Protein–RNA interactions for Protein: Q9UM73

ALK, ALK tyrosine kinase receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALKQ9UM73 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.63■■■■□ 3.93
ALKQ9UM73 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC39.62■■■■□ 3.93
ALKQ9UM73 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC39.62■■■■□ 3.93
ALKQ9UM73 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.62■■■■□ 3.93
ALKQ9UM73 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC39.6■■■■□ 3.93
ALKQ9UM73 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.6■■■■□ 3.93
ALKQ9UM73 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC39.58■■■■□ 3.93
ALKQ9UM73 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC39.54■■■■□ 3.92
ALKQ9UM73 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC39.53■■■■□ 3.92
ALKQ9UM73 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC39.51■■■■□ 3.92
ALKQ9UM73 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC39.5■■■■□ 3.91
ALKQ9UM73 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC39.48■■■■□ 3.91
ALKQ9UM73 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC39.47■■■■□ 3.91
ALKQ9UM73 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC39.47■■■■□ 3.91
ALKQ9UM73 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC39.46■■■■□ 3.91
ALKQ9UM73 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.45■■■■□ 3.91
ALKQ9UM73 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC39.43■■■■□ 3.9
ALKQ9UM73 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC39.43■■■■□ 3.9
ALKQ9UM73 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC39.42■■■■□ 3.9
ALKQ9UM73 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.42■■■■□ 3.9
ALKQ9UM73 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.42■■■■□ 3.9
ALKQ9UM73 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC39.41■■■■□ 3.9
ALKQ9UM73 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC39.4■■■■□ 3.9
ALKQ9UM73 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.39■■■■□ 3.9
ALKQ9UM73 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC39.38■■■■□ 3.89
ALKQ9UM73 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.37■■■■□ 3.89
ALKQ9UM73 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC39.37■■■■□ 3.89
ALKQ9UM73 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC39.36■■■■□ 3.89
ALKQ9UM73 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC39.35■■■■□ 3.89
ALKQ9UM73 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC39.34■■■■□ 3.89
ALKQ9UM73 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.32■■■■□ 3.89
ALKQ9UM73 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC39.32■■■■□ 3.88
ALKQ9UM73 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
ALKQ9UM73 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
ALKQ9UM73 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.23■■■■□ 3.87
ALKQ9UM73 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
ALKQ9UM73 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
ALKQ9UM73 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC39.19■■■■□ 3.86
ALKQ9UM73 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC39.19■■■■□ 3.86
ALKQ9UM73 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
ALKQ9UM73 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
ALKQ9UM73 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.17■■■■□ 3.86
ALKQ9UM73 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
ALKQ9UM73 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC39.14■■■■□ 3.86
ALKQ9UM73 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.13■■■■□ 3.85
ALKQ9UM73 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC39.13■■■■□ 3.85
ALKQ9UM73 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
ALKQ9UM73 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
ALKQ9UM73 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC39.11■■■■□ 3.85
ALKQ9UM73 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC39.11■■■■□ 3.85
ALKQ9UM73 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
ALKQ9UM73 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85
ALKQ9UM73 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
ALKQ9UM73 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC39.06■■■■□ 3.84
ALKQ9UM73 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC39.05■■■■□ 3.84
ALKQ9UM73 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
ALKQ9UM73 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC39.03■■■■□ 3.84
ALKQ9UM73 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC39.03■■■■□ 3.84
ALKQ9UM73 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39■■■■□ 3.83
ALKQ9UM73 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC38.99■■■■□ 3.83
ALKQ9UM73 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC38.99■■■■□ 3.83
ALKQ9UM73 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC38.98■■■■□ 3.83
ALKQ9UM73 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
ALKQ9UM73 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC38.97■■■■□ 3.83
ALKQ9UM73 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.96■■■■□ 3.83
ALKQ9UM73 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC38.96■■■■□ 3.83
ALKQ9UM73 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC38.96■■■■□ 3.83
ALKQ9UM73 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC38.96■■■■□ 3.83
ALKQ9UM73 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.96■■■■□ 3.83
ALKQ9UM73 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.96■■■■□ 3.83
ALKQ9UM73 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.96■■■■□ 3.83
ALKQ9UM73 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
ALKQ9UM73 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC38.93■■■■□ 3.82
ALKQ9UM73 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.93■■■■□ 3.82
ALKQ9UM73 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC38.92■■■■□ 3.82
ALKQ9UM73 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
ALKQ9UM73 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
ALKQ9UM73 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
ALKQ9UM73 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC38.89■■■■□ 3.82
ALKQ9UM73 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
ALKQ9UM73 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC38.89■■■■□ 3.82
ALKQ9UM73 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC38.88■■■■□ 3.81
ALKQ9UM73 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC38.88■■■■□ 3.81
ALKQ9UM73 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
ALKQ9UM73 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC38.87■■■■□ 3.81
ALKQ9UM73 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC38.85■■■■□ 3.81
ALKQ9UM73 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC38.85■■■■□ 3.81
ALKQ9UM73 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC38.84■■■■□ 3.81
ALKQ9UM73 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC38.84■■■■□ 3.81
ALKQ9UM73 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
ALKQ9UM73 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
ALKQ9UM73 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
ALKQ9UM73 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.8■■■■□ 3.8
ALKQ9UM73 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC38.79■■■■□ 3.8
ALKQ9UM73 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
ALKQ9UM73 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC38.79■■■■□ 3.8
ALKQ9UM73 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC38.78■■■■□ 3.8
ALKQ9UM73 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.78■■■■□ 3.8
ALKQ9UM73 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.78■■■■□ 3.8
ALKQ9UM73 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.77■■■■□ 3.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms