Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J3

KLHL9, Kelch-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL9Q9P2J3 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KLHL9Q9P2J3 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KLHL9Q9P2J3 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KLHL9Q9P2J3 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KLHL9Q9P2J3 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KLHL9Q9P2J3 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KLHL9Q9P2J3 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KLHL9Q9P2J3 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
KLHL9Q9P2J3 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KLHL9Q9P2J3 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KLHL9Q9P2J3 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KLHL9Q9P2J3 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KLHL9Q9P2J3 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KLHL9Q9P2J3 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KLHL9Q9P2J3 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KLHL9Q9P2J3 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KLHL9Q9P2J3 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KLHL9Q9P2J3 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KLHL9Q9P2J3 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KLHL9Q9P2J3 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KLHL9Q9P2J3 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KLHL9Q9P2J3 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KLHL9Q9P2J3 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KLHL9Q9P2J3 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KLHL9Q9P2J3 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KLHL9Q9P2J3 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KLHL9Q9P2J3 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KLHL9Q9P2J3 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KLHL9Q9P2J3 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KLHL9Q9P2J3 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KLHL9Q9P2J3 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
KLHL9Q9P2J3 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
KLHL9Q9P2J3 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KLHL9Q9P2J3 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KLHL9Q9P2J3 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KLHL9Q9P2J3 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KLHL9Q9P2J3 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KLHL9Q9P2J3 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KLHL9Q9P2J3 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KLHL9Q9P2J3 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KLHL9Q9P2J3 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KLHL9Q9P2J3 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KLHL9Q9P2J3 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KLHL9Q9P2J3 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KLHL9Q9P2J3 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KLHL9Q9P2J3 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KLHL9Q9P2J3 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KLHL9Q9P2J3 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
KLHL9Q9P2J3 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KLHL9Q9P2J3 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KLHL9Q9P2J3 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KLHL9Q9P2J3 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
KLHL9Q9P2J3 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KLHL9Q9P2J3 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KLHL9Q9P2J3 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KLHL9Q9P2J3 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
KLHL9Q9P2J3 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KLHL9Q9P2J3 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KLHL9Q9P2J3 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
KLHL9Q9P2J3 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KLHL9Q9P2J3 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KLHL9Q9P2J3 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KLHL9Q9P2J3 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KLHL9Q9P2J3 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KLHL9Q9P2J3 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KLHL9Q9P2J3 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KLHL9Q9P2J3 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KLHL9Q9P2J3 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KLHL9Q9P2J3 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
KLHL9Q9P2J3 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KLHL9Q9P2J3 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KLHL9Q9P2J3 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KLHL9Q9P2J3 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KLHL9Q9P2J3 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KLHL9Q9P2J3 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KLHL9Q9P2J3 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KLHL9Q9P2J3 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KLHL9Q9P2J3 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KLHL9Q9P2J3 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KLHL9Q9P2J3 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KLHL9Q9P2J3 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KLHL9Q9P2J3 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KLHL9Q9P2J3 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KLHL9Q9P2J3 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KLHL9Q9P2J3 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KLHL9Q9P2J3 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KLHL9Q9P2J3 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KLHL9Q9P2J3 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KLHL9Q9P2J3 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KLHL9Q9P2J3 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KLHL9Q9P2J3 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KLHL9Q9P2J3 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KLHL9Q9P2J3 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KLHL9Q9P2J3 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KLHL9Q9P2J3 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
KLHL9Q9P2J3 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KLHL9Q9P2J3 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KLHL9Q9P2J3 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KLHL9Q9P2J3 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KLHL9Q9P2J3 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms