Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVU0

POLR3E, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC5, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3EQ9NVU0 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.69■■■□□ 2.66
POLR3EQ9NVU0 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC31.69■■■□□ 2.66
POLR3EQ9NVU0 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
POLR3EQ9NVU0 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
POLR3EQ9NVU0 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
POLR3EQ9NVU0 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
POLR3EQ9NVU0 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
POLR3EQ9NVU0 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC31.66■■■□□ 2.66
POLR3EQ9NVU0 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
POLR3EQ9NVU0 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
POLR3EQ9NVU0 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
POLR3EQ9NVU0 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
POLR3EQ9NVU0 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC31.64■■■□□ 2.66
POLR3EQ9NVU0 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
POLR3EQ9NVU0 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
POLR3EQ9NVU0 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
POLR3EQ9NVU0 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
POLR3EQ9NVU0 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC31.58■■■□□ 2.65
POLR3EQ9NVU0 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
POLR3EQ9NVU0 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
POLR3EQ9NVU0 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
POLR3EQ9NVU0 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
POLR3EQ9NVU0 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
POLR3EQ9NVU0 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
POLR3EQ9NVU0 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
POLR3EQ9NVU0 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
POLR3EQ9NVU0 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC31.52■■■□□ 2.64
POLR3EQ9NVU0 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.64
POLR3EQ9NVU0 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.63
POLR3EQ9NVU0 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
POLR3EQ9NVU0 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
POLR3EQ9NVU0 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
POLR3EQ9NVU0 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
POLR3EQ9NVU0 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
POLR3EQ9NVU0 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC31.48■■■□□ 2.63
POLR3EQ9NVU0 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
POLR3EQ9NVU0 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
POLR3EQ9NVU0 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC31.47■■■□□ 2.63
POLR3EQ9NVU0 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
POLR3EQ9NVU0 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC31.46■■■□□ 2.63
POLR3EQ9NVU0 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC31.44■■■□□ 2.62
POLR3EQ9NVU0 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
POLR3EQ9NVU0 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
POLR3EQ9NVU0 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
POLR3EQ9NVU0 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC31.39■■■□□ 2.62
POLR3EQ9NVU0 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
POLR3EQ9NVU0 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
POLR3EQ9NVU0 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.37■■■□□ 2.61
POLR3EQ9NVU0 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
POLR3EQ9NVU0 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC31.36■■■□□ 2.61
POLR3EQ9NVU0 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC31.35■■■□□ 2.61
POLR3EQ9NVU0 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
POLR3EQ9NVU0 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC31.32■■■□□ 2.6
POLR3EQ9NVU0 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
POLR3EQ9NVU0 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
POLR3EQ9NVU0 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC31.3■■■□□ 2.6
POLR3EQ9NVU0 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
POLR3EQ9NVU0 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC31.29■■■□□ 2.6
POLR3EQ9NVU0 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
POLR3EQ9NVU0 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
POLR3EQ9NVU0 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
POLR3EQ9NVU0 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
POLR3EQ9NVU0 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
POLR3EQ9NVU0 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
POLR3EQ9NVU0 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC31.27■■■□□ 2.6
POLR3EQ9NVU0 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
POLR3EQ9NVU0 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC31.26■■■□□ 2.6
POLR3EQ9NVU0 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC31.26■■■□□ 2.59
POLR3EQ9NVU0 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.26■■■□□ 2.59
POLR3EQ9NVU0 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
POLR3EQ9NVU0 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC31.24■■■□□ 2.59
POLR3EQ9NVU0 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
POLR3EQ9NVU0 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
POLR3EQ9NVU0 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
POLR3EQ9NVU0 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
POLR3EQ9NVU0 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
POLR3EQ9NVU0 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
POLR3EQ9NVU0 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
POLR3EQ9NVU0 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
POLR3EQ9NVU0 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
POLR3EQ9NVU0 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
POLR3EQ9NVU0 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
POLR3EQ9NVU0 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC31.2■■■□□ 2.59
POLR3EQ9NVU0 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
POLR3EQ9NVU0 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
POLR3EQ9NVU0 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC31.16■■■□□ 2.58
POLR3EQ9NVU0 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
POLR3EQ9NVU0 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
POLR3EQ9NVU0 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
POLR3EQ9NVU0 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC31.12■■■□□ 2.57
POLR3EQ9NVU0 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
POLR3EQ9NVU0 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
POLR3EQ9NVU0 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
POLR3EQ9NVU0 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
POLR3EQ9NVU0 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
POLR3EQ9NVU0 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
POLR3EQ9NVU0 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
POLR3EQ9NVU0 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
POLR3EQ9NVU0 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
POLR3EQ9NVU0 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.7 ms