Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN66

PCDHB8, Protocadherin beta-8, humanhuman

Predictions only

Length 801 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB8Q9UN66 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
PCDHB8Q9UN66 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PCDHB8Q9UN66 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
PCDHB8Q9UN66 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PCDHB8Q9UN66 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PCDHB8Q9UN66 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PCDHB8Q9UN66 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PCDHB8Q9UN66 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PCDHB8Q9UN66 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
PCDHB8Q9UN66 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PCDHB8Q9UN66 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PCDHB8Q9UN66 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PCDHB8Q9UN66 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PCDHB8Q9UN66 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PCDHB8Q9UN66 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PCDHB8Q9UN66 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PCDHB8Q9UN66 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
PCDHB8Q9UN66 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PCDHB8Q9UN66 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PCDHB8Q9UN66 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PCDHB8Q9UN66 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PCDHB8Q9UN66 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
PCDHB8Q9UN66 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PCDHB8Q9UN66 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PCDHB8Q9UN66 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PCDHB8Q9UN66 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PCDHB8Q9UN66 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PCDHB8Q9UN66 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PCDHB8Q9UN66 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PCDHB8Q9UN66 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PCDHB8Q9UN66 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
PCDHB8Q9UN66 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
PCDHB8Q9UN66 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
PCDHB8Q9UN66 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.23
PCDHB8Q9UN66 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
PCDHB8Q9UN66 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PCDHB8Q9UN66 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PCDHB8Q9UN66 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PCDHB8Q9UN66 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PCDHB8Q9UN66 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PCDHB8Q9UN66 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PCDHB8Q9UN66 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
PCDHB8Q9UN66 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
PCDHB8Q9UN66 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PCDHB8Q9UN66 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
PCDHB8Q9UN66 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PCDHB8Q9UN66 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PCDHB8Q9UN66 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PCDHB8Q9UN66 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PCDHB8Q9UN66 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PCDHB8Q9UN66 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PCDHB8Q9UN66 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PCDHB8Q9UN66 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PCDHB8Q9UN66 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PCDHB8Q9UN66 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
PCDHB8Q9UN66 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PCDHB8Q9UN66 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PCDHB8Q9UN66 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PCDHB8Q9UN66 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PCDHB8Q9UN66 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PCDHB8Q9UN66 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PCDHB8Q9UN66 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PCDHB8Q9UN66 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PCDHB8Q9UN66 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PCDHB8Q9UN66 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PCDHB8Q9UN66 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PCDHB8Q9UN66 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PCDHB8Q9UN66 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PCDHB8Q9UN66 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PCDHB8Q9UN66 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PCDHB8Q9UN66 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PCDHB8Q9UN66 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PCDHB8Q9UN66 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PCDHB8Q9UN66 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PCDHB8Q9UN66 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PCDHB8Q9UN66 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PCDHB8Q9UN66 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PCDHB8Q9UN66 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PCDHB8Q9UN66 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PCDHB8Q9UN66 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
PCDHB8Q9UN66 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
PCDHB8Q9UN66 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
PCDHB8Q9UN66 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PCDHB8Q9UN66 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PCDHB8Q9UN66 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PCDHB8Q9UN66 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PCDHB8Q9UN66 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PCDHB8Q9UN66 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PCDHB8Q9UN66 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PCDHB8Q9UN66 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PCDHB8Q9UN66 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PCDHB8Q9UN66 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PCDHB8Q9UN66 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PCDHB8Q9UN66 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PCDHB8Q9UN66 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PCDHB8Q9UN66 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PCDHB8Q9UN66 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PCDHB8Q9UN66 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PCDHB8Q9UN66 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PCDHB8Q9UN66 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms