Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRA2

SLC17A5, Sialin, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC17A5Q9NRA2 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC17A5Q9NRA2 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC17A5Q9NRA2 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC17A5Q9NRA2 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC17A5Q9NRA2 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC17A5Q9NRA2 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC17A5Q9NRA2 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC17A5Q9NRA2 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC17A5Q9NRA2 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC17A5Q9NRA2 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC17A5Q9NRA2 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC17A5Q9NRA2 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC17A5Q9NRA2 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC17A5Q9NRA2 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC17A5Q9NRA2 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC17A5Q9NRA2 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC17A5Q9NRA2 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SLC17A5Q9NRA2 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC17A5Q9NRA2 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC17A5Q9NRA2 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC17A5Q9NRA2 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC17A5Q9NRA2 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC17A5Q9NRA2 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC17A5Q9NRA2 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC17A5Q9NRA2 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC17A5Q9NRA2 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC17A5Q9NRA2 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC17A5Q9NRA2 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC17A5Q9NRA2 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC17A5Q9NRA2 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC17A5Q9NRA2 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC17A5Q9NRA2 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC17A5Q9NRA2 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC17A5Q9NRA2 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SLC17A5Q9NRA2 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SLC17A5Q9NRA2 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC17A5Q9NRA2 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC17A5Q9NRA2 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC17A5Q9NRA2 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC17A5Q9NRA2 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC17A5Q9NRA2 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC17A5Q9NRA2 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC17A5Q9NRA2 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC17A5Q9NRA2 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SLC17A5Q9NRA2 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC17A5Q9NRA2 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC17A5Q9NRA2 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC17A5Q9NRA2 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC17A5Q9NRA2 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC17A5Q9NRA2 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC17A5Q9NRA2 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC17A5Q9NRA2 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC17A5Q9NRA2 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC17A5Q9NRA2 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC17A5Q9NRA2 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC17A5Q9NRA2 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC17A5Q9NRA2 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC17A5Q9NRA2 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC17A5Q9NRA2 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC17A5Q9NRA2 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC17A5Q9NRA2 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC17A5Q9NRA2 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC17A5Q9NRA2 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC17A5Q9NRA2 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC17A5Q9NRA2 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC17A5Q9NRA2 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC17A5Q9NRA2 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC17A5Q9NRA2 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC17A5Q9NRA2 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC17A5Q9NRA2 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC17A5Q9NRA2 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SLC17A5Q9NRA2 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC17A5Q9NRA2 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC17A5Q9NRA2 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC17A5Q9NRA2 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC17A5Q9NRA2 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC17A5Q9NRA2 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC17A5Q9NRA2 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC17A5Q9NRA2 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC17A5Q9NRA2 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC17A5Q9NRA2 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC17A5Q9NRA2 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC17A5Q9NRA2 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC17A5Q9NRA2 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC17A5Q9NRA2 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC17A5Q9NRA2 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC17A5Q9NRA2 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC17A5Q9NRA2 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC17A5Q9NRA2 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC17A5Q9NRA2 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC17A5Q9NRA2 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC17A5Q9NRA2 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC17A5Q9NRA2 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC17A5Q9NRA2 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC17A5Q9NRA2 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC17A5Q9NRA2 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC17A5Q9NRA2 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC17A5Q9NRA2 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC17A5Q9NRA2 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC17A5Q9NRA2 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms