Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX8

SHANK2, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHANK2Q9UPX8 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC41.25■■■■■ 4.19
SHANK2Q9UPX8 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC41.24■■■■■ 4.19
SHANK2Q9UPX8 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC41.23■■■■■ 4.19
SHANK2Q9UPX8 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.22■■■■■ 4.19
SHANK2Q9UPX8 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.21■■■■■ 4.19
SHANK2Q9UPX8 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC41.21■■■■■ 4.19
SHANK2Q9UPX8 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC41.2■■■■■ 4.19
SHANK2Q9UPX8 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.19■■■■■ 4.18
SHANK2Q9UPX8 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.18■■■■■ 4.18
SHANK2Q9UPX8 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC41.18■■■■■ 4.18
SHANK2Q9UPX8 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC41.18■■■■■ 4.18
SHANK2Q9UPX8 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.17■■■■■ 4.18
SHANK2Q9UPX8 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC41.17■■■■■ 4.18
SHANK2Q9UPX8 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC41.17■■■■■ 4.18
SHANK2Q9UPX8 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC41.16■■■■■ 4.18
SHANK2Q9UPX8 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC41.15■■■■■ 4.18
SHANK2Q9UPX8 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC41.15■■■■■ 4.18
SHANK2Q9UPX8 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.14■■■■■ 4.18
SHANK2Q9UPX8 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC41.14■■■■■ 4.18
SHANK2Q9UPX8 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC41.13■■■■■ 4.17
SHANK2Q9UPX8 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.13■■■■■ 4.17
SHANK2Q9UPX8 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.13■■■■■ 4.17
SHANK2Q9UPX8 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.09■■■■■ 4.17
SHANK2Q9UPX8 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.09■■■■■ 4.17
SHANK2Q9UPX8 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.09■■■■■ 4.17
SHANK2Q9UPX8 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC41.09■■■■■ 4.17
SHANK2Q9UPX8 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC41.09■■■■■ 4.17
SHANK2Q9UPX8 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC41.08■■■■■ 4.17
SHANK2Q9UPX8 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC41.06■■■■■ 4.16
SHANK2Q9UPX8 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.05■■■■■ 4.16
SHANK2Q9UPX8 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC41.05■■■■■ 4.16
SHANK2Q9UPX8 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC41.05■■■■■ 4.16
SHANK2Q9UPX8 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC41.03■■■■■ 4.16
SHANK2Q9UPX8 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC41.02■■■■■ 4.16
SHANK2Q9UPX8 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC41.01■■■■■ 4.16
SHANK2Q9UPX8 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.01■■■■■ 4.16
SHANK2Q9UPX8 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC41.01■■■■■ 4.16
SHANK2Q9UPX8 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41■■■■■ 4.15
SHANK2Q9UPX8 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.99■■■■■ 4.15
SHANK2Q9UPX8 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC40.98■■■■■ 4.15
SHANK2Q9UPX8 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC40.97■■■■■ 4.15
SHANK2Q9UPX8 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC40.97■■■■■ 4.15
SHANK2Q9UPX8 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC40.96■■■■■ 4.15
SHANK2Q9UPX8 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC40.95■■■■■ 4.15
SHANK2Q9UPX8 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.95■■■■■ 4.15
SHANK2Q9UPX8 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.95■■■■■ 4.15
SHANK2Q9UPX8 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.94■■■■■ 4.15
SHANK2Q9UPX8 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.94■■■■■ 4.14
SHANK2Q9UPX8 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC40.94■■■■■ 4.14
SHANK2Q9UPX8 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.93■■■■■ 4.14
SHANK2Q9UPX8 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC40.93■■■■■ 4.14
SHANK2Q9UPX8 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC40.91■■■■■ 4.14
SHANK2Q9UPX8 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.9■■■■■ 4.14
SHANK2Q9UPX8 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.9■■■■■ 4.14
SHANK2Q9UPX8 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC40.89■■■■■ 4.14
SHANK2Q9UPX8 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC40.89■■■■■ 4.14
SHANK2Q9UPX8 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC40.88■■■■■ 4.14
SHANK2Q9UPX8 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC40.88■■■■■ 4.13
SHANK2Q9UPX8 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC40.88■■■■■ 4.13
SHANK2Q9UPX8 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.87■■■■■ 4.13
SHANK2Q9UPX8 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.87■■■■■ 4.13
SHANK2Q9UPX8 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC40.86■■■■■ 4.13
SHANK2Q9UPX8 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC40.85■■■■■ 4.13
SHANK2Q9UPX8 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.85■■■■■ 4.13
SHANK2Q9UPX8 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC40.85■■■■■ 4.13
SHANK2Q9UPX8 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.84■■■■■ 4.13
SHANK2Q9UPX8 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.84■■■■■ 4.13
SHANK2Q9UPX8 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC40.83■■■■■ 4.13
SHANK2Q9UPX8 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC40.83■■■■■ 4.13
SHANK2Q9UPX8 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.82■■■■■ 4.13
SHANK2Q9UPX8 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC40.82■■■■■ 4.12
SHANK2Q9UPX8 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC40.81■■■■■ 4.12
SHANK2Q9UPX8 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.79■■■■■ 4.12
SHANK2Q9UPX8 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.78■■■■■ 4.12
SHANK2Q9UPX8 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC40.77■■■■■ 4.12
SHANK2Q9UPX8 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.76■■■■■ 4.12
SHANK2Q9UPX8 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC40.74■■■■■ 4.11
SHANK2Q9UPX8 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.73■■■■■ 4.11
SHANK2Q9UPX8 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.73■■■■■ 4.11
SHANK2Q9UPX8 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.73■■■■■ 4.11
SHANK2Q9UPX8 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC40.72■■■■■ 4.11
SHANK2Q9UPX8 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC40.72■■■■■ 4.11
SHANK2Q9UPX8 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.72■■■■■ 4.11
SHANK2Q9UPX8 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.72■■■■■ 4.11
SHANK2Q9UPX8 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC40.71■■■■■ 4.11
SHANK2Q9UPX8 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.71■■■■■ 4.11
SHANK2Q9UPX8 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC40.71■■■■■ 4.11
SHANK2Q9UPX8 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC40.7■■■■■ 4.11
SHANK2Q9UPX8 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC40.69■■■■■ 4.1
SHANK2Q9UPX8 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC40.68■■■■■ 4.1
SHANK2Q9UPX8 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC40.68■■■■■ 4.1
SHANK2Q9UPX8 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC40.68■■■■■ 4.1
SHANK2Q9UPX8 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC40.66■■■■■ 4.1
SHANK2Q9UPX8 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.66■■■■■ 4.1
SHANK2Q9UPX8 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.65■■■■■ 4.1
SHANK2Q9UPX8 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC40.64■■■■■ 4.1
SHANK2Q9UPX8 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC40.64■■■■■ 4.1
SHANK2Q9UPX8 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC40.64■■■■■ 4.1
SHANK2Q9UPX8 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC40.64■■■■■ 4.1
SHANK2Q9UPX8 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC40.64■■■■■ 4.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.9 ms