Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX63

BRIP1, Fanconi anemia group J protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRIP1Q9BX63 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
BRIP1Q9BX63 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC34.5■■■■□ 3.11
BRIP1Q9BX63 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
BRIP1Q9BX63 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
BRIP1Q9BX63 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
BRIP1Q9BX63 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
BRIP1Q9BX63 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
BRIP1Q9BX63 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC34.46■■■■□ 3.11
BRIP1Q9BX63 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC34.46■■■■□ 3.11
BRIP1Q9BX63 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC34.45■■■■□ 3.11
BRIP1Q9BX63 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
BRIP1Q9BX63 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
BRIP1Q9BX63 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC34.43■■■■□ 3.1
BRIP1Q9BX63 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
BRIP1Q9BX63 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
BRIP1Q9BX63 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC34.42■■■■□ 3.1
BRIP1Q9BX63 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
BRIP1Q9BX63 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
BRIP1Q9BX63 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
BRIP1Q9BX63 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC34.4■■■■□ 3.1
BRIP1Q9BX63 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
BRIP1Q9BX63 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
BRIP1Q9BX63 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC34.39■■■■□ 3.1
BRIP1Q9BX63 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
BRIP1Q9BX63 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
BRIP1Q9BX63 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC34.33■■■■□ 3.09
BRIP1Q9BX63 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
BRIP1Q9BX63 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.08
BRIP1Q9BX63 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
BRIP1Q9BX63 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
BRIP1Q9BX63 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
BRIP1Q9BX63 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC34.3■■■■□ 3.08
BRIP1Q9BX63 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
BRIP1Q9BX63 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
BRIP1Q9BX63 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC34.29■■■■□ 3.08
BRIP1Q9BX63 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
BRIP1Q9BX63 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
BRIP1Q9BX63 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
BRIP1Q9BX63 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
BRIP1Q9BX63 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC34.24■■■■□ 3.07
BRIP1Q9BX63 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
BRIP1Q9BX63 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
BRIP1Q9BX63 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
BRIP1Q9BX63 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
BRIP1Q9BX63 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC34.19■■■■□ 3.06
BRIP1Q9BX63 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
BRIP1Q9BX63 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
BRIP1Q9BX63 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
BRIP1Q9BX63 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
BRIP1Q9BX63 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
BRIP1Q9BX63 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC34.16■■■■□ 3.06
BRIP1Q9BX63 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
BRIP1Q9BX63 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
BRIP1Q9BX63 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
BRIP1Q9BX63 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC34.13■■■■□ 3.05
BRIP1Q9BX63 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC34.13■■■■□ 3.05
BRIP1Q9BX63 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
BRIP1Q9BX63 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
BRIP1Q9BX63 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC34.1■■■■□ 3.05
BRIP1Q9BX63 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC34.1■■■■□ 3.05
BRIP1Q9BX63 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
BRIP1Q9BX63 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
BRIP1Q9BX63 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
BRIP1Q9BX63 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
BRIP1Q9BX63 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
BRIP1Q9BX63 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
BRIP1Q9BX63 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
BRIP1Q9BX63 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
BRIP1Q9BX63 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC34.04■■■■□ 3.04
BRIP1Q9BX63 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
BRIP1Q9BX63 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
BRIP1Q9BX63 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
BRIP1Q9BX63 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
BRIP1Q9BX63 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC33.99■■■■□ 3.03
BRIP1Q9BX63 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC33.99■■■■□ 3.03
BRIP1Q9BX63 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
BRIP1Q9BX63 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
BRIP1Q9BX63 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
BRIP1Q9BX63 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC33.95■■■■□ 3.03
BRIP1Q9BX63 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
BRIP1Q9BX63 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
BRIP1Q9BX63 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
BRIP1Q9BX63 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
BRIP1Q9BX63 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
BRIP1Q9BX63 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
BRIP1Q9BX63 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
BRIP1Q9BX63 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
BRIP1Q9BX63 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC33.89■■■■□ 3.02
BRIP1Q9BX63 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
BRIP1Q9BX63 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
BRIP1Q9BX63 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
BRIP1Q9BX63 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC33.86■■■■□ 3.01
BRIP1Q9BX63 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC33.86■■■■□ 3.01
BRIP1Q9BX63 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
BRIP1Q9BX63 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC33.85■■■■□ 3.01
BRIP1Q9BX63 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
BRIP1Q9BX63 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
BRIP1Q9BX63 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
BRIP1Q9BX63 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
BRIP1Q9BX63 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms