Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYE9

CDHR2, Cadherin-related family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDHR2Q9BYE9 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
CDHR2Q9BYE9 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
CDHR2Q9BYE9 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
CDHR2Q9BYE9 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
CDHR2Q9BYE9 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
CDHR2Q9BYE9 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
CDHR2Q9BYE9 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC34.17■■■■□ 3.06
CDHR2Q9BYE9 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
CDHR2Q9BYE9 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
CDHR2Q9BYE9 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
CDHR2Q9BYE9 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
CDHR2Q9BYE9 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
CDHR2Q9BYE9 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
CDHR2Q9BYE9 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
CDHR2Q9BYE9 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
CDHR2Q9BYE9 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
CDHR2Q9BYE9 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
CDHR2Q9BYE9 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
CDHR2Q9BYE9 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC34.13■■■■□ 3.05
CDHR2Q9BYE9 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC34.13■■■■□ 3.05
CDHR2Q9BYE9 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
CDHR2Q9BYE9 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
CDHR2Q9BYE9 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
CDHR2Q9BYE9 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
CDHR2Q9BYE9 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
CDHR2Q9BYE9 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
CDHR2Q9BYE9 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
CDHR2Q9BYE9 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC34.08■■■■□ 3.05
CDHR2Q9BYE9 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
CDHR2Q9BYE9 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
CDHR2Q9BYE9 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
CDHR2Q9BYE9 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
CDHR2Q9BYE9 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
CDHR2Q9BYE9 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
CDHR2Q9BYE9 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC34.04■■■■□ 3.04
CDHR2Q9BYE9 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
CDHR2Q9BYE9 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
CDHR2Q9BYE9 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
CDHR2Q9BYE9 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
CDHR2Q9BYE9 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
CDHR2Q9BYE9 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
CDHR2Q9BYE9 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
CDHR2Q9BYE9 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC33.96■■■■□ 3.03
CDHR2Q9BYE9 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
CDHR2Q9BYE9 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
CDHR2Q9BYE9 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
CDHR2Q9BYE9 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
CDHR2Q9BYE9 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
CDHR2Q9BYE9 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
CDHR2Q9BYE9 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
CDHR2Q9BYE9 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
CDHR2Q9BYE9 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
CDHR2Q9BYE9 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
CDHR2Q9BYE9 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
CDHR2Q9BYE9 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
CDHR2Q9BYE9 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
CDHR2Q9BYE9 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
CDHR2Q9BYE9 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
CDHR2Q9BYE9 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
CDHR2Q9BYE9 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC33.82■■■■□ 3.01
CDHR2Q9BYE9 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC33.81■■■■□ 3
CDHR2Q9BYE9 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
CDHR2Q9BYE9 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
CDHR2Q9BYE9 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC33.81■■■■□ 3
CDHR2Q9BYE9 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
CDHR2Q9BYE9 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
CDHR2Q9BYE9 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
CDHR2Q9BYE9 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.79■■■■□ 3
CDHR2Q9BYE9 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
CDHR2Q9BYE9 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
CDHR2Q9BYE9 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
CDHR2Q9BYE9 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC33.76■■■□□ 2.99
CDHR2Q9BYE9 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
CDHR2Q9BYE9 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
CDHR2Q9BYE9 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
CDHR2Q9BYE9 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
CDHR2Q9BYE9 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
CDHR2Q9BYE9 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
CDHR2Q9BYE9 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
CDHR2Q9BYE9 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
CDHR2Q9BYE9 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
CDHR2Q9BYE9 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
CDHR2Q9BYE9 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
CDHR2Q9BYE9 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC33.71■■■□□ 2.99
CDHR2Q9BYE9 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
CDHR2Q9BYE9 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC33.7■■■□□ 2.99
CDHR2Q9BYE9 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC33.69■■■□□ 2.98
CDHR2Q9BYE9 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
CDHR2Q9BYE9 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC33.68■■■□□ 2.98
CDHR2Q9BYE9 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
CDHR2Q9BYE9 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.67■■■□□ 2.98
CDHR2Q9BYE9 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
CDHR2Q9BYE9 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
CDHR2Q9BYE9 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
CDHR2Q9BYE9 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
CDHR2Q9BYE9 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
CDHR2Q9BYE9 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
CDHR2Q9BYE9 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
CDHR2Q9BYE9 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
CDHR2Q9BYE9 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms