Protein–RNA interactions for Protein: Q9H1A4

ANAPC1, Anaphase-promoting complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,944 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANAPC1Q9H1A4 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ANAPC1Q9H1A4 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
ANAPC1Q9H1A4 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.45■■■□□ 2.14
ANAPC1Q9H1A4 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
ANAPC1Q9H1A4 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ANAPC1Q9H1A4 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ANAPC1Q9H1A4 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ANAPC1Q9H1A4 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ANAPC1Q9H1A4 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
ANAPC1Q9H1A4 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ANAPC1Q9H1A4 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ANAPC1Q9H1A4 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ANAPC1Q9H1A4 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ANAPC1Q9H1A4 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ANAPC1Q9H1A4 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ANAPC1Q9H1A4 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ANAPC1Q9H1A4 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ANAPC1Q9H1A4 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ANAPC1Q9H1A4 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ANAPC1Q9H1A4 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
ANAPC1Q9H1A4 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ANAPC1Q9H1A4 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ANAPC1Q9H1A4 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ANAPC1Q9H1A4 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ANAPC1Q9H1A4 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ANAPC1Q9H1A4 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
ANAPC1Q9H1A4 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ANAPC1Q9H1A4 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ANAPC1Q9H1A4 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ANAPC1Q9H1A4 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ANAPC1Q9H1A4 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ANAPC1Q9H1A4 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ANAPC1Q9H1A4 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ANAPC1Q9H1A4 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ANAPC1Q9H1A4 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ANAPC1Q9H1A4 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ANAPC1Q9H1A4 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ANAPC1Q9H1A4 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ANAPC1Q9H1A4 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ANAPC1Q9H1A4 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ANAPC1Q9H1A4 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ANAPC1Q9H1A4 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ANAPC1Q9H1A4 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
ANAPC1Q9H1A4 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ANAPC1Q9H1A4 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ANAPC1Q9H1A4 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ANAPC1Q9H1A4 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ANAPC1Q9H1A4 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ANAPC1Q9H1A4 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ANAPC1Q9H1A4 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ANAPC1Q9H1A4 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ANAPC1Q9H1A4 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
ANAPC1Q9H1A4 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
ANAPC1Q9H1A4 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
ANAPC1Q9H1A4 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
ANAPC1Q9H1A4 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ANAPC1Q9H1A4 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ANAPC1Q9H1A4 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ANAPC1Q9H1A4 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ANAPC1Q9H1A4 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ANAPC1Q9H1A4 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ANAPC1Q9H1A4 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ANAPC1Q9H1A4 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ANAPC1Q9H1A4 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ANAPC1Q9H1A4 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ANAPC1Q9H1A4 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
ANAPC1Q9H1A4 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.09
ANAPC1Q9H1A4 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ANAPC1Q9H1A4 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ANAPC1Q9H1A4 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ANAPC1Q9H1A4 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ANAPC1Q9H1A4 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ANAPC1Q9H1A4 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ANAPC1Q9H1A4 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ANAPC1Q9H1A4 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ANAPC1Q9H1A4 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ANAPC1Q9H1A4 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ANAPC1Q9H1A4 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ANAPC1Q9H1A4 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ANAPC1Q9H1A4 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ANAPC1Q9H1A4 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ANAPC1Q9H1A4 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ANAPC1Q9H1A4 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ANAPC1Q9H1A4 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ANAPC1Q9H1A4 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ANAPC1Q9H1A4 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ANAPC1Q9H1A4 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ANAPC1Q9H1A4 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ANAPC1Q9H1A4 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ANAPC1Q9H1A4 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ANAPC1Q9H1A4 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ANAPC1Q9H1A4 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ANAPC1Q9H1A4 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ANAPC1Q9H1A4 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ANAPC1Q9H1A4 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ANAPC1Q9H1A4 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ANAPC1Q9H1A4 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ANAPC1Q9H1A4 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ANAPC1Q9H1A4 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ANAPC1Q9H1A4 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms