Protein–RNA interactions for Protein: Q96E14

RMI2, RecQ-mediated genome instability protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RMI2Q96E14 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RMI2Q96E14 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
RMI2Q96E14 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RMI2Q96E14 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RMI2Q96E14 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RMI2Q96E14 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RMI2Q96E14 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RMI2Q96E14 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
RMI2Q96E14 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RMI2Q96E14 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RMI2Q96E14 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RMI2Q96E14 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RMI2Q96E14 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RMI2Q96E14 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RMI2Q96E14 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RMI2Q96E14 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RMI2Q96E14 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RMI2Q96E14 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RMI2Q96E14 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RMI2Q96E14 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RMI2Q96E14 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RMI2Q96E14 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RMI2Q96E14 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RMI2Q96E14 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RMI2Q96E14 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RMI2Q96E14 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RMI2Q96E14 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RMI2Q96E14 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RMI2Q96E14 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RMI2Q96E14 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RMI2Q96E14 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
RMI2Q96E14 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RMI2Q96E14 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RMI2Q96E14 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RMI2Q96E14 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RMI2Q96E14 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RMI2Q96E14 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RMI2Q96E14 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RMI2Q96E14 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RMI2Q96E14 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
RMI2Q96E14 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RMI2Q96E14 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RMI2Q96E14 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RMI2Q96E14 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RMI2Q96E14 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
RMI2Q96E14 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RMI2Q96E14 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RMI2Q96E14 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RMI2Q96E14 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RMI2Q96E14 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RMI2Q96E14 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RMI2Q96E14 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RMI2Q96E14 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RMI2Q96E14 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RMI2Q96E14 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RMI2Q96E14 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RMI2Q96E14 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RMI2Q96E14 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RMI2Q96E14 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RMI2Q96E14 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RMI2Q96E14 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RMI2Q96E14 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RMI2Q96E14 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RMI2Q96E14 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RMI2Q96E14 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RMI2Q96E14 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RMI2Q96E14 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RMI2Q96E14 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RMI2Q96E14 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RMI2Q96E14 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RMI2Q96E14 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RMI2Q96E14 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RMI2Q96E14 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RMI2Q96E14 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RMI2Q96E14 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RMI2Q96E14 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RMI2Q96E14 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RMI2Q96E14 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RMI2Q96E14 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RMI2Q96E14 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RMI2Q96E14 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RMI2Q96E14 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RMI2Q96E14 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RMI2Q96E14 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RMI2Q96E14 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RMI2Q96E14 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RMI2Q96E14 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RMI2Q96E14 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC18■□□□□ 0.47
RMI2Q96E14 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RMI2Q96E14 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RMI2Q96E14 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RMI2Q96E14 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RMI2Q96E14 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RMI2Q96E14 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RMI2Q96E14 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RMI2Q96E14 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RMI2Q96E14 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RMI2Q96E14 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RMI2Q96E14 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RMI2Q96E14 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.7 ms