Protein–RNA interactions for Protein: Q9XRX5

HHLA3, HERV-H LTR-associating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHLA3Q9XRX5 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
HHLA3Q9XRX5 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
HHLA3Q9XRX5 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
HHLA3Q9XRX5 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
HHLA3Q9XRX5 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
HHLA3Q9XRX5 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
HHLA3Q9XRX5 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
HHLA3Q9XRX5 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
HHLA3Q9XRX5 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
HHLA3Q9XRX5 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
HHLA3Q9XRX5 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
HHLA3Q9XRX5 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
HHLA3Q9XRX5 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
HHLA3Q9XRX5 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
HHLA3Q9XRX5 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
HHLA3Q9XRX5 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
HHLA3Q9XRX5 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
HHLA3Q9XRX5 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
HHLA3Q9XRX5 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HHLA3Q9XRX5 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HHLA3Q9XRX5 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HHLA3Q9XRX5 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HHLA3Q9XRX5 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HHLA3Q9XRX5 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
HHLA3Q9XRX5 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
HHLA3Q9XRX5 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HHLA3Q9XRX5 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HHLA3Q9XRX5 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HHLA3Q9XRX5 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HHLA3Q9XRX5 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HHLA3Q9XRX5 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HHLA3Q9XRX5 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HHLA3Q9XRX5 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HHLA3Q9XRX5 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HHLA3Q9XRX5 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HHLA3Q9XRX5 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HHLA3Q9XRX5 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HHLA3Q9XRX5 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HHLA3Q9XRX5 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HHLA3Q9XRX5 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HHLA3Q9XRX5 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HHLA3Q9XRX5 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
HHLA3Q9XRX5 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HHLA3Q9XRX5 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HHLA3Q9XRX5 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HHLA3Q9XRX5 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HHLA3Q9XRX5 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HHLA3Q9XRX5 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HHLA3Q9XRX5 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HHLA3Q9XRX5 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HHLA3Q9XRX5 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HHLA3Q9XRX5 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HHLA3Q9XRX5 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HHLA3Q9XRX5 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HHLA3Q9XRX5 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HHLA3Q9XRX5 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
HHLA3Q9XRX5 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
HHLA3Q9XRX5 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
HHLA3Q9XRX5 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
HHLA3Q9XRX5 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
HHLA3Q9XRX5 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
HHLA3Q9XRX5 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
HHLA3Q9XRX5 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
HHLA3Q9XRX5 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
HHLA3Q9XRX5 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
HHLA3Q9XRX5 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
HHLA3Q9XRX5 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
HHLA3Q9XRX5 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
HHLA3Q9XRX5 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
HHLA3Q9XRX5 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
HHLA3Q9XRX5 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
HHLA3Q9XRX5 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
HHLA3Q9XRX5 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
HHLA3Q9XRX5 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
HHLA3Q9XRX5 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
HHLA3Q9XRX5 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
HHLA3Q9XRX5 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
HHLA3Q9XRX5 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
HHLA3Q9XRX5 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
HHLA3Q9XRX5 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
HHLA3Q9XRX5 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
HHLA3Q9XRX5 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
HHLA3Q9XRX5 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
HHLA3Q9XRX5 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
HHLA3Q9XRX5 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
HHLA3Q9XRX5 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
HHLA3Q9XRX5 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
HHLA3Q9XRX5 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HHLA3Q9XRX5 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HHLA3Q9XRX5 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HHLA3Q9XRX5 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
HHLA3Q9XRX5 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HHLA3Q9XRX5 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
HHLA3Q9XRX5 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HHLA3Q9XRX5 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HHLA3Q9XRX5 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
HHLA3Q9XRX5 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
HHLA3Q9XRX5 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
HHLA3Q9XRX5 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
HHLA3Q9XRX5 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.8 ms