Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULQ0

STRIP2, Striatin-interacting protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRIP2Q9ULQ0 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
STRIP2Q9ULQ0 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
STRIP2Q9ULQ0 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
STRIP2Q9ULQ0 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
STRIP2Q9ULQ0 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
STRIP2Q9ULQ0 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
STRIP2Q9ULQ0 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
STRIP2Q9ULQ0 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
STRIP2Q9ULQ0 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
STRIP2Q9ULQ0 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
STRIP2Q9ULQ0 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
STRIP2Q9ULQ0 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
STRIP2Q9ULQ0 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
STRIP2Q9ULQ0 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
STRIP2Q9ULQ0 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
STRIP2Q9ULQ0 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
STRIP2Q9ULQ0 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
STRIP2Q9ULQ0 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
STRIP2Q9ULQ0 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
STRIP2Q9ULQ0 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
STRIP2Q9ULQ0 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
STRIP2Q9ULQ0 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
STRIP2Q9ULQ0 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
STRIP2Q9ULQ0 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
STRIP2Q9ULQ0 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
STRIP2Q9ULQ0 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
STRIP2Q9ULQ0 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
STRIP2Q9ULQ0 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
STRIP2Q9ULQ0 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
STRIP2Q9ULQ0 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
STRIP2Q9ULQ0 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
STRIP2Q9ULQ0 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
STRIP2Q9ULQ0 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
STRIP2Q9ULQ0 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
STRIP2Q9ULQ0 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
STRIP2Q9ULQ0 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
STRIP2Q9ULQ0 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
STRIP2Q9ULQ0 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
STRIP2Q9ULQ0 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
STRIP2Q9ULQ0 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
STRIP2Q9ULQ0 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
STRIP2Q9ULQ0 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
STRIP2Q9ULQ0 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
STRIP2Q9ULQ0 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
STRIP2Q9ULQ0 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
STRIP2Q9ULQ0 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
STRIP2Q9ULQ0 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
STRIP2Q9ULQ0 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
STRIP2Q9ULQ0 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
STRIP2Q9ULQ0 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
STRIP2Q9ULQ0 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
STRIP2Q9ULQ0 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
STRIP2Q9ULQ0 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
STRIP2Q9ULQ0 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
STRIP2Q9ULQ0 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
STRIP2Q9ULQ0 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
STRIP2Q9ULQ0 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
STRIP2Q9ULQ0 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
STRIP2Q9ULQ0 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
STRIP2Q9ULQ0 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
STRIP2Q9ULQ0 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
STRIP2Q9ULQ0 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.16
STRIP2Q9ULQ0 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
STRIP2Q9ULQ0 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
STRIP2Q9ULQ0 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
STRIP2Q9ULQ0 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
STRIP2Q9ULQ0 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
STRIP2Q9ULQ0 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
STRIP2Q9ULQ0 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
STRIP2Q9ULQ0 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
STRIP2Q9ULQ0 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
STRIP2Q9ULQ0 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
STRIP2Q9ULQ0 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
STRIP2Q9ULQ0 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
STRIP2Q9ULQ0 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
STRIP2Q9ULQ0 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
STRIP2Q9ULQ0 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
STRIP2Q9ULQ0 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
STRIP2Q9ULQ0 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
STRIP2Q9ULQ0 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
STRIP2Q9ULQ0 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
STRIP2Q9ULQ0 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
STRIP2Q9ULQ0 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
STRIP2Q9ULQ0 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
STRIP2Q9ULQ0 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
STRIP2Q9ULQ0 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
STRIP2Q9ULQ0 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
STRIP2Q9ULQ0 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
STRIP2Q9ULQ0 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
STRIP2Q9ULQ0 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
STRIP2Q9ULQ0 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
STRIP2Q9ULQ0 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
STRIP2Q9ULQ0 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
STRIP2Q9ULQ0 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
STRIP2Q9ULQ0 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
STRIP2Q9ULQ0 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
STRIP2Q9ULQ0 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
STRIP2Q9ULQ0 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
STRIP2Q9ULQ0 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
STRIP2Q9ULQ0 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.4 ms