Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN30

SCML1, Sex comb on midleg-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCML1Q9UN30 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SCML1Q9UN30 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
SCML1Q9UN30 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SCML1Q9UN30 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SCML1Q9UN30 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
SCML1Q9UN30 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SCML1Q9UN30 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SCML1Q9UN30 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SCML1Q9UN30 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SCML1Q9UN30 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SCML1Q9UN30 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SCML1Q9UN30 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SCML1Q9UN30 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SCML1Q9UN30 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SCML1Q9UN30 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SCML1Q9UN30 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SCML1Q9UN30 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SCML1Q9UN30 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SCML1Q9UN30 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SCML1Q9UN30 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SCML1Q9UN30 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SCML1Q9UN30 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SCML1Q9UN30 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SCML1Q9UN30 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SCML1Q9UN30 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SCML1Q9UN30 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SCML1Q9UN30 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SCML1Q9UN30 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SCML1Q9UN30 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SCML1Q9UN30 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SCML1Q9UN30 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SCML1Q9UN30 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SCML1Q9UN30 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SCML1Q9UN30 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SCML1Q9UN30 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SCML1Q9UN30 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SCML1Q9UN30 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SCML1Q9UN30 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
SCML1Q9UN30 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SCML1Q9UN30 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SCML1Q9UN30 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SCML1Q9UN30 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SCML1Q9UN30 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SCML1Q9UN30 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SCML1Q9UN30 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SCML1Q9UN30 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SCML1Q9UN30 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SCML1Q9UN30 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SCML1Q9UN30 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SCML1Q9UN30 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SCML1Q9UN30 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SCML1Q9UN30 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SCML1Q9UN30 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SCML1Q9UN30 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SCML1Q9UN30 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SCML1Q9UN30 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SCML1Q9UN30 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SCML1Q9UN30 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SCML1Q9UN30 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SCML1Q9UN30 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SCML1Q9UN30 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SCML1Q9UN30 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SCML1Q9UN30 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SCML1Q9UN30 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SCML1Q9UN30 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SCML1Q9UN30 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SCML1Q9UN30 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
SCML1Q9UN30 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SCML1Q9UN30 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SCML1Q9UN30 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SCML1Q9UN30 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SCML1Q9UN30 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SCML1Q9UN30 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SCML1Q9UN30 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SCML1Q9UN30 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SCML1Q9UN30 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SCML1Q9UN30 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SCML1Q9UN30 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SCML1Q9UN30 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SCML1Q9UN30 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SCML1Q9UN30 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SCML1Q9UN30 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SCML1Q9UN30 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SCML1Q9UN30 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
SCML1Q9UN30 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SCML1Q9UN30 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
SCML1Q9UN30 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SCML1Q9UN30 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SCML1Q9UN30 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SCML1Q9UN30 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SCML1Q9UN30 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SCML1Q9UN30 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SCML1Q9UN30 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SCML1Q9UN30 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SCML1Q9UN30 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SCML1Q9UN30 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SCML1Q9UN30 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
SCML1Q9UN30 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
SCML1Q9UN30 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
SCML1Q9UN30 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 170.3 ms