Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6N3

CLCA3P, Calcium-activated chloride channel regulator family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCA3PQ9Y6N3 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CLCA3PQ9Y6N3 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CLCA3PQ9Y6N3 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CLCA3PQ9Y6N3 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CLCA3PQ9Y6N3 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CLCA3PQ9Y6N3 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CLCA3PQ9Y6N3 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CLCA3PQ9Y6N3 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CLCA3PQ9Y6N3 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CLCA3PQ9Y6N3 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CLCA3PQ9Y6N3 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CLCA3PQ9Y6N3 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
CLCA3PQ9Y6N3 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CLCA3PQ9Y6N3 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CLCA3PQ9Y6N3 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CLCA3PQ9Y6N3 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CLCA3PQ9Y6N3 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CLCA3PQ9Y6N3 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CLCA3PQ9Y6N3 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CLCA3PQ9Y6N3 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CLCA3PQ9Y6N3 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CLCA3PQ9Y6N3 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CLCA3PQ9Y6N3 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CLCA3PQ9Y6N3 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CLCA3PQ9Y6N3 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CLCA3PQ9Y6N3 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CLCA3PQ9Y6N3 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CLCA3PQ9Y6N3 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CLCA3PQ9Y6N3 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CLCA3PQ9Y6N3 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CLCA3PQ9Y6N3 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CLCA3PQ9Y6N3 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CLCA3PQ9Y6N3 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CLCA3PQ9Y6N3 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CLCA3PQ9Y6N3 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CLCA3PQ9Y6N3 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CLCA3PQ9Y6N3 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CLCA3PQ9Y6N3 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CLCA3PQ9Y6N3 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CLCA3PQ9Y6N3 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CLCA3PQ9Y6N3 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CLCA3PQ9Y6N3 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CLCA3PQ9Y6N3 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CLCA3PQ9Y6N3 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CLCA3PQ9Y6N3 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CLCA3PQ9Y6N3 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CLCA3PQ9Y6N3 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CLCA3PQ9Y6N3 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CLCA3PQ9Y6N3 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CLCA3PQ9Y6N3 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLCA3PQ9Y6N3 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLCA3PQ9Y6N3 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLCA3PQ9Y6N3 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CLCA3PQ9Y6N3 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CLCA3PQ9Y6N3 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CLCA3PQ9Y6N3 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CLCA3PQ9Y6N3 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CLCA3PQ9Y6N3 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CLCA3PQ9Y6N3 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CLCA3PQ9Y6N3 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CLCA3PQ9Y6N3 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CLCA3PQ9Y6N3 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLCA3PQ9Y6N3 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLCA3PQ9Y6N3 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLCA3PQ9Y6N3 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CLCA3PQ9Y6N3 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLCA3PQ9Y6N3 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CLCA3PQ9Y6N3 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CLCA3PQ9Y6N3 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CLCA3PQ9Y6N3 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CLCA3PQ9Y6N3 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CLCA3PQ9Y6N3 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CLCA3PQ9Y6N3 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CLCA3PQ9Y6N3 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CLCA3PQ9Y6N3 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CLCA3PQ9Y6N3 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CLCA3PQ9Y6N3 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CLCA3PQ9Y6N3 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CLCA3PQ9Y6N3 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CLCA3PQ9Y6N3 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CLCA3PQ9Y6N3 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CLCA3PQ9Y6N3 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CLCA3PQ9Y6N3 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CLCA3PQ9Y6N3 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CLCA3PQ9Y6N3 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CLCA3PQ9Y6N3 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CLCA3PQ9Y6N3 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CLCA3PQ9Y6N3 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CLCA3PQ9Y6N3 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CLCA3PQ9Y6N3 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CLCA3PQ9Y6N3 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CLCA3PQ9Y6N3 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CLCA3PQ9Y6N3 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CLCA3PQ9Y6N3 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CLCA3PQ9Y6N3 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CLCA3PQ9Y6N3 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CLCA3PQ9Y6N3 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CLCA3PQ9Y6N3 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CLCA3PQ9Y6N3 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CLCA3PQ9Y6N3 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.9 ms