Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWC9

CCDC106, Coiled-coil domain-containing protein 106, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC106Q9BWC9 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC106Q9BWC9 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC106Q9BWC9 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC106Q9BWC9 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC106Q9BWC9 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC106Q9BWC9 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC106Q9BWC9 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC106Q9BWC9 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC106Q9BWC9 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC106Q9BWC9 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC106Q9BWC9 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC106Q9BWC9 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC106Q9BWC9 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC106Q9BWC9 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC106Q9BWC9 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC106Q9BWC9 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC106Q9BWC9 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC106Q9BWC9 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC106Q9BWC9 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC106Q9BWC9 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC106Q9BWC9 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC106Q9BWC9 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC106Q9BWC9 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CCDC106Q9BWC9 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC106Q9BWC9 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC106Q9BWC9 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC106Q9BWC9 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC106Q9BWC9 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC106Q9BWC9 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC106Q9BWC9 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC106Q9BWC9 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC106Q9BWC9 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC106Q9BWC9 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC106Q9BWC9 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC106Q9BWC9 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC106Q9BWC9 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC106Q9BWC9 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC106Q9BWC9 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC106Q9BWC9 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC106Q9BWC9 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC106Q9BWC9 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC106Q9BWC9 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC106Q9BWC9 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC106Q9BWC9 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC106Q9BWC9 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC106Q9BWC9 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC106Q9BWC9 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC106Q9BWC9 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC106Q9BWC9 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC106Q9BWC9 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC106Q9BWC9 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC106Q9BWC9 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC106Q9BWC9 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC106Q9BWC9 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC106Q9BWC9 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC106Q9BWC9 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC106Q9BWC9 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC106Q9BWC9 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC106Q9BWC9 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC106Q9BWC9 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC106Q9BWC9 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC106Q9BWC9 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC106Q9BWC9 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC106Q9BWC9 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC106Q9BWC9 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC106Q9BWC9 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC106Q9BWC9 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC106Q9BWC9 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC106Q9BWC9 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC106Q9BWC9 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC106Q9BWC9 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC106Q9BWC9 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC106Q9BWC9 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC106Q9BWC9 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC106Q9BWC9 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC106Q9BWC9 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC106Q9BWC9 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC106Q9BWC9 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
CCDC106Q9BWC9 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC106Q9BWC9 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC106Q9BWC9 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC106Q9BWC9 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC106Q9BWC9 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC106Q9BWC9 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC106Q9BWC9 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC106Q9BWC9 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC106Q9BWC9 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC106Q9BWC9 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC106Q9BWC9 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC106Q9BWC9 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC106Q9BWC9 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC106Q9BWC9 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC106Q9BWC9 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC106Q9BWC9 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC106Q9BWC9 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC106Q9BWC9 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC106Q9BWC9 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC106Q9BWC9 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC106Q9BWC9 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC106Q9BWC9 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms