Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2C1

LHX5, LIM/homeobox protein Lhx5, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX5Q9H2C1 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
LHX5Q9H2C1 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
LHX5Q9H2C1 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
LHX5Q9H2C1 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
LHX5Q9H2C1 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
LHX5Q9H2C1 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
LHX5Q9H2C1 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
LHX5Q9H2C1 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
LHX5Q9H2C1 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
LHX5Q9H2C1 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
LHX5Q9H2C1 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
LHX5Q9H2C1 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
LHX5Q9H2C1 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
LHX5Q9H2C1 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
LHX5Q9H2C1 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
LHX5Q9H2C1 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
LHX5Q9H2C1 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
LHX5Q9H2C1 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
LHX5Q9H2C1 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
LHX5Q9H2C1 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
LHX5Q9H2C1 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
LHX5Q9H2C1 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
LHX5Q9H2C1 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
LHX5Q9H2C1 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
LHX5Q9H2C1 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
LHX5Q9H2C1 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
LHX5Q9H2C1 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
LHX5Q9H2C1 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
LHX5Q9H2C1 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
LHX5Q9H2C1 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
LHX5Q9H2C1 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
LHX5Q9H2C1 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
LHX5Q9H2C1 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
LHX5Q9H2C1 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
LHX5Q9H2C1 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
LHX5Q9H2C1 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
LHX5Q9H2C1 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
LHX5Q9H2C1 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
LHX5Q9H2C1 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
LHX5Q9H2C1 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
LHX5Q9H2C1 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
LHX5Q9H2C1 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
LHX5Q9H2C1 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
LHX5Q9H2C1 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
LHX5Q9H2C1 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
LHX5Q9H2C1 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
LHX5Q9H2C1 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
LHX5Q9H2C1 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
LHX5Q9H2C1 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
LHX5Q9H2C1 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
LHX5Q9H2C1 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
LHX5Q9H2C1 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
LHX5Q9H2C1 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
LHX5Q9H2C1 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.51■■■□□ 2.16
LHX5Q9H2C1 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
LHX5Q9H2C1 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
LHX5Q9H2C1 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
LHX5Q9H2C1 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
LHX5Q9H2C1 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
LHX5Q9H2C1 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
LHX5Q9H2C1 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
LHX5Q9H2C1 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
LHX5Q9H2C1 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
LHX5Q9H2C1 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
LHX5Q9H2C1 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
LHX5Q9H2C1 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
LHX5Q9H2C1 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
LHX5Q9H2C1 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
LHX5Q9H2C1 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
LHX5Q9H2C1 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
LHX5Q9H2C1 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
LHX5Q9H2C1 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
LHX5Q9H2C1 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
LHX5Q9H2C1 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
LHX5Q9H2C1 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
LHX5Q9H2C1 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
LHX5Q9H2C1 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
LHX5Q9H2C1 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
LHX5Q9H2C1 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
LHX5Q9H2C1 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
LHX5Q9H2C1 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
LHX5Q9H2C1 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
LHX5Q9H2C1 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
LHX5Q9H2C1 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
LHX5Q9H2C1 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
LHX5Q9H2C1 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
LHX5Q9H2C1 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
LHX5Q9H2C1 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
LHX5Q9H2C1 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
LHX5Q9H2C1 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
LHX5Q9H2C1 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
LHX5Q9H2C1 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
LHX5Q9H2C1 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
LHX5Q9H2C1 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
LHX5Q9H2C1 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
LHX5Q9H2C1 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
LHX5Q9H2C1 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
LHX5Q9H2C1 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
LHX5Q9H2C1 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
LHX5Q9H2C1 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.4 ms