Protein–RNA interactions for Protein: Q96T76

MMS19, MMS19 nucleotide excision repair protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,030 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMS19Q96T76 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
MMS19Q96T76 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
MMS19Q96T76 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
MMS19Q96T76 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
MMS19Q96T76 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
MMS19Q96T76 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
MMS19Q96T76 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
MMS19Q96T76 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
MMS19Q96T76 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
MMS19Q96T76 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
MMS19Q96T76 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
MMS19Q96T76 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
MMS19Q96T76 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
MMS19Q96T76 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
MMS19Q96T76 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
MMS19Q96T76 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
MMS19Q96T76 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
MMS19Q96T76 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
MMS19Q96T76 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
MMS19Q96T76 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
MMS19Q96T76 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
MMS19Q96T76 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
MMS19Q96T76 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
MMS19Q96T76 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
MMS19Q96T76 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
MMS19Q96T76 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
MMS19Q96T76 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
MMS19Q96T76 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
MMS19Q96T76 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
MMS19Q96T76 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
MMS19Q96T76 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
MMS19Q96T76 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
MMS19Q96T76 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
MMS19Q96T76 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
MMS19Q96T76 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
MMS19Q96T76 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
MMS19Q96T76 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
MMS19Q96T76 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
MMS19Q96T76 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
MMS19Q96T76 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
MMS19Q96T76 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
MMS19Q96T76 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
MMS19Q96T76 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
MMS19Q96T76 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
MMS19Q96T76 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
MMS19Q96T76 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
MMS19Q96T76 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
MMS19Q96T76 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
MMS19Q96T76 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
MMS19Q96T76 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
MMS19Q96T76 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
MMS19Q96T76 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
MMS19Q96T76 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
MMS19Q96T76 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
MMS19Q96T76 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
MMS19Q96T76 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
MMS19Q96T76 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
MMS19Q96T76 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
MMS19Q96T76 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
MMS19Q96T76 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
MMS19Q96T76 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
MMS19Q96T76 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
MMS19Q96T76 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
MMS19Q96T76 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
MMS19Q96T76 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
MMS19Q96T76 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
MMS19Q96T76 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
MMS19Q96T76 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
MMS19Q96T76 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
MMS19Q96T76 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
MMS19Q96T76 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
MMS19Q96T76 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
MMS19Q96T76 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
MMS19Q96T76 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
MMS19Q96T76 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
MMS19Q96T76 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
MMS19Q96T76 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
MMS19Q96T76 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
MMS19Q96T76 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
MMS19Q96T76 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
MMS19Q96T76 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
MMS19Q96T76 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
MMS19Q96T76 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
MMS19Q96T76 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
MMS19Q96T76 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
MMS19Q96T76 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
MMS19Q96T76 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
MMS19Q96T76 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
MMS19Q96T76 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
MMS19Q96T76 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
MMS19Q96T76 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
MMS19Q96T76 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
MMS19Q96T76 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
MMS19Q96T76 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
MMS19Q96T76 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
MMS19Q96T76 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
MMS19Q96T76 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
MMS19Q96T76 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
MMS19Q96T76 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
MMS19Q96T76 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.1 ms