Protein–RNA interactions for Protein: Q9C002

NMES1, Normal mucosa of esophagus-specific gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMES1Q9C002 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NMES1Q9C002 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NMES1Q9C002 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NMES1Q9C002 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NMES1Q9C002 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NMES1Q9C002 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NMES1Q9C002 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NMES1Q9C002 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NMES1Q9C002 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NMES1Q9C002 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NMES1Q9C002 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NMES1Q9C002 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NMES1Q9C002 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NMES1Q9C002 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NMES1Q9C002 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NMES1Q9C002 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NMES1Q9C002 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NMES1Q9C002 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NMES1Q9C002 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NMES1Q9C002 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NMES1Q9C002 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NMES1Q9C002 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NMES1Q9C002 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NMES1Q9C002 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NMES1Q9C002 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NMES1Q9C002 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NMES1Q9C002 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NMES1Q9C002 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NMES1Q9C002 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NMES1Q9C002 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NMES1Q9C002 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NMES1Q9C002 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NMES1Q9C002 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NMES1Q9C002 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NMES1Q9C002 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NMES1Q9C002 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NMES1Q9C002 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NMES1Q9C002 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NMES1Q9C002 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NMES1Q9C002 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NMES1Q9C002 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NMES1Q9C002 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NMES1Q9C002 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NMES1Q9C002 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NMES1Q9C002 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NMES1Q9C002 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NMES1Q9C002 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
NMES1Q9C002 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NMES1Q9C002 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NMES1Q9C002 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NMES1Q9C002 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NMES1Q9C002 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NMES1Q9C002 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NMES1Q9C002 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NMES1Q9C002 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NMES1Q9C002 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NMES1Q9C002 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NMES1Q9C002 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NMES1Q9C002 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NMES1Q9C002 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NMES1Q9C002 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
NMES1Q9C002 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NMES1Q9C002 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NMES1Q9C002 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NMES1Q9C002 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NMES1Q9C002 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NMES1Q9C002 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NMES1Q9C002 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NMES1Q9C002 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NMES1Q9C002 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NMES1Q9C002 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NMES1Q9C002 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NMES1Q9C002 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NMES1Q9C002 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NMES1Q9C002 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NMES1Q9C002 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NMES1Q9C002 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NMES1Q9C002 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NMES1Q9C002 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NMES1Q9C002 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NMES1Q9C002 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NMES1Q9C002 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NMES1Q9C002 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NMES1Q9C002 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NMES1Q9C002 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NMES1Q9C002 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NMES1Q9C002 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NMES1Q9C002 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NMES1Q9C002 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NMES1Q9C002 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NMES1Q9C002 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NMES1Q9C002 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NMES1Q9C002 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NMES1Q9C002 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NMES1Q9C002 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NMES1Q9C002 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NMES1Q9C002 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NMES1Q9C002 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NMES1Q9C002 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NMES1Q9C002 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 119.9 ms