Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSR8

YIPF4, Protein YIPF4, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YIPF4Q9BSR8 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
YIPF4Q9BSR8 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
YIPF4Q9BSR8 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
YIPF4Q9BSR8 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
YIPF4Q9BSR8 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
YIPF4Q9BSR8 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
YIPF4Q9BSR8 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
YIPF4Q9BSR8 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
YIPF4Q9BSR8 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
YIPF4Q9BSR8 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
YIPF4Q9BSR8 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
YIPF4Q9BSR8 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
YIPF4Q9BSR8 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
YIPF4Q9BSR8 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
YIPF4Q9BSR8 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
YIPF4Q9BSR8 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
YIPF4Q9BSR8 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
YIPF4Q9BSR8 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
YIPF4Q9BSR8 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
YIPF4Q9BSR8 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
YIPF4Q9BSR8 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
YIPF4Q9BSR8 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
YIPF4Q9BSR8 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
YIPF4Q9BSR8 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
YIPF4Q9BSR8 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
YIPF4Q9BSR8 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
YIPF4Q9BSR8 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
YIPF4Q9BSR8 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
YIPF4Q9BSR8 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
YIPF4Q9BSR8 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
YIPF4Q9BSR8 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
YIPF4Q9BSR8 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
YIPF4Q9BSR8 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
YIPF4Q9BSR8 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
YIPF4Q9BSR8 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
YIPF4Q9BSR8 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
YIPF4Q9BSR8 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
YIPF4Q9BSR8 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
YIPF4Q9BSR8 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
YIPF4Q9BSR8 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
YIPF4Q9BSR8 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
YIPF4Q9BSR8 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
YIPF4Q9BSR8 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
YIPF4Q9BSR8 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
YIPF4Q9BSR8 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
YIPF4Q9BSR8 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
YIPF4Q9BSR8 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
YIPF4Q9BSR8 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
YIPF4Q9BSR8 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
YIPF4Q9BSR8 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
YIPF4Q9BSR8 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
YIPF4Q9BSR8 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
YIPF4Q9BSR8 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
YIPF4Q9BSR8 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
YIPF4Q9BSR8 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
YIPF4Q9BSR8 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
YIPF4Q9BSR8 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
YIPF4Q9BSR8 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
YIPF4Q9BSR8 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
YIPF4Q9BSR8 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
YIPF4Q9BSR8 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
YIPF4Q9BSR8 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
YIPF4Q9BSR8 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
YIPF4Q9BSR8 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
YIPF4Q9BSR8 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
YIPF4Q9BSR8 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
YIPF4Q9BSR8 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
YIPF4Q9BSR8 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
YIPF4Q9BSR8 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
YIPF4Q9BSR8 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
YIPF4Q9BSR8 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
YIPF4Q9BSR8 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
YIPF4Q9BSR8 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
YIPF4Q9BSR8 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
YIPF4Q9BSR8 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
YIPF4Q9BSR8 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
YIPF4Q9BSR8 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
YIPF4Q9BSR8 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
YIPF4Q9BSR8 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
YIPF4Q9BSR8 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
YIPF4Q9BSR8 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
YIPF4Q9BSR8 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
YIPF4Q9BSR8 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
YIPF4Q9BSR8 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
YIPF4Q9BSR8 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
YIPF4Q9BSR8 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
YIPF4Q9BSR8 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
YIPF4Q9BSR8 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
YIPF4Q9BSR8 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
YIPF4Q9BSR8 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
YIPF4Q9BSR8 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
YIPF4Q9BSR8 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
YIPF4Q9BSR8 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
YIPF4Q9BSR8 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
YIPF4Q9BSR8 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
YIPF4Q9BSR8 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
YIPF4Q9BSR8 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
YIPF4Q9BSR8 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
YIPF4Q9BSR8 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
YIPF4Q9BSR8 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms