RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000370206.8

CNN3-201, Transcript of calponin 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CNN3, Length 2,165 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNN3-201ENST00000370206 NISCHQ9Y2I1 1504 aa46.87■■■■■ 5.09
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CNN3-201ENST00000370206 EHMT2Q96KQ7 1210 aa35■■■■□ 3.19
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CNN3-201ENST00000370206 CSRNP3Q8WYN3 585 aa34.52■■■■□ 3.12
CNN3-201ENST00000370206 TNIKQ9UKE5 1360 aa34.52■■■■□ 3.12
CNN3-201ENST00000370206 SYNJ1O43426 1573 aa34.51■■■■□ 3.11
CNN3-201ENST00000370206 CEP162Q5TB80 1403 aa34.48■■■■□ 3.11
CNN3-201ENST00000370206 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP34.46■■■■□ 3.11
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CNN3-201ENST00000370206 HMGXB3Q12766 1538 aa34.37■■■■□ 3.09
CNN3-201ENST00000370206 NCAPD3P42695 1498 aa34.33■■■■□ 3.09
CNN3-201ENST00000370206 KIF21BO75037 1637 aa34.26■■■■□ 3.07
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CNN3-201ENST00000370206 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa34.13■■■■□ 3.05
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CNN3-201ENST00000370206 CUX2O14529 1486 aa33.34■■■□□ 2.93
CNN3-201ENST00000370206 FGD5Q6ZNL6 1462 aa33.31■■■□□ 2.92
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