RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000340646.9

CPED1-202, Transcript of cadherin like and PC-esterase domain containing 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CPED1, Length 1,056 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPED1-202ENST00000340646 NISCHQ9Y2I1 1504 aa51.06■■■■■ 5.76
CPED1-202ENST00000340646 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa45.23■■■■■ 4.83
CPED1-202ENST00000340646 ABCC9O60706 1549 aa43.8■■■■■ 4.6
CPED1-202ENST00000340646 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP42.67■■■■■ 4.42
CPED1-202ENST00000340646 NACADO15069 1562 aa42.35■■■■■ 4.37
CPED1-202ENST00000340646 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa42.29■■■■■ 4.36
CPED1-202ENST00000340646 MYO15BQ96JP2 1530 aa42.28■■■■■ 4.36
CPED1-202ENST00000340646 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa42.27■■■■■ 4.36
CPED1-202ENST00000340646 DCAF8L2P0C7V8 631 aa42.24■■■■■ 4.35
CPED1-202ENST00000340646 UNC13AQ9UPW8 1703 aa41.52■■■■■ 4.24
CPED1-202ENST00000340646 SCRIBQ14160 1630 aa41.3■■■■■ 4.2
CPED1-202ENST00000340646 BICRAQ9NZM4 1560 aa41.16■■■■■ 4.18
CPED1-202ENST00000340646 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP40.95■■■■■ 4.15
CPED1-202ENST00000340646 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa40.61■■■■■ 4.09
CPED1-202ENST00000340646 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP39.95■■■■□ 3.99
CPED1-202ENST00000340646 DNAJC5BQ9UF47 199 aa39.88■■■■□ 3.97
CPED1-202ENST00000340646 CECR2Q9BXF3 1484 aa39.78■■■■□ 3.96
CPED1-202ENST00000340646 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa39.69■■■■□ 3.94
CPED1-202ENST00000340646 SMARCA4P51532 1647 aa39.56■■■■□ 3.92
CPED1-202ENST00000340646 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP39.5■■■■□ 3.91
CPED1-202ENST00000340646 MROH2BQ7Z745 1585 aa39.41■■■■□ 3.9
CPED1-202ENST00000340646 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa39.2■■■■□ 3.87
CPED1-202ENST00000340646 PEG3Q9GZU2 1588 aa39.18■■■■□ 3.86
CPED1-202ENST00000340646 SMARCA2P51531 1590 aa39.12■■■■□ 3.85
CPED1-202ENST00000340646 NCAPD3P42695 1498 aa39.1■■■■□ 3.85
CPED1-202ENST00000340646 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP39.06■■■■□ 3.84
CPED1-202ENST00000340646 WIZO95785 1651 aa39■■■■□ 3.83
CPED1-202ENST00000340646 HMGXB3Q12766 1538 aa38.97■■■■□ 3.83
CPED1-202ENST00000340646 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP38.85■■■■□ 3.81
CPED1-202ENST00000340646 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP38.58■■■■□ 3.77
CPED1-202ENST00000340646 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP38.23■■■■□ 3.71
CPED1-202ENST00000340646 CCDC88BA6NC98 1476 aa38.11■■■■□ 3.69
CPED1-202ENST00000340646 NESP48681 1621 aa38.09■■■■□ 3.69
CPED1-202ENST00000340646 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa37.98■■■■□ 3.67
CPED1-202ENST00000340646 CADPSQ9ULU8 1353 aa37.93■■■■□ 3.66
CPED1-202ENST00000340646 CFTRP13569 1480 aa37.85■■■■□ 3.65
CPED1-202ENST00000340646 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa37.68■■■■□ 3.62
CPED1-202ENST00000340646 PRDM2Q13029 1718 aa37.67■■■■□ 3.62
CPED1-202ENST00000340646 PDS5BQ9NTI5 1447 aa37.62■■■■□ 3.61
CPED1-202ENST00000340646 ERCC6Q03468 1493 aa37.61■■■■□ 3.61
CPED1-202ENST00000340646 FANCD2Q9BXW9 1451 aa37.52■■■■□ 3.6
CPED1-202ENST00000340646 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP37.47■■■■□ 3.59
CPED1-202ENST00000340646 CEP164Q9UPV0 1460 aa37.42■■■■□ 3.58
CPED1-202ENST00000340646 MRC2Q9UBG0 1479 aa37.3■■■■□ 3.56
CPED1-202ENST00000340646 WDR62O43379 1518 aa37.22■■■■□ 3.55
CPED1-202ENST00000340646 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP37.2■■■■□ 3.55
CPED1-202ENST00000340646 CUX2O14529 1486 aa37.13■■■■□ 3.54
CPED1-202ENST00000340646 TOPBP1Q92547 1522 aa37.02■■■■□ 3.52
CPED1-202ENST00000340646 DNMBPQ6XZF7 1577 aa37■■■■□ 3.51
CPED1-202ENST00000340646 CUX1P39880 1505 aa36.94■■■■□ 3.5
CPED1-202ENST00000340646 ABCC8Q09428 1581 aa36.91■■■■□ 3.5
CPED1-202ENST00000340646 SYNJ1O43426 1573 aa36.77■■■■□ 3.48
CPED1-202ENST00000340646 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP36.76■■■■□ 3.47
CPED1-202ENST00000340646 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP36.74■■■■□ 3.47
CPED1-202ENST00000340646 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa36.74■■■■□ 3.47
CPED1-202ENST00000340646 TOP2BQ02880 1626 aa36.7■■■■□ 3.47
CPED1-202ENST00000340646 FGD5Q6ZNL6 1462 aa36.69■■■■□ 3.46
CPED1-202ENST00000340646 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP36.64■■■■□ 3.46
CPED1-202ENST00000340646 IFT140Q96RY7 1462 aa36.62■■■■□ 3.45
CPED1-202ENST00000340646 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa36.57■■■■□ 3.45
CPED1-202ENST00000340646 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP36.51■■■■□ 3.44
CPED1-202ENST00000340646 SOGA1O94964 1423 aa36.51■■■■□ 3.43
CPED1-202ENST00000340646 WDR97A6NE52 1622 aa36.49■■■■□ 3.43
CPED1-202ENST00000340646 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP36.39■■■■□ 3.42
CPED1-202ENST00000340646 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa36.36■■■■□ 3.41
CPED1-202ENST00000340646 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP36.3■■■■□ 3.43e-6■■■□□ 15.2
CPED1-202ENST00000340646 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP36.27■■■■□ 3.4
CPED1-202ENST00000340646 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa36.25■■■■□ 3.39
CPED1-202ENST00000340646 PBRM1Q86U86 1689 aa36.11■■■■□ 3.37
CPED1-202ENST00000340646 GAPVD1Q14C86 1478 aa36.11■■■■□ 3.37
CPED1-202ENST00000340646 GRIN2BQ13224 1484 aa36.05■■■■□ 3.36
CPED1-202ENST00000340646 TRIM41Q8WV44 630 aa36.04■■■■□ 3.36
CPED1-202ENST00000340646 CHIC1Q5VXU3 224 aa36.01■■■■□ 3.36
CPED1-202ENST00000340646 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa35.99■■■■□ 3.35
CPED1-202ENST00000340646 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP35.92■■■■□ 3.34
CPED1-202ENST00000340646 ERICH3Q5RHP9 1530 aa35.91■■■■□ 3.34
CPED1-202ENST00000340646 KIF27Q86VH2 1401 aa35.91■■■■□ 3.34
CPED1-202ENST00000340646 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa35.88■■■■□ 3.33
CPED1-202ENST00000340646 CHD1O14646 1710 aa35.86■■■■□ 3.33
CPED1-202ENST00000340646 ADAMTS12P58397 1594 aa35.85■■■■□ 3.33
CPED1-202ENST00000340646 SYNJ2O15056 1496 aa35.78■■■■□ 3.32
CPED1-202ENST00000340646 IGF1RP08069 1367 aa35.77■■■■□ 3.32
CPED1-202ENST00000340646 FHAD1B1AJZ9 1412 aa35.71■■■■□ 3.31
CPED1-202ENST00000340646 CUL7Q14999 1698 aa35.68■■■■□ 3.3
CPED1-202ENST00000340646 GRIN2AQ12879 1464 aa35.62■■■■□ 3.29
CPED1-202ENST00000340646 FBLN2P98095 1184 aa35.6■■■■□ 3.29
CPED1-202ENST00000340646 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP35.59■■■■□ 3.29
CPED1-202ENST00000340646 OSCARQ8IYS5 282 aa35.55■■■■□ 3.28
CPED1-202ENST00000340646 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa35.52■■■■□ 3.28
CPED1-202ENST00000340646 CEP170Q5SW79 1584 aa35.5■■■■□ 3.27
CPED1-202ENST00000340646 CLASP1Q7Z460 1538 aa35.49■■■■□ 3.27
CPED1-202ENST00000340646 EEA1Q15075 1411 aa35.49■■■■□ 3.27
CPED1-202ENST00000340646 NUP160Q12769 1436 aa35.48■■■■□ 3.27
CPED1-202ENST00000340646 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa35.46■■■■□ 3.27
CPED1-202ENST00000340646 PRXQ9BXM0 1461 aa35.43■■■■□ 3.26
CPED1-202ENST00000340646 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa35.38■■■■□ 3.25
CPED1-202ENST00000340646 CSRNP3Q8WYN3 585 aa35.36■■■■□ 3.25
CPED1-202ENST00000340646 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP35.33■■■■□ 3.25
CPED1-202ENST00000340646 SHROOM2Q13796 1616 aa35.21■■■■□ 3.23
CPED1-202ENST00000340646 KIF21BO75037 1637 aa35.21■■■■□ 3.23
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