RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442975.6

CDKN3-204, Transcript of cyclin dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CDKN3, Length 727 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3-204ENST00000442975 NISCHQ9Y2I1 1504 aa51.62■■■■■ 5.85
CDKN3-204ENST00000442975 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa45.97■■■■■ 4.95
CDKN3-204ENST00000442975 ABCC9O60706 1549 aa45.47■■■■■ 4.87
CDKN3-204ENST00000442975 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa43.5■■■■■ 4.55
CDKN3-204ENST00000442975 DCAF8L2P0C7V8 631 aa43.39■■■■■ 4.54
CDKN3-204ENST00000442975 NACADO15069 1562 aa43.33■■■■■ 4.53
CDKN3-204ENST00000442975 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP42.96■■■■■ 4.47
CDKN3-204ENST00000442975 MYO15BQ96JP2 1530 aa42.92■■■■■ 4.46
CDKN3-204ENST00000442975 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa42.63■■■■■ 4.42
CDKN3-204ENST00000442975 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP42.44■■■■■ 4.38
CDKN3-204ENST00000442975 UNC13AQ9UPW8 1703 aa42.37■■■■■ 4.37
CDKN3-204ENST00000442975 BICRAQ9NZM4 1560 aa42.16■■■■■ 4.34
CDKN3-204ENST00000442975 SCRIBQ14160 1630 aa42.07■■■■■ 4.33
CDKN3-204ENST00000442975 DNAJC5BQ9UF47 199 aa41.95■■■■■ 4.31
CDKN3-204ENST00000442975 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa41.7■■■■■ 4.27
CDKN3-204ENST00000442975 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP41.12■■■■■ 4.17
CDKN3-204ENST00000442975 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa41.03■■■■■ 4.16
CDKN3-204ENST00000442975 CECR2Q9BXF3 1484 aa40.87■■■■■ 4.13
CDKN3-204ENST00000442975 SMARCA4P51532 1647 aa40.13■■■■■ 4.01
CDKN3-204ENST00000442975 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP40.05■■■■■ 4
CDKN3-204ENST00000442975 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa40.01■■■■■ 4
CDKN3-204ENST00000442975 NCAPD3P42695 1498 aa40■■■■□ 3.99
CDKN3-204ENST00000442975 SMARCA2P51531 1590 aa39.93■■■■□ 3.98
CDKN3-204ENST00000442975 MROH2BQ7Z745 1585 aa39.8■■■■□ 3.96
CDKN3-204ENST00000442975 HMGXB3Q12766 1538 aa39.79■■■■□ 3.96
CDKN3-204ENST00000442975 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP39.71■■■■□ 3.95
CDKN3-204ENST00000442975 PEG3Q9GZU2 1588 aa39.68■■■■□ 3.94
CDKN3-204ENST00000442975 WIZO95785 1651 aa39.32■■■■□ 3.89
CDKN3-204ENST00000442975 ERCC6Q03468 1493 aa39.24■■■■□ 3.87
CDKN3-204ENST00000442975 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP39.23■■■■□ 3.87
CDKN3-204ENST00000442975 NESP48681 1621 aa39.22■■■■□ 3.87
CDKN3-204ENST00000442975 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa38.99■■■■□ 3.83
CDKN3-204ENST00000442975 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP38.93■■■■□ 3.82
CDKN3-204ENST00000442975 CADPSQ9ULU8 1353 aa38.85■■■■□ 3.81
CDKN3-204ENST00000442975 CUX2O14529 1486 aa38.85■■■■□ 3.81
CDKN3-204ENST00000442975 PDS5BQ9NTI5 1447 aa38.8■■■■□ 3.8
CDKN3-204ENST00000442975 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa38.66■■■■□ 3.78
CDKN3-204ENST00000442975 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP38.65■■■■□ 3.78
CDKN3-204ENST00000442975 CFTRP13569 1480 aa38.54■■■■□ 3.76
CDKN3-204ENST00000442975 CCDC88BA6NC98 1476 aa38.46■■■■□ 3.75
CDKN3-204ENST00000442975 FANCD2Q9BXW9 1451 aa38.45■■■■□ 3.75
CDKN3-204ENST00000442975 MRC2Q9UBG0 1479 aa38.45■■■■□ 3.75
CDKN3-204ENST00000442975 CEP164Q9UPV0 1460 aa38.44■■■■□ 3.74
CDKN3-204ENST00000442975 WDR62O43379 1518 aa38.29■■■■□ 3.72
CDKN3-204ENST00000442975 PRDM2Q13029 1718 aa38.09■■■■□ 3.69
CDKN3-204ENST00000442975 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP38.08■■■■□ 3.69
CDKN3-204ENST00000442975 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP38.07■■■■□ 3.68
CDKN3-204ENST00000442975 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa38.03■■■■□ 3.68
CDKN3-204ENST00000442975 TOPBP1Q92547 1522 aa37.77■■■■□ 3.64
CDKN3-204ENST00000442975 DNMBPQ6XZF7 1577 aa37.69■■■■□ 3.62
CDKN3-204ENST00000442975 ABCC8Q09428 1581 aa37.68■■■■□ 3.62
CDKN3-204ENST00000442975 IFT140Q96RY7 1462 aa37.63■■■■□ 3.61
CDKN3-204ENST00000442975 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP37.51■■■■□ 3.59
CDKN3-204ENST00000442975 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP37.45■■■■□ 3.59
CDKN3-204ENST00000442975 CUX1P39880 1505 aa37.37■■■■□ 3.57
CDKN3-204ENST00000442975 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP37.33■■■■□ 3.57
CDKN3-204ENST00000442975 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP37.33■■■■□ 3.57
CDKN3-204ENST00000442975 FGD5Q6ZNL6 1462 aa37.32■■■■□ 3.56
CDKN3-204ENST00000442975 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa37.3■■■■□ 3.56
CDKN3-204ENST00000442975 SOGA1O94964 1423 aa37.27■■■■□ 3.56
CDKN3-204ENST00000442975 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP37.24■■■■□ 3.55
CDKN3-204ENST00000442975 OSCARQ8IYS5 282 aa37.18■■■■□ 3.54
CDKN3-204ENST00000442975 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP37.15■■■■□ 3.54
CDKN3-204ENST00000442975 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP37.03■■■■□ 3.52
CDKN3-204ENST00000442975 WDR97A6NE52 1622 aa36.99■■■■□ 3.51
CDKN3-204ENST00000442975 SYNJ1O43426 1573 aa36.94■■■■□ 3.5
CDKN3-204ENST00000442975 FBLN2P98095 1184 aa36.93■■■■□ 3.5
CDKN3-204ENST00000442975 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa36.93■■■■□ 3.5
CDKN3-204ENST00000442975 TOP2BQ02880 1626 aa36.92■■■■□ 3.5
CDKN3-204ENST00000442975 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa36.9■■■■□ 3.5
CDKN3-204ENST00000442975 GRIN2BQ13224 1484 aa36.89■■■■□ 3.5
CDKN3-204ENST00000442975 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa36.88■■■■□ 3.5
CDKN3-204ENST00000442975 CHD1O14646 1710 aa36.85■■■■□ 3.49
CDKN3-204ENST00000442975 GAPVD1Q14C86 1478 aa36.84■■■■□ 3.49
CDKN3-204ENST00000442975 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP36.81■■■■□ 3.48
CDKN3-204ENST00000442975 TRIM41Q8WV44 630 aa36.79■■■■□ 3.48
CDKN3-204ENST00000442975 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa36.77■■■■□ 3.48
CDKN3-204ENST00000442975 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP36.73■■■■□ 3.47
CDKN3-204ENST00000442975 PBRM1Q86U86 1689 aa36.72■■■■□ 3.47
CDKN3-204ENST00000442975 SYNJ2O15056 1496 aa36.69■■■■□ 3.46
CDKN3-204ENST00000442975 ARHGEF11O15085 1522 aa36.62■■■■□ 3.45
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CDKN3-204ENST00000442975 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa36.62■■■■□ 3.45
CDKN3-204ENST00000442975 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa36.62■■■■□ 3.45
CDKN3-204ENST00000442975 CLASP1Q7Z460 1538 aa36.49■■■■□ 3.43
CDKN3-204ENST00000442975 ADAMTS12P58397 1594 aa36.49■■■■□ 3.43
CDKN3-204ENST00000442975 ERICH3Q5RHP9 1530 aa36.44■■■■□ 3.42
CDKN3-204ENST00000442975 GRIN2AQ12879 1464 aa36.42■■■■□ 3.42
CDKN3-204ENST00000442975 FHAD1B1AJZ9 1412 aa36.41■■■■□ 3.42
CDKN3-204ENST00000442975 CYB5RLQ6IPT4 315 aa36.32■■■■□ 3.4
CDKN3-204ENST00000442975 ARAP1Q96P48 1450 aa36.31■■■■□ 3.4
CDKN3-204ENST00000442975 KIF27Q86VH2 1401 aa36.28■■■■□ 3.4
CDKN3-204ENST00000442975 NUP160Q12769 1436 aa36.25■■■■□ 3.39
CDKN3-204ENST00000442975 CEP170Q5SW79 1584 aa36.23■■■■□ 3.39
CDKN3-204ENST00000442975 IGF1RP08069 1367 aa36.13■■■■□ 3.37
CDKN3-204ENST00000442975 CUL7Q14999 1698 aa36.03■■■■□ 3.36
CDKN3-204ENST00000442975 ERCC6L2Q5T890 1561 aa35.99■■■■□ 3.35
CDKN3-204ENST00000442975 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa35.96■■■■□ 3.35
CDKN3-204ENST00000442975 SHROOM2Q13796 1616 aa35.95■■■■□ 3.35
CDKN3-204ENST00000442975 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa35.93■■■■□ 3.34
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