Protein–RNA interactions for Protein: Q2M2I5

KRT24, Keratin, type I cytoskeletal 24, humanhuman

Predictions only

Length 525 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT24Q2M2I5 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
KRT24Q2M2I5 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
KRT24Q2M2I5 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
KRT24Q2M2I5 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
KRT24Q2M2I5 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
KRT24Q2M2I5 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
KRT24Q2M2I5 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
KRT24Q2M2I5 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
KRT24Q2M2I5 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
KRT24Q2M2I5 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
KRT24Q2M2I5 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
KRT24Q2M2I5 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
KRT24Q2M2I5 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
KRT24Q2M2I5 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
KRT24Q2M2I5 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
KRT24Q2M2I5 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
KRT24Q2M2I5 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
KRT24Q2M2I5 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
KRT24Q2M2I5 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
KRT24Q2M2I5 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
KRT24Q2M2I5 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
KRT24Q2M2I5 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
KRT24Q2M2I5 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
KRT24Q2M2I5 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
KRT24Q2M2I5 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
KRT24Q2M2I5 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
KRT24Q2M2I5 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
KRT24Q2M2I5 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
KRT24Q2M2I5 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
KRT24Q2M2I5 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
KRT24Q2M2I5 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
KRT24Q2M2I5 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
KRT24Q2M2I5 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
KRT24Q2M2I5 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
KRT24Q2M2I5 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
KRT24Q2M2I5 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
KRT24Q2M2I5 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
KRT24Q2M2I5 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
KRT24Q2M2I5 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
KRT24Q2M2I5 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
KRT24Q2M2I5 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
KRT24Q2M2I5 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
KRT24Q2M2I5 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
KRT24Q2M2I5 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
KRT24Q2M2I5 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
KRT24Q2M2I5 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
KRT24Q2M2I5 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
KRT24Q2M2I5 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
KRT24Q2M2I5 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
KRT24Q2M2I5 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
KRT24Q2M2I5 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
KRT24Q2M2I5 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
KRT24Q2M2I5 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
KRT24Q2M2I5 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
KRT24Q2M2I5 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
KRT24Q2M2I5 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
KRT24Q2M2I5 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
KRT24Q2M2I5 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
KRT24Q2M2I5 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
KRT24Q2M2I5 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
KRT24Q2M2I5 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
KRT24Q2M2I5 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
KRT24Q2M2I5 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
KRT24Q2M2I5 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
KRT24Q2M2I5 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
KRT24Q2M2I5 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
KRT24Q2M2I5 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
KRT24Q2M2I5 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
KRT24Q2M2I5 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
KRT24Q2M2I5 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
KRT24Q2M2I5 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
KRT24Q2M2I5 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
KRT24Q2M2I5 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
KRT24Q2M2I5 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
KRT24Q2M2I5 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
KRT24Q2M2I5 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
KRT24Q2M2I5 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC27.58■■■□□ 2.01
KRT24Q2M2I5 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
KRT24Q2M2I5 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
KRT24Q2M2I5 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
KRT24Q2M2I5 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
KRT24Q2M2I5 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
KRT24Q2M2I5 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
KRT24Q2M2I5 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
KRT24Q2M2I5 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
KRT24Q2M2I5 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
KRT24Q2M2I5 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
KRT24Q2M2I5 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2
KRT24Q2M2I5 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2
KRT24Q2M2I5 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
KRT24Q2M2I5 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
KRT24Q2M2I5 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
KRT24Q2M2I5 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
KRT24Q2M2I5 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
KRT24Q2M2I5 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
KRT24Q2M2I5 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
KRT24Q2M2I5 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC27.57■■■□□ 2
KRT24Q2M2I5 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
KRT24Q2M2I5 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
KRT24Q2M2I5 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms