Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR31

SAR1A, GTP-binding protein SAR1a, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAR1AQ9NR31 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SAR1AQ9NR31 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SAR1AQ9NR31 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SAR1AQ9NR31 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SAR1AQ9NR31 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SAR1AQ9NR31 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SAR1AQ9NR31 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SAR1AQ9NR31 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SAR1AQ9NR31 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SAR1AQ9NR31 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SAR1AQ9NR31 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SAR1AQ9NR31 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SAR1AQ9NR31 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
SAR1AQ9NR31 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SAR1AQ9NR31 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SAR1AQ9NR31 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SAR1AQ9NR31 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SAR1AQ9NR31 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SAR1AQ9NR31 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SAR1AQ9NR31 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SAR1AQ9NR31 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SAR1AQ9NR31 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SAR1AQ9NR31 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SAR1AQ9NR31 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SAR1AQ9NR31 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SAR1AQ9NR31 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SAR1AQ9NR31 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SAR1AQ9NR31 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SAR1AQ9NR31 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SAR1AQ9NR31 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SAR1AQ9NR31 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
SAR1AQ9NR31 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.83
SAR1AQ9NR31 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SAR1AQ9NR31 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SAR1AQ9NR31 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SAR1AQ9NR31 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SAR1AQ9NR31 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SAR1AQ9NR31 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SAR1AQ9NR31 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SAR1AQ9NR31 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SAR1AQ9NR31 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SAR1AQ9NR31 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SAR1AQ9NR31 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SAR1AQ9NR31 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
SAR1AQ9NR31 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SAR1AQ9NR31 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SAR1AQ9NR31 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SAR1AQ9NR31 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SAR1AQ9NR31 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SAR1AQ9NR31 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SAR1AQ9NR31 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SAR1AQ9NR31 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SAR1AQ9NR31 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SAR1AQ9NR31 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SAR1AQ9NR31 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SAR1AQ9NR31 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SAR1AQ9NR31 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SAR1AQ9NR31 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SAR1AQ9NR31 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SAR1AQ9NR31 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SAR1AQ9NR31 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
SAR1AQ9NR31 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SAR1AQ9NR31 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SAR1AQ9NR31 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SAR1AQ9NR31 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
SAR1AQ9NR31 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SAR1AQ9NR31 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SAR1AQ9NR31 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SAR1AQ9NR31 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SAR1AQ9NR31 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SAR1AQ9NR31 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SAR1AQ9NR31 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SAR1AQ9NR31 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SAR1AQ9NR31 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SAR1AQ9NR31 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SAR1AQ9NR31 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SAR1AQ9NR31 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SAR1AQ9NR31 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SAR1AQ9NR31 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SAR1AQ9NR31 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SAR1AQ9NR31 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SAR1AQ9NR31 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SAR1AQ9NR31 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SAR1AQ9NR31 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SAR1AQ9NR31 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SAR1AQ9NR31 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SAR1AQ9NR31 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SAR1AQ9NR31 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SAR1AQ9NR31 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SAR1AQ9NR31 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SAR1AQ9NR31 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SAR1AQ9NR31 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SAR1AQ9NR31 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SAR1AQ9NR31 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SAR1AQ9NR31 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SAR1AQ9NR31 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SAR1AQ9NR31 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SAR1AQ9NR31 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SAR1AQ9NR31 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SAR1AQ9NR31 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms