.59■■■■□ 3.29
KCTD13-202ENST00000561540 WDR97A6NE52 1622 aa35.57■■■■□ 3.29
KCTD13-202ENST00000561540 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa35.57■■■■□ 3.28
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KCTD13-202ENST00000561540 KIF27Q86VH2 1401 aa35.48■■■■□ 3.27
KCTD13-202ENST00000561540 IFT140Q96RY7 1462 aa35.47■■■■□ 3.27
KCTD13-202ENST00000561540 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa35.36■■■■□ 3.25
KCTD13-202ENST00000561540 CSRNP3Q8WYN3 585 aa35.34■■■■□ 3.25
KCTD13-202ENST00000561540 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP35.32■■■■□ 3.24
KCTD13-202ENST00000561540 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP35.27■■■■□ 3.24
KCTD13-202ENST00000561540 GAPVD1Q14C86 1478 aa35.26■■■■□ 3.23
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KCTD13-202ENST00000561540 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP35.21■■■■□ 3.23
KCTD13-202ENST00000561540 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP35.19■■■■□ 3.22
KCTD13-202ENST00000561540 PBRM1Q86U86 1689 aa35.16■■■■□ 3.22
KCTD13-202ENST00000561540 ERICH3Q5RHP9 1530 aa35.16■■■■□ 3.22
KCTD13-202ENST00000561540 KIF21BO75037 1637 aa35.15■■■■□ 3.22
KCTD13-202ENST00000561540 PRXQ9BXM0 1461 aa35.13■■■■□ 3.21
KCTD13-202ENST00000561540 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa35.12■■■■□ 3.21
KCTD13-202ENST00000561540 GRIN2BQ13224 1484 aa35.08■■■■□ 3.21
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KCTD13-202ENST00000561540 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa35.02■■■■□ 3.2
KCTD13-202ENST00000561540 GOLGA3Q08378 1498 aa35.01■■■■□ 3.19
KCTD13-202ENST00000561540 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa35■■■■□ 3.19
KCTD13-202ENST00000561540 EHMT2Q96KQ7 1210 aa34.97■■■■□ 3.19
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KCTD13-202ENST00000561540 TNIKQ9UKE5 1360 aa34.78■■■■□ 3.16
KCTD13-202ENST00000561540 UBTFP17480 764 aaKnown RBP34.78■■■■□ 3.16
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KCTD13-202ENST00000561540 GRIN2AQ12879 1464 aa34.65■■■■□ 3.14
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KCTD13-202ENST00000561540 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP34.58■■■■□ 3.13
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KCTD13-202ENST00000561540 CEP162Q5TB80 1403 aa34.54■■■■□ 3.12
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