Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUB5

MKNK1, MAP kinase-interacting serine/threonine-protein kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKNK1Q9BUB5 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
MKNK1Q9BUB5 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
MKNK1Q9BUB5 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
MKNK1Q9BUB5 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
MKNK1Q9BUB5 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
MKNK1Q9BUB5 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
MKNK1Q9BUB5 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
MKNK1Q9BUB5 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
MKNK1Q9BUB5 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
MKNK1Q9BUB5 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
MKNK1Q9BUB5 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
MKNK1Q9BUB5 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
MKNK1Q9BUB5 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
MKNK1Q9BUB5 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
MKNK1Q9BUB5 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
MKNK1Q9BUB5 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
MKNK1Q9BUB5 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
MKNK1Q9BUB5 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
MKNK1Q9BUB5 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
MKNK1Q9BUB5 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
MKNK1Q9BUB5 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
MKNK1Q9BUB5 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
MKNK1Q9BUB5 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
MKNK1Q9BUB5 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
MKNK1Q9BUB5 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
MKNK1Q9BUB5 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
MKNK1Q9BUB5 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
MKNK1Q9BUB5 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
MKNK1Q9BUB5 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
MKNK1Q9BUB5 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
MKNK1Q9BUB5 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
MKNK1Q9BUB5 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
MKNK1Q9BUB5 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
MKNK1Q9BUB5 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
MKNK1Q9BUB5 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
MKNK1Q9BUB5 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
MKNK1Q9BUB5 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
MKNK1Q9BUB5 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
MKNK1Q9BUB5 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
MKNK1Q9BUB5 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
MKNK1Q9BUB5 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
MKNK1Q9BUB5 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
MKNK1Q9BUB5 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
MKNK1Q9BUB5 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
MKNK1Q9BUB5 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
MKNK1Q9BUB5 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC29.49■■■□□ 2.31
MKNK1Q9BUB5 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
MKNK1Q9BUB5 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
MKNK1Q9BUB5 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
MKNK1Q9BUB5 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
MKNK1Q9BUB5 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
MKNK1Q9BUB5 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
MKNK1Q9BUB5 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
MKNK1Q9BUB5 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
MKNK1Q9BUB5 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
MKNK1Q9BUB5 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
MKNK1Q9BUB5 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
MKNK1Q9BUB5 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
MKNK1Q9BUB5 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
MKNK1Q9BUB5 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
MKNK1Q9BUB5 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
MKNK1Q9BUB5 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
MKNK1Q9BUB5 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
MKNK1Q9BUB5 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
MKNK1Q9BUB5 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
MKNK1Q9BUB5 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
MKNK1Q9BUB5 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
MKNK1Q9BUB5 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
MKNK1Q9BUB5 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
MKNK1Q9BUB5 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
MKNK1Q9BUB5 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
MKNK1Q9BUB5 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
MKNK1Q9BUB5 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC29.33■■■□□ 2.29
MKNK1Q9BUB5 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
MKNK1Q9BUB5 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
MKNK1Q9BUB5 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
MKNK1Q9BUB5 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
MKNK1Q9BUB5 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
MKNK1Q9BUB5 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
MKNK1Q9BUB5 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
MKNK1Q9BUB5 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
MKNK1Q9BUB5 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
MKNK1Q9BUB5 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
MKNK1Q9BUB5 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC29.26■■■□□ 2.28
MKNK1Q9BUB5 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
MKNK1Q9BUB5 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
MKNK1Q9BUB5 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
MKNK1Q9BUB5 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
MKNK1Q9BUB5 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
MKNK1Q9BUB5 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
MKNK1Q9BUB5 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC29.24■■■□□ 2.27
MKNK1Q9BUB5 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
MKNK1Q9BUB5 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
MKNK1Q9BUB5 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
MKNK1Q9BUB5 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
MKNK1Q9BUB5 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
MKNK1Q9BUB5 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
MKNK1Q9BUB5 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
MKNK1Q9BUB5 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
MKNK1Q9BUB5 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.8 ms