Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXF3

CECR2, Cat eye syndrome critical region protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CECR2Q9BXF3 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC51.29■■■■■ 5.8
CECR2Q9BXF3 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC51.27■■■■■ 5.8
CECR2Q9BXF3 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC51.25■■■■■ 5.79
CECR2Q9BXF3 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.23■■■■■ 5.79
CECR2Q9BXF3 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.22■■■■■ 5.79
CECR2Q9BXF3 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC51.19■■■■■ 5.79
CECR2Q9BXF3 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC51.19■■■■■ 5.79
CECR2Q9BXF3 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC51.18■■■■■ 5.78
CECR2Q9BXF3 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC51.17■■■■■ 5.78
CECR2Q9BXF3 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.14■■■■■ 5.78
CECR2Q9BXF3 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC51.14■■■■■ 5.78
CECR2Q9BXF3 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC51.11■■■■■ 5.77
CECR2Q9BXF3 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC51.09■■■■■ 5.77
CECR2Q9BXF3 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC51.08■■■■■ 5.77
CECR2Q9BXF3 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.07■■■■■ 5.77
CECR2Q9BXF3 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC51.04■■■■■ 5.76
CECR2Q9BXF3 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC51.02■■■■■ 5.76
CECR2Q9BXF3 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC51.02■■■■■ 5.76
CECR2Q9BXF3 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC51■■■■■ 5.75
CECR2Q9BXF3 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC50.98■■■■■ 5.75
CECR2Q9BXF3 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.97■■■■■ 5.75
CECR2Q9BXF3 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC50.97■■■■■ 5.75
CECR2Q9BXF3 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC50.97■■■■■ 5.75
CECR2Q9BXF3 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.97■■■■■ 5.75
CECR2Q9BXF3 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.93■■■■■ 5.74
CECR2Q9BXF3 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.93■■■■■ 5.74
CECR2Q9BXF3 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC50.91■■■■■ 5.74
CECR2Q9BXF3 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.91■■■■■ 5.74
CECR2Q9BXF3 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC50.9■■■■■ 5.74
CECR2Q9BXF3 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.89■■■■■ 5.74
CECR2Q9BXF3 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.89■■■■■ 5.74
CECR2Q9BXF3 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC50.88■■■■■ 5.74
CECR2Q9BXF3 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC50.87■■■■■ 5.73
CECR2Q9BXF3 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC50.87■■■■■ 5.73
CECR2Q9BXF3 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.86■■■■■ 5.73
CECR2Q9BXF3 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC50.86■■■■■ 5.73
CECR2Q9BXF3 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC50.85■■■■■ 5.73
CECR2Q9BXF3 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC50.85■■■■■ 5.73
CECR2Q9BXF3 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.84■■■■■ 5.73
CECR2Q9BXF3 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.83■■■■■ 5.73
CECR2Q9BXF3 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC50.82■■■■■ 5.73
CECR2Q9BXF3 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.82■■■■■ 5.73
CECR2Q9BXF3 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC50.81■■■■■ 5.72
CECR2Q9BXF3 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC50.81■■■■■ 5.72
CECR2Q9BXF3 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC50.81■■■■■ 5.72
CECR2Q9BXF3 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC50.79■■■■■ 5.72
CECR2Q9BXF3 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC50.78■■■■■ 5.72
CECR2Q9BXF3 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.76■■■■■ 5.72
CECR2Q9BXF3 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC50.76■■■■■ 5.72
CECR2Q9BXF3 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.72■■■■■ 5.71
CECR2Q9BXF3 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC50.72■■■■■ 5.71
CECR2Q9BXF3 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.71■■■■■ 5.71
CECR2Q9BXF3 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC50.71■■■■■ 5.71
CECR2Q9BXF3 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC50.71■■■■■ 5.71
CECR2Q9BXF3 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC50.7■■■■■ 5.71
CECR2Q9BXF3 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC50.7■■■■■ 5.71
CECR2Q9BXF3 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC50.67■■■■■ 5.7
CECR2Q9BXF3 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC50.63■■■■■ 5.7
CECR2Q9BXF3 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC50.62■■■■■ 5.69
CECR2Q9BXF3 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC50.62■■■■■ 5.69
CECR2Q9BXF3 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC50.62■■■■■ 5.69
CECR2Q9BXF3 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC50.6■■■■■ 5.69
CECR2Q9BXF3 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC50.6■■■■■ 5.69
CECR2Q9BXF3 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC50.59■■■■■ 5.69
CECR2Q9BXF3 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC50.58■■■■■ 5.69
CECR2Q9BXF3 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC50.57■■■■■ 5.69
CECR2Q9BXF3 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC50.55■■■■■ 5.68
CECR2Q9BXF3 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC50.54■■■■■ 5.68
CECR2Q9BXF3 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC50.54■■■■■ 5.68
CECR2Q9BXF3 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC50.52■■■■■ 5.68
CECR2Q9BXF3 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.52■■■■■ 5.68
CECR2Q9BXF3 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC50.51■■■■■ 5.68
CECR2Q9BXF3 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC50.5■■■■■ 5.68
CECR2Q9BXF3 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC50.49■■■■■ 5.67
CECR2Q9BXF3 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC50.49■■■■■ 5.67
CECR2Q9BXF3 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC50.46■■■■■ 5.67
CECR2Q9BXF3 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.46■■■■■ 5.67
CECR2Q9BXF3 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC50.46■■■■■ 5.67
CECR2Q9BXF3 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC50.44■■■■■ 5.66
CECR2Q9BXF3 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC50.44■■■■■ 5.66
CECR2Q9BXF3 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC50.43■■■■■ 5.66
CECR2Q9BXF3 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC50.43■■■■■ 5.66
CECR2Q9BXF3 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC50.42■■■■■ 5.66
CECR2Q9BXF3 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC50.42■■■■■ 5.66
CECR2Q9BXF3 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC50.4■■■■■ 5.66
CECR2Q9BXF3 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.39■■■■■ 5.66
CECR2Q9BXF3 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.37■■■■■ 5.65
CECR2Q9BXF3 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC50.37■■■■■ 5.65
CECR2Q9BXF3 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC50.36■■■■■ 5.65
CECR2Q9BXF3 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC50.35■■■■■ 5.65
CECR2Q9BXF3 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.33■■■■■ 5.65
CECR2Q9BXF3 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.33■■■■■ 5.65
CECR2Q9BXF3 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC50.33■■■■■ 5.65
CECR2Q9BXF3 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC50.32■■■■■ 5.65
CECR2Q9BXF3 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC50.32■■■■■ 5.65
CECR2Q9BXF3 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC50.3■■■■■ 5.64
CECR2Q9BXF3 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC50.3■■■■■ 5.64
CECR2Q9BXF3 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC50.3■■■■■ 5.64
CECR2Q9BXF3 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC50.29■■■■■ 5.64
CECR2Q9BXF3 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC50.27■■■■■ 5.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms