Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K7

KDM2A, Lysine-specific demethylase 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM2AQ9Y2K7 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC39.23■■■■□ 3.87
KDM2AQ9Y2K7 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.23■■■■□ 3.87
KDM2AQ9Y2K7 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC39.22■■■■□ 3.87
KDM2AQ9Y2K7 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC39.21■■■■□ 3.87
KDM2AQ9Y2K7 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC39.2■■■■□ 3.87
KDM2AQ9Y2K7 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC39.19■■■■□ 3.86
KDM2AQ9Y2K7 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC39.18■■■■□ 3.86
KDM2AQ9Y2K7 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC39.17■■■■□ 3.86
KDM2AQ9Y2K7 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.15■■■■□ 3.86
KDM2AQ9Y2K7 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
KDM2AQ9Y2K7 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC39.14■■■■□ 3.86
KDM2AQ9Y2K7 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
KDM2AQ9Y2K7 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.13■■■■□ 3.86
KDM2AQ9Y2K7 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC39.13■■■■□ 3.85
KDM2AQ9Y2K7 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
KDM2AQ9Y2K7 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.1■■■■□ 3.85
KDM2AQ9Y2K7 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.1■■■■□ 3.85
KDM2AQ9Y2K7 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC39.1■■■■□ 3.85
KDM2AQ9Y2K7 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85
KDM2AQ9Y2K7 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC39.08■■■■□ 3.85
KDM2AQ9Y2K7 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC39.07■■■■□ 3.85
KDM2AQ9Y2K7 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC39.07■■■■□ 3.85
KDM2AQ9Y2K7 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC39.07■■■■□ 3.85
KDM2AQ9Y2K7 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC39.07■■■■□ 3.85
KDM2AQ9Y2K7 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
KDM2AQ9Y2K7 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
KDM2AQ9Y2K7 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC39.04■■■■□ 3.84
KDM2AQ9Y2K7 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.04■■■■□ 3.84
KDM2AQ9Y2K7 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC39.04■■■■□ 3.84
KDM2AQ9Y2K7 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC39.03■■■■□ 3.84
KDM2AQ9Y2K7 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC39.01■■■■□ 3.84
KDM2AQ9Y2K7 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC39.01■■■■□ 3.84
KDM2AQ9Y2K7 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC38.99■■■■□ 3.83
KDM2AQ9Y2K7 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC38.98■■■■□ 3.83
KDM2AQ9Y2K7 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC38.97■■■■□ 3.83
KDM2AQ9Y2K7 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.96■■■■□ 3.83
KDM2AQ9Y2K7 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
KDM2AQ9Y2K7 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.95■■■■□ 3.83
KDM2AQ9Y2K7 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
KDM2AQ9Y2K7 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
KDM2AQ9Y2K7 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.91■■■■□ 3.82
KDM2AQ9Y2K7 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC38.9■■■■□ 3.82
KDM2AQ9Y2K7 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.9■■■■□ 3.82
KDM2AQ9Y2K7 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC38.88■■■■□ 3.81
KDM2AQ9Y2K7 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC38.86■■■■□ 3.81
KDM2AQ9Y2K7 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.86■■■■□ 3.81
KDM2AQ9Y2K7 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.85■■■■□ 3.81
KDM2AQ9Y2K7 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC38.85■■■■□ 3.81
KDM2AQ9Y2K7 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.84■■■■□ 3.81
KDM2AQ9Y2K7 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC38.84■■■■□ 3.81
KDM2AQ9Y2K7 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC38.83■■■■□ 3.81
KDM2AQ9Y2K7 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC38.82■■■■□ 3.8
KDM2AQ9Y2K7 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC38.81■■■■□ 3.8
KDM2AQ9Y2K7 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
KDM2AQ9Y2K7 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
KDM2AQ9Y2K7 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.8■■■■□ 3.8
KDM2AQ9Y2K7 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC38.79■■■■□ 3.8
KDM2AQ9Y2K7 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC38.78■■■■□ 3.8
KDM2AQ9Y2K7 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC38.77■■■■□ 3.8
KDM2AQ9Y2K7 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.77■■■■□ 3.8
KDM2AQ9Y2K7 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC38.77■■■■□ 3.8
KDM2AQ9Y2K7 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
KDM2AQ9Y2K7 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
KDM2AQ9Y2K7 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
KDM2AQ9Y2K7 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
KDM2AQ9Y2K7 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
KDM2AQ9Y2K7 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
KDM2AQ9Y2K7 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.71■■■■□ 3.79
KDM2AQ9Y2K7 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.71■■■■□ 3.79
KDM2AQ9Y2K7 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC38.7■■■■□ 3.79
KDM2AQ9Y2K7 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
KDM2AQ9Y2K7 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC38.7■■■■□ 3.79
KDM2AQ9Y2K7 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
KDM2AQ9Y2K7 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.67■■■■□ 3.78
KDM2AQ9Y2K7 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC38.67■■■■□ 3.78
KDM2AQ9Y2K7 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.67■■■■□ 3.78
KDM2AQ9Y2K7 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
KDM2AQ9Y2K7 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
KDM2AQ9Y2K7 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
KDM2AQ9Y2K7 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
KDM2AQ9Y2K7 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
KDM2AQ9Y2K7 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
KDM2AQ9Y2K7 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
KDM2AQ9Y2K7 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.77
KDM2AQ9Y2K7 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC38.63■■■■□ 3.77
KDM2AQ9Y2K7 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC38.63■■■■□ 3.77
KDM2AQ9Y2K7 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
KDM2AQ9Y2K7 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
KDM2AQ9Y2K7 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC38.58■■■■□ 3.77
KDM2AQ9Y2K7 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC38.57■■■■□ 3.77
KDM2AQ9Y2K7 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.76
KDM2AQ9Y2K7 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC38.57■■■■□ 3.76
KDM2AQ9Y2K7 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
KDM2AQ9Y2K7 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC38.55■■■■□ 3.76
KDM2AQ9Y2K7 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
KDM2AQ9Y2K7 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
KDM2AQ9Y2K7 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
KDM2AQ9Y2K7 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
KDM2AQ9Y2K7 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
KDM2AQ9Y2K7 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms