Protein–RNA interactions for Protein: Q96MU7

YTHDC1, YTH domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDC1Q96MU7 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
YTHDC1Q96MU7 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
YTHDC1Q96MU7 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC37.51■■■■□ 3.6
YTHDC1Q96MU7 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
YTHDC1Q96MU7 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
YTHDC1Q96MU7 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
YTHDC1Q96MU7 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.46■■■■□ 3.59
YTHDC1Q96MU7 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
YTHDC1Q96MU7 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
YTHDC1Q96MU7 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC37.44■■■■□ 3.58
YTHDC1Q96MU7 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
YTHDC1Q96MU7 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.38■■■■□ 3.57
YTHDC1Q96MU7 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
YTHDC1Q96MU7 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC37.37■■■■□ 3.57
YTHDC1Q96MU7 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.36■■■■□ 3.57
YTHDC1Q96MU7 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
YTHDC1Q96MU7 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.34■■■■□ 3.57
YTHDC1Q96MU7 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.57
YTHDC1Q96MU7 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
YTHDC1Q96MU7 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
YTHDC1Q96MU7 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.3■■■■□ 3.56
YTHDC1Q96MU7 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
YTHDC1Q96MU7 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
YTHDC1Q96MU7 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
YTHDC1Q96MU7 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
YTHDC1Q96MU7 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
YTHDC1Q96MU7 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC37.25■■■■□ 3.55
YTHDC1Q96MU7 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC37.25■■■■□ 3.55
YTHDC1Q96MU7 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
YTHDC1Q96MU7 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
YTHDC1Q96MU7 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC37.21■■■■□ 3.55
YTHDC1Q96MU7 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
YTHDC1Q96MU7 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.17■■■■□ 3.54
YTHDC1Q96MU7 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
YTHDC1Q96MU7 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
YTHDC1Q96MU7 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.15■■■■□ 3.54
YTHDC1Q96MU7 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
YTHDC1Q96MU7 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
YTHDC1Q96MU7 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
YTHDC1Q96MU7 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
YTHDC1Q96MU7 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
YTHDC1Q96MU7 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
YTHDC1Q96MU7 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC37.1■■■■□ 3.53
YTHDC1Q96MU7 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
YTHDC1Q96MU7 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
YTHDC1Q96MU7 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC37.06■■■■□ 3.52
YTHDC1Q96MU7 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
YTHDC1Q96MU7 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
YTHDC1Q96MU7 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
YTHDC1Q96MU7 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC36.99■■■■□ 3.51
YTHDC1Q96MU7 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC36.99■■■■□ 3.51
YTHDC1Q96MU7 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC36.99■■■■□ 3.51
YTHDC1Q96MU7 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
YTHDC1Q96MU7 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
YTHDC1Q96MU7 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
YTHDC1Q96MU7 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
YTHDC1Q96MU7 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
YTHDC1Q96MU7 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.97■■■■□ 3.51
YTHDC1Q96MU7 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
YTHDC1Q96MU7 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
YTHDC1Q96MU7 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
YTHDC1Q96MU7 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
YTHDC1Q96MU7 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
YTHDC1Q96MU7 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC36.95■■■■□ 3.51
YTHDC1Q96MU7 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC36.94■■■■□ 3.5
YTHDC1Q96MU7 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
YTHDC1Q96MU7 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
YTHDC1Q96MU7 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
YTHDC1Q96MU7 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
YTHDC1Q96MU7 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
YTHDC1Q96MU7 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.91■■■■□ 3.5
YTHDC1Q96MU7 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
YTHDC1Q96MU7 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC36.9■■■■□ 3.5
YTHDC1Q96MU7 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
YTHDC1Q96MU7 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.9■■■■□ 3.5
YTHDC1Q96MU7 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
YTHDC1Q96MU7 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
YTHDC1Q96MU7 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.9■■■■□ 3.5
YTHDC1Q96MU7 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
YTHDC1Q96MU7 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
YTHDC1Q96MU7 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
YTHDC1Q96MU7 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC36.87■■■■□ 3.49
YTHDC1Q96MU7 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
YTHDC1Q96MU7 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
YTHDC1Q96MU7 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
YTHDC1Q96MU7 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC36.85■■■■□ 3.49
YTHDC1Q96MU7 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.85■■■■□ 3.49
YTHDC1Q96MU7 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC36.85■■■■□ 3.49
YTHDC1Q96MU7 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
YTHDC1Q96MU7 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC36.84■■■■□ 3.49
YTHDC1Q96MU7 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
YTHDC1Q96MU7 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.82■■■■□ 3.48
YTHDC1Q96MU7 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.81■■■■□ 3.48
YTHDC1Q96MU7 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.81■■■■□ 3.48
YTHDC1Q96MU7 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
YTHDC1Q96MU7 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC36.78■■■■□ 3.48
YTHDC1Q96MU7 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC36.77■■■■□ 3.48
YTHDC1Q96MU7 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
YTHDC1Q96MU7 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.76■■■■□ 3.47
YTHDC1Q96MU7 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms