Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y543

HES2, Transcription factor HES-2, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HES2Q9Y543 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
HES2Q9Y543 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
HES2Q9Y543 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
HES2Q9Y543 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
HES2Q9Y543 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
HES2Q9Y543 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
HES2Q9Y543 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
HES2Q9Y543 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
HES2Q9Y543 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
HES2Q9Y543 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
HES2Q9Y543 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
HES2Q9Y543 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
HES2Q9Y543 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
HES2Q9Y543 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
HES2Q9Y543 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
HES2Q9Y543 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
HES2Q9Y543 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
HES2Q9Y543 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
HES2Q9Y543 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
HES2Q9Y543 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
HES2Q9Y543 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
HES2Q9Y543 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
HES2Q9Y543 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
HES2Q9Y543 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
HES2Q9Y543 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
HES2Q9Y543 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
HES2Q9Y543 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
HES2Q9Y543 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
HES2Q9Y543 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
HES2Q9Y543 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
HES2Q9Y543 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
HES2Q9Y543 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
HES2Q9Y543 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC29.51■■■□□ 2.32
HES2Q9Y543 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
HES2Q9Y543 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
HES2Q9Y543 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
HES2Q9Y543 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
HES2Q9Y543 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
HES2Q9Y543 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
HES2Q9Y543 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC29.47■■■□□ 2.31
HES2Q9Y543 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
HES2Q9Y543 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
HES2Q9Y543 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
HES2Q9Y543 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
HES2Q9Y543 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
HES2Q9Y543 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
HES2Q9Y543 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
HES2Q9Y543 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
HES2Q9Y543 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
HES2Q9Y543 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
HES2Q9Y543 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
HES2Q9Y543 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
HES2Q9Y543 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
HES2Q9Y543 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
HES2Q9Y543 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
HES2Q9Y543 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
HES2Q9Y543 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
HES2Q9Y543 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
HES2Q9Y543 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
HES2Q9Y543 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
HES2Q9Y543 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC29.35■■■□□ 2.29
HES2Q9Y543 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
HES2Q9Y543 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
HES2Q9Y543 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
HES2Q9Y543 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
HES2Q9Y543 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
HES2Q9Y543 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
HES2Q9Y543 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
HES2Q9Y543 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
HES2Q9Y543 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
HES2Q9Y543 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
HES2Q9Y543 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
HES2Q9Y543 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
HES2Q9Y543 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
HES2Q9Y543 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
HES2Q9Y543 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
HES2Q9Y543 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
HES2Q9Y543 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
HES2Q9Y543 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
HES2Q9Y543 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
HES2Q9Y543 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
HES2Q9Y543 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
HES2Q9Y543 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
HES2Q9Y543 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
HES2Q9Y543 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
HES2Q9Y543 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
HES2Q9Y543 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
HES2Q9Y543 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
HES2Q9Y543 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
HES2Q9Y543 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
HES2Q9Y543 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
HES2Q9Y543 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
HES2Q9Y543 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
HES2Q9Y543 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
HES2Q9Y543 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
HES2Q9Y543 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
HES2Q9Y543 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
HES2Q9Y543 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
HES2Q9Y543 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
HES2Q9Y543 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms