Protein–RNA interactions for Protein: Q96NJ6

ZFP3, Zinc finger protein 3 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFP3Q96NJ6 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ZFP3Q96NJ6 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ZFP3Q96NJ6 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ZFP3Q96NJ6 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
ZFP3Q96NJ6 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZFP3Q96NJ6 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
ZFP3Q96NJ6 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZFP3Q96NJ6 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZFP3Q96NJ6 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZFP3Q96NJ6 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZFP3Q96NJ6 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZFP3Q96NJ6 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZFP3Q96NJ6 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZFP3Q96NJ6 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZFP3Q96NJ6 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZFP3Q96NJ6 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZFP3Q96NJ6 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZFP3Q96NJ6 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZFP3Q96NJ6 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZFP3Q96NJ6 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZFP3Q96NJ6 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZFP3Q96NJ6 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZFP3Q96NJ6 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZFP3Q96NJ6 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZFP3Q96NJ6 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZFP3Q96NJ6 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZFP3Q96NJ6 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZFP3Q96NJ6 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZFP3Q96NJ6 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZFP3Q96NJ6 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZFP3Q96NJ6 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
ZFP3Q96NJ6 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZFP3Q96NJ6 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZFP3Q96NJ6 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZFP3Q96NJ6 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
ZFP3Q96NJ6 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZFP3Q96NJ6 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZFP3Q96NJ6 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
ZFP3Q96NJ6 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZFP3Q96NJ6 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZFP3Q96NJ6 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZFP3Q96NJ6 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZFP3Q96NJ6 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZFP3Q96NJ6 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZFP3Q96NJ6 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ZFP3Q96NJ6 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ZFP3Q96NJ6 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ZFP3Q96NJ6 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZFP3Q96NJ6 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZFP3Q96NJ6 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZFP3Q96NJ6 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZFP3Q96NJ6 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
ZFP3Q96NJ6 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZFP3Q96NJ6 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZFP3Q96NJ6 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZFP3Q96NJ6 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZFP3Q96NJ6 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZFP3Q96NJ6 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZFP3Q96NJ6 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZFP3Q96NJ6 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZFP3Q96NJ6 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZFP3Q96NJ6 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
ZFP3Q96NJ6 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZFP3Q96NJ6 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZFP3Q96NJ6 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZFP3Q96NJ6 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZFP3Q96NJ6 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
ZFP3Q96NJ6 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZFP3Q96NJ6 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZFP3Q96NJ6 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
ZFP3Q96NJ6 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZFP3Q96NJ6 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZFP3Q96NJ6 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZFP3Q96NJ6 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZFP3Q96NJ6 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZFP3Q96NJ6 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZFP3Q96NJ6 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZFP3Q96NJ6 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZFP3Q96NJ6 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZFP3Q96NJ6 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZFP3Q96NJ6 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZFP3Q96NJ6 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZFP3Q96NJ6 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZFP3Q96NJ6 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZFP3Q96NJ6 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZFP3Q96NJ6 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZFP3Q96NJ6 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZFP3Q96NJ6 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZFP3Q96NJ6 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZFP3Q96NJ6 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
ZFP3Q96NJ6 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZFP3Q96NJ6 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZFP3Q96NJ6 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZFP3Q96NJ6 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZFP3Q96NJ6 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZFP3Q96NJ6 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZFP3Q96NJ6 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ZFP3Q96NJ6 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZFP3Q96NJ6 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZFP3Q96NJ6 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 161 ms