Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNP9

PPIE, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase E, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPIEQ9UNP9 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PPIEQ9UNP9 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PPIEQ9UNP9 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PPIEQ9UNP9 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PPIEQ9UNP9 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PPIEQ9UNP9 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PPIEQ9UNP9 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PPIEQ9UNP9 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PPIEQ9UNP9 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PPIEQ9UNP9 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PPIEQ9UNP9 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PPIEQ9UNP9 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PPIEQ9UNP9 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PPIEQ9UNP9 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
PPIEQ9UNP9 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
PPIEQ9UNP9 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PPIEQ9UNP9 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PPIEQ9UNP9 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PPIEQ9UNP9 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PPIEQ9UNP9 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
PPIEQ9UNP9 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PPIEQ9UNP9 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PPIEQ9UNP9 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PPIEQ9UNP9 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PPIEQ9UNP9 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PPIEQ9UNP9 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PPIEQ9UNP9 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PPIEQ9UNP9 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PPIEQ9UNP9 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PPIEQ9UNP9 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PPIEQ9UNP9 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PPIEQ9UNP9 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PPIEQ9UNP9 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PPIEQ9UNP9 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PPIEQ9UNP9 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PPIEQ9UNP9 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PPIEQ9UNP9 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PPIEQ9UNP9 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
PPIEQ9UNP9 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PPIEQ9UNP9 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PPIEQ9UNP9 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PPIEQ9UNP9 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PPIEQ9UNP9 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PPIEQ9UNP9 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
PPIEQ9UNP9 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PPIEQ9UNP9 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PPIEQ9UNP9 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PPIEQ9UNP9 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PPIEQ9UNP9 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PPIEQ9UNP9 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PPIEQ9UNP9 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PPIEQ9UNP9 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PPIEQ9UNP9 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PPIEQ9UNP9 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PPIEQ9UNP9 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
PPIEQ9UNP9 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PPIEQ9UNP9 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PPIEQ9UNP9 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PPIEQ9UNP9 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PPIEQ9UNP9 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PPIEQ9UNP9 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PPIEQ9UNP9 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PPIEQ9UNP9 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PPIEQ9UNP9 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PPIEQ9UNP9 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PPIEQ9UNP9 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PPIEQ9UNP9 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PPIEQ9UNP9 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PPIEQ9UNP9 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PPIEQ9UNP9 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PPIEQ9UNP9 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PPIEQ9UNP9 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PPIEQ9UNP9 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PPIEQ9UNP9 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
PPIEQ9UNP9 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PPIEQ9UNP9 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PPIEQ9UNP9 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PPIEQ9UNP9 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PPIEQ9UNP9 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PPIEQ9UNP9 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
PPIEQ9UNP9 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PPIEQ9UNP9 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PPIEQ9UNP9 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PPIEQ9UNP9 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PPIEQ9UNP9 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PPIEQ9UNP9 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PPIEQ9UNP9 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
PPIEQ9UNP9 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PPIEQ9UNP9 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PPIEQ9UNP9 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PPIEQ9UNP9 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PPIEQ9UNP9 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PPIEQ9UNP9 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PPIEQ9UNP9 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
PPIEQ9UNP9 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PPIEQ9UNP9 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PPIEQ9UNP9 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PPIEQ9UNP9 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PPIEQ9UNP9 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PPIEQ9UNP9 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms